More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I0267 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



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PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  100 
 
 		 214 aa  444  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  56.04 
 
 		 211 aa  243  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  56.04 
 
 		 242 aa  240  9e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  56.63 
 
 		 211 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  45.5 
 
 		 218 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  44.55 
 
 		 220 aa  198  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 215 aa  197  9e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  44.81 
 
 		 215 aa  197  9e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 215 aa  197  9e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 215 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 215 aa  192  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 215 aa  192  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 215 aa  191  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  42.92 
 
 		 217 aa  187  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 213 aa  186  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 218 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  41.51 
 
 		 215 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  35.98 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 215 aa  129  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  32.5 
 
 		 220 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  32.5 
 
 		 220 aa  128  6e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 236 aa  118  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 235 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  35.71 
 
 		 231 aa  113  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 236 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 239 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  28.84 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 244 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 252 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 237 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 217 aa  106  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 223 aa  105  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 239 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  32.49 
 
 		 204 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 204 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 204 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  30.81 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 205 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1089  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  35.9 
 
 		 221 aa  75.1  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
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NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
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NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
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NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
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NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  23.31 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
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NC_013517  Sterm_2309  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.160392  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008346  Swol_1334  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
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NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 291 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
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NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 332 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  25.46 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  27.59 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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