86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A0503 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0503  fimbrial protein  100 
 
 
176 aa  344  3e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000550274  hitchhiker  0.00137019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4042  fimbrial protein  100 
 
 
176 aa  344  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.382298  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0171  fimbrial protein  100 
 
 
176 aa  344  3e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2833  fimbrial protein  54.19 
 
 
202 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1667  fimbrial protein  55 
 
 
179 aa  151  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.384622  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4958  fimbrial protein major type 1 subunit  49.44 
 
 
178 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0414161 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0433  fimbrial protein  49.44 
 
 
178 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.428443  hitchhiker  0.0000242972 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4851  fimbrial protein major subunit  49.44 
 
 
178 aa  149  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.523252  normal  0.0116968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0371  fimbrial protein  48.89 
 
 
178 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.537377  normal  0.136666 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0373  fimbrial protein  48.89 
 
 
178 aa  147  6e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.446554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2272  fimbrial protein  46.89 
 
 
176 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2163  fimbrial protein  46.89 
 
 
176 aa  136  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2110  fimbrial protein  46.89 
 
 
176 aa  136  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0298  fimbrial protein  51.93 
 
 
180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0293  fimbrial protein  42.08 
 
 
180 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59710  putative fimbrial protein precursor  41.85 
 
 
182 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.45565e-17  hitchhiker  1.06825e-18 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37060  fimbrial subunit CupA1  43.82 
 
 
183 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2237  fimbrial protein  41.18 
 
 
182 aa  97.1  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0169653 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1277  fimbrial protein  39.26 
 
 
186 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.244383 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3023  fimbrial subunit CupA1  38.8 
 
 
182 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1819  fimbrial protein-like protein  39.89 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000380476 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0054  fimbrial protein  36.31 
 
 
184 aa  74.3  0.0000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1153  putative fimbrial protein  33.33 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0065  fimbrial subunit precursor  36.9 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0704887  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4579  fimbrial protein, putative  35.33 
 
 
186 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4961  fimbrial protein  32.2 
 
 
184 aa  70.5  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180304  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6667  fimbrial protein  33.13 
 
 
207 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0279989 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4250  major type 1 subunit fimbrin (pilin)  34.59 
 
 
175 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.151797 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3034  fimbrial protein  31.72 
 
 
180 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6929  Fimbrial protein  35.98 
 
 
185 aa  61.6  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223669  normal  0.786966 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0576  fimbrial protein  32.08 
 
 
182 aa  61.2  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.911674  normal  0.777659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0561  Fimbrial protein  37.16 
 
 
179 aa  60.8  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.221625 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2972  putative fimbrial subunit  34.92 
 
 
186 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0840  fimbrial protein  43.88 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.555533  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2695  frimbrial protein  32.24 
 
 
181 aa  57.8  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0590722  decreased coverage  0.003545 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1475  fimbrial protein  32.24 
 
 
181 aa  57.8  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1363  frimbrial protein  33.15 
 
 
181 aa  57.4  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.463446  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3031  fimbrial protein  33.54 
 
 
187 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4022  fimbrial protein  28.22 
 
 
183 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6636  fimbrial protein  34.21 
 
 
182 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143091  hitchhiker  0.00000000158442 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0150  fimbrial protein  29.7 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1598  frimbrial protein  29.7 
 
 
181 aa  53.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6670  fimbrial protein  30.49 
 
 
181 aa  52  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.12656 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0118  major fimbrial subunit protein  30.49 
 
 
181 aa  52.4  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1786  fimbrial protein  30.17 
 
 
180 aa  51.6  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000129696  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1675  fimbrial protein  30.17 
 
 
180 aa  51.6  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0767215  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2660  fimbrial protein  30.17 
 
 
180 aa  52  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00247011  hitchhiker  0.00614159 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2870  fimbrial protein  30.52 
 
 
202 aa  51.6  0.000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1100  fimbrial protein  31.38 
 
 
179 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.159551  normal  0.51089 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2181  putative fimbrial protein  30.89 
 
 
179 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.614971 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0126  fimbrial protein  29.41 
 
 
169 aa  50.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0115  frimbrial protein  28.93 
 
 
184 aa  50.8  0.000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00942  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.77 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.608111  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00949  hypothetical protein  30.77 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.654237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2705  Fimbrial protein  30.77 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0296528  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1602  major fimbrial subunit protein  29.88 
 
 
187 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.543363  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2658  fimbrial protein  30.77 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.959086  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0129  major fimbrial subunit protein  29.88 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1694  fimbrial protein  32.5 
 
 
209 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.857438  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0153  major fimbrial subunit protein  29.88 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1366  fimbrial protein  28.73 
 
 
202 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.326274  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1478  fimbrial protein  28.73 
 
 
202 aa  49.3  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1149  putative fimbrial protein  35.29 
 
 
183 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2380  fimbrial protein  32.49 
 
 
180 aa  48.5  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1053  fimbrial protein  32.49 
 
 
180 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.165848  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5933  fimbrial protein  30.81 
 
 
195 aa  47.8  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2033  fimbrial protein  27.49 
 
 
176 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.833658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2233  fimbrial subunit  27.49 
 
 
176 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0918187  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2090  fimbrial protein  27.49 
 
 
176 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01473  hypothetical protein  30.4 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1669  protein FimG-like protein  30.23 
 
 
215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.668207 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2154  fimbrial protein  30.4 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.744663  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1587  protein fimG-like protein  30.4 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2143  Fimbrial protein  30.4 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00578813  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01461  predicted fimbrial-like adhesin protein  30.4 
 
 
167 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1601  fimbrial protein  28.25 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.406485 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1909  fimbrial protein  28.25 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.783563  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1896  fimbrial protein  28.25 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0170475  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1655  FimA  28.25 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0316225  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1626  fimbrial protein  28.25 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1146  fimbrial protein  28.25 
 
 
170 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2060  FimA  28.25 
 
 
210 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.12007  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1692  protein fimG-like protein  30.4 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4153  fimbrial protein  29.1 
 
 
194 aa  42.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0193  putative fimbrial subunit  27.93 
 
 
179 aa  40.8  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4771  fimbrial protein  28.81 
 
 
170 aa  41.2  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.560585  normal  0.583963 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>