More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2342 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2342  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
219 aa  449  1e-125  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000870082  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  36.79 
 
 
195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  40.64 
 
 
197 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  40.72 
 
 
190 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  42.77 
 
 
182 aa  135  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  42.68 
 
 
187 aa  134  8e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  38.66 
 
 
199 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  39.08 
 
 
193 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  37.5 
 
 
187 aa  125  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  34.86 
 
 
201 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  35.54 
 
 
179 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  39.88 
 
 
214 aa  115  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  34.68 
 
 
731 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  35.96 
 
 
724 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  34.29 
 
 
730 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  34.29 
 
 
730 aa  112  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  34.83 
 
 
735 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  37.13 
 
 
719 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  34.5 
 
 
195 aa  108  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  38.69 
 
 
715 aa  108  6e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  34.83 
 
 
748 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  36.09 
 
 
721 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  32.28 
 
 
188 aa  106  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  33.53 
 
 
729 aa  107  2e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  37.21 
 
 
663 aa  106  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  37.57 
 
 
669 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  36.05 
 
 
166 aa  102  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  30.59 
 
 
798 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  34.71 
 
 
690 aa  100  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  34.3 
 
 
747 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  36.93 
 
 
663 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  31.74 
 
 
709 aa  99.4  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  33.53 
 
 
709 aa  99.4  4e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  40.49 
 
 
685 aa  96.7  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  40.49 
 
 
652 aa  96.7  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  38.51 
 
 
218 aa  95.9  4e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  34.48 
 
 
678 aa  94.4  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  34.78 
 
 
660 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  42 
 
 
712 aa  94.4  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  33.72 
 
 
660 aa  94  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  32.09 
 
 
603 aa  93.6  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  34.73 
 
 
657 aa  94  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  34.73 
 
 
657 aa  93.6  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  40.25 
 
 
677 aa  93.6  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  36.69 
 
 
680 aa  93.6  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  33.53 
 
 
693 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  33.14 
 
 
642 aa  92.8  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  31.84 
 
 
698 aa  92.4  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  29.26 
 
 
181 aa  92.4  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  39.87 
 
 
641 aa  92.4  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  33.76 
 
 
690 aa  92  6e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  39.88 
 
 
645 aa  91.7  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  35.59 
 
 
637 aa  91.7  8e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  38.64 
 
 
756 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  33.92 
 
 
654 aa  91.3  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  35.67 
 
 
750 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  29.26 
 
 
181 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  30.73 
 
 
659 aa  90.9  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  38.61 
 
 
641 aa  90.5  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1603  lytic transglycosylase  35.67 
 
 
830 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.807223  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  38.61 
 
 
641 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  38.61 
 
 
641 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0658  soluble lytic murein transglycosylase precursor  34.43 
 
 
644 aa  90.1  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597018  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  33.71 
 
 
661 aa  90.5  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  34.3 
 
 
804 aa  90.1  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  35.67 
 
 
750 aa  90.1  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  38.61 
 
 
641 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  38.61 
 
 
641 aa  89.7  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  35.67 
 
 
750 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  37.97 
 
 
641 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  38.61 
 
 
641 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  37.97 
 
 
641 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 
643 aa  89.4  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  32.8 
 
 
166 aa  89.4  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  36.36 
 
 
593 aa  89.4  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  36.36 
 
 
593 aa  89.4  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  38.61 
 
 
641 aa  89.4  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 
672 aa  89  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  36.22 
 
 
642 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  30.41 
 
 
720 aa  89  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  36.22 
 
 
642 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  35.37 
 
 
643 aa  88.6  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  31.43 
 
 
653 aa  88.2  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  34.55 
 
 
648 aa  87.8  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  35.22 
 
 
726 aa  87.8  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  37.58 
 
 
673 aa  86.7  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2260  Lytic transglycosylase catalytic  35.09 
 
 
763 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  35.47 
 
 
650 aa  86.7  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  36.36 
 
 
638 aa  87  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  35.98 
 
 
643 aa  87  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  33.33 
 
 
645 aa  86.3  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  39.6 
 
 
650 aa  86.3  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 
706 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  38.82 
 
 
679 aa  86.3  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2348  Lytic transglycosylase catalytic  35.12 
 
 
763 aa  86.7  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502018  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  32.75 
 
 
808 aa  86.7  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  31.93 
 
 
833 aa  85.9  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  36 
 
 
616 aa  85.5  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  38.22 
 
 
661 aa  85.5  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  34.88 
 
 
650 aa  85.5  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>