More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3048 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3048  Citryl-CoA lyase  100 
 
 		 288 aa  559  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.128546 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3898  Citrate (pro-3S)-lyase  65.74 
 
 		 290 aa  369  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.107361  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3511  citrate (pro-3S)-lyase  65.57 
 
 		 292 aa  342  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4130  citrate (pro-3S)-lyase  55.76 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04680  Citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  34.38 
 
 		 294 aa  168  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0969  Citrate (pro-3S)-lyase  35.74 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1771  beta subunit of citrate lyase  34.87 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.508507  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0417  Citryl-CoA lyase  34.87 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3165  Citryl-CoA lyase  35.23 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0366  Citryl-CoA lyase  40.21 
 
 		 286 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2481  citrate (pro-3S)-lyase  34.43 
 
 		 379 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.565353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2408  citrate lyase, beta subunit  36.14 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0539054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1164  citrate lyase, beta subunit  34.6 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.421072  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0422  citrate lyase beta subunit  35.79 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0217  citrate lyase  35.39 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.342299  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0471  citrate lyase  31.8 
 
 		 318 aa  150  2e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1085  Citryl-CoA lyase  34.62 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0560  putative HpcH/HpaI aldolase  40 
 
 		 277 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00111477  normal  0.30107 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3050  citrate lyase subunit beta  34.78 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1632  citrate lyase, beta subunit  31.49 
 
 		 289 aa  145  8.000000000000001e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3169  citrate lyase, beta subunit  36.59 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0340  Citrate (pro-3S)-lyase  37.23 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1370  Citrate (pro-3S)-lyase  32.63 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0799  citrate (pro-3S)-lyase  34.11 
 
 		 341 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.105286  normal  0.561941 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1621  Citryl-CoA lyase  28.21 
 
 		 284 aa  142  6e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0066  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.93 
 
 		 289 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0067  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.93 
 
 		 289 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0065  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  33.93 
 
 		 289 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0065  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  33.93 
 
 		 289 aa  142  7e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.349601 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0213  HpcH/HpaI aldolase  35.35 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0064  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  33.93 
 
 		 289 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0023  Citrate (pro-3S)-lyase  36.88 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1285  citryl-CoA lyase  35.74 
 
 		 302 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0816  Citryl-CoA lyase  34.28 
 
 		 287 aa  138  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.653692 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7119  HpcH/HpaI aldolase  31.72 
 
 		 324 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.574186  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2171  HpcH/HpaI aldolase  38.14 
 
 		 271 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5039  Citryl-CoA lyase  34.74 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3663  Citryl-CoA lyase  30.65 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.144396  normal  0.0822593 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1754  Citrate (pro-3S)-lyase  31.29 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2830  Citryl-CoA lyase  36.91 
 
 		 304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00480  citrate lyase beta subunit  35.79 
 
 		 286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.842445  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1802  citrate (pro-3S)-lyase  31.51 
 
 		 324 aa  133  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.23047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2138  Citrate (pro-3S)-lyase  31.51 
 
 		 324 aa  133  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  0.238612 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2218  citrate lyase, beta subunit  32.28 
 
 		 291 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0662  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.44 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0735  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  35.44 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6909  citrate (pro-3S)-lyase  36.24 
 
 		 316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692598  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0676  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.44 
 
 		 302 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0781  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.09 
 
 		 302 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44905  normal  0.283656 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2963  citrate lyase acyl carrier protein  33.68 
 
 		 406 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265448  normal  0.540248 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1253  Citryl-CoA lyase  37.54 
 
 		 287 aa  132  7.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0325  citrate lyase, beta subunit  33.68 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3254  Citryl-CoA lyase  30.42 
 
 		 327 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0663527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6514  HpcH/HpaI aldolase  37.02 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0406501 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6600  HpcH/HpaI aldolase  40.78 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186422  normal  0.0929834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1580  Citryl-CoA lyase  34.25 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.264708  hitchhiker  0.00335996 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5950  HpcH/HpaI aldolase  35.84 
 
 		 291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.392121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2320  citrate lyase, beta subunit  32.28 
 
 		 301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0722  citrate (pro-3S)-lyase subunit beta  35.09 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3238  HpcH/HpaI aldolase  36.59 
 
 		 281 aa  130  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0980736 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2027  citrate lyase, beta subunit  32.63 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2630  citrate (pro-3S)-lyase  33.92 
 
 		 285 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6559  citrate (pro-3S)-lyase  31.39 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527752  normal  0.02273 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3317  Citrate (pro-3S)-lyase  40.99 
 
 		 280 aa  130  3e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6255  HpcH/HpaI aldolase  36.92 
 
 		 291 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.76273 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3153  citrate (pro-3S)-lyase  33.95 
 
 		 308 aa  130  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.835356  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3373  citrate lyase, beta subunit  32.98 
 
 		 291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.488048 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4946  HpcH/HpaI aldolase  37.41 
 
 		 269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00584  citrate lyase, citryl-ACP lyase (beta) subunit  35.44 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3009  citrate lyase, beta subunit  35.44 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0704  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.44 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0638  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.44 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.331094  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0667  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.44 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3028  citrate lyase, beta subunit  35.44 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0635  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.44 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0530  citrate (pro-3S)-lyase, beta subunit  35.44 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00573  hypothetical protein  35.44 
 
 		 302 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0970  putative citrate lyase beta chain  33.57 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3944  Citrate (pro-3S)-lyase  33.1 
 
 		 306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000538772 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0082  citrate (pro-3S)-lyase  33.33 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1012  HpcH/HpaI aldolase  36.3 
 
 		 291 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6652  HpcH/HpaI aldolase  40.86 
 
 		 275 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.647972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3859  HpcH/HpaI aldolase  33.1 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1719  HpcH/HpaI aldolase  36.52 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.422564 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0233  HpcH/HpaI aldolase  35.27 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.528941  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5924  citrate (pro-3S)-lyase  31.21 
 
 		 325 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.333382 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0606  Citryl-CoA lyase  33.8 
 
 		 282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3538  HpcH/HpaI aldolase  34.92 
 
 		 310 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0507749  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34570  citrate lyase beta chain  38.79 
 
 		 275 aa  126  5e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2166  citrate lyase  33.22 
 
 		 338 aa  125  7e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2561  citrate (pro-3S)-lyase  32.19 
 
 		 331 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.180481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1719  Citrate (pro-3S)-lyase  31.19 
 
 		 325 aa  125  8.000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.412951 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2289  HpcH/HpaI aldolase  35.45 
 
 		 293 aa  124  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1754  citrate lyase, beta subunit  31.93 
 
 		 291 aa  125  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.42542  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0496  Citryl-CoA lyase  33.94 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2705  citrate lyase  36.09 
 
 		 296 aa  124  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0669  putative HpcH/HpaI aldolase/citrate lyase  34.52 
 
 		 274 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2490  citrate lyase  33.89 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2682  citrate (pro-3S)-lyase  34.97 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4087  HpcH/HpaI aldolase  37.1 
 
 		 271 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.106602  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>