More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1652 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  100 
 
 
171 aa  344  3e-94  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  36.02 
 
 
165 aa  122  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  37.65 
 
 
278 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  34.59 
 
 
166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  33.95 
 
 
170 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  39.38 
 
 
167 aa  106  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  33.93 
 
 
176 aa  106  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  36.75 
 
 
179 aa  103  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  33.33 
 
 
176 aa  101  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  34.55 
 
 
177 aa  98.6  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  31.79 
 
 
204 aa  98.2  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  32.16 
 
 
169 aa  97.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  34.81 
 
 
174 aa  97.4  7e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  36.02 
 
 
163 aa  97.1  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  34.15 
 
 
176 aa  97.1  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  32.93 
 
 
180 aa  95.9  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  34.46 
 
 
186 aa  94.4  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  35.44 
 
 
167 aa  94.4  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  33.12 
 
 
170 aa  93.6  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  37.84 
 
 
166 aa  93.6  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  31.87 
 
 
168 aa  92.8  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  37.84 
 
 
166 aa  92.8  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  31.71 
 
 
170 aa  92.4  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  39.13 
 
 
176 aa  92  3e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  39.63 
 
 
174 aa  91.7  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1083  nitroreductase  34.34 
 
 
175 aa  91.3  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000705077  normal  0.264169 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  34 
 
 
163 aa  90.9  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  31.33 
 
 
194 aa  90.5  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  31.45 
 
 
168 aa  89.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  33.73 
 
 
178 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  30.51 
 
 
184 aa  89  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  29.88 
 
 
176 aa  89  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  30.12 
 
 
194 aa  88.6  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0708  nitroreductase family protein  35.03 
 
 
171 aa  87.4  8e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00199278  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  31.58 
 
 
169 aa  87.4  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  33.13 
 
 
174 aa  87.4  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0046  nitroreductase  32.97 
 
 
186 aa  87  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  33.9 
 
 
190 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  35.46 
 
 
169 aa  87.4  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  31.93 
 
 
171 aa  85.9  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  36.6 
 
 
170 aa  86.7  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  30.49 
 
 
169 aa  84.3  8e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  31.74 
 
 
169 aa  83.6  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  27.59 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  33.54 
 
 
175 aa  82.8  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  30.61 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0709  nitroreductase  31.52 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  30.64 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  30 
 
 
169 aa  82  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  32.73 
 
 
173 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  29.38 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  31.29 
 
 
329 aa  80.9  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  34.18 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  28.24 
 
 
188 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0660  nitroreductase family protein  31.4 
 
 
184 aa  79.7  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.799475 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  30.25 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0218  nitroreductase  30.18 
 
 
180 aa  79  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  34.18 
 
 
169 aa  79  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  31.79 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  29.14 
 
 
173 aa  77.4  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  29.71 
 
 
196 aa  77.4  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  26.29 
 
 
187 aa  77.4  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  30 
 
 
171 aa  77.8  0.00000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  28.92 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  28.92 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  30.97 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1660  nitroreductase  27.98 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.283139  normal  0.036754 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  31.13 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  32.93 
 
 
169 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  27.63 
 
 
201 aa  76.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  29.14 
 
 
173 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1357  nitroreductase  29.09 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.374254 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  30.3 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  29.88 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  31.29 
 
 
192 aa  75.1  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  27.71 
 
 
169 aa  74.7  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  29.09 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  28.4 
 
 
187 aa  74.3  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  34.42 
 
 
169 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  29.66 
 
 
171 aa  73.9  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0073  nitroreductase family protein  31.06 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  28.41 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  31.9 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0827  nitroreductase  34.27 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0804  nitroreductase  34.27 
 
 
184 aa  73.2  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0536  nitroreductase  28.86 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  29.89 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  28.95 
 
 
197 aa  72  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  31.68 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0470  nitroreductase  37.27 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0140295  hitchhiker  0.000457021 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0992  hypothetical protein  32.48 
 
 
175 aa  71.2  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.911499 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0182  NADH dehydrogenase  25.51 
 
 
206 aa  70.9  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263837  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  31.71 
 
 
176 aa  70.9  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0813  nitroreductase  30.43 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  24.88 
 
 
234 aa  70.9  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2283  nitroreductase  26.53 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.671339  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1263  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28.44 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  32.64 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  33.56 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  31.64 
 
 
184 aa  69.7  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>