More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0410 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0410  M48 family peptidase  100 
 
 		 288 aa  587  1e-167  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000410475  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2381  peptidase M48, Ste24p  39.92 
 
 		 307 aa  192  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0670  peptidase M48, Ste24p  40.69 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00234542  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1887  peptidase M48, Ste24p  31.76 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  31.15 
 
 		 294 aa  118  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0464  peptidase M48 Ste24p  30.68 
 
 		 292 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.115654 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  32.39 
 
 		 479 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0982  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  31.65 
 
 		 312 aa  112  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0448  peptidase M48 Ste24p  32.08 
 
 		 292 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  29.7 
 
 		 285 aa  109  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0040  hypothetical protein  29.06 
 
 		 513 aa  108  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.257159 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  31 
 
 		 481 aa  105  7e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4327  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 286 aa  105  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0989  peptidase M48 Ste24p  30.38 
 
 		 270 aa  105  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168656  hitchhiker  0.00764497 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1260  hypothetical protein  31.25 
 
 		 275 aa  103  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.617614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  31.91 
 
 		 269 aa  102  9e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  30.74 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  27.11 
 
 		 489 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  30.51 
 
 		 266 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0123  putative exported peptidase  28.94 
 
 		 479 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  29 
 
 		 490 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  29.9 
 
 		 269 aa  99.8  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  28.14 
 
 		 266 aa  99.8  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 		 487 aa  99  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  30.58 
 
 		 493 aa  98.6  1e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1692  peptidase M48 Ste24p  29.96 
 
 		 504 aa  98.2  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.147911 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  30.58 
 
 		 475 aa  98.6  1e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  31.08 
 
 		 268 aa  98.6  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1795  peptidase M48, Ste24p  29.27 
 
 		 513 aa  98.6  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  30.41 
 
 		 265 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  30.23 
 
 		 278 aa  97.8  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  29.46 
 
 		 492 aa  97.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0127  M48 family peptidase  31.65 
 
 		 471 aa  97.1  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5784  putative lipoprotein  26.38 
 
 		 479 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  27.5 
 
 		 266 aa  97.4  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2250  peptidase M48, Ste24p  30.28 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.581419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66690  putative protease  26.81 
 
 		 479 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1904  peptidase M48, Ste24p  27.66 
 
 		 493 aa  96.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.429469  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  30.32 
 
 		 269 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  28.68 
 
 		 424 aa  96.3  5e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  30.32 
 
 		 269 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  32.41 
 
 		 554 aa  96.3  5e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  30.32 
 
 		 269 aa  96.3  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  31.15 
 
 		 293 aa  96.3  6e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  30.32 
 
 		 269 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3882  peptidase M48, Ste24p  26.67 
 
 		 340 aa  95.9  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  32.41 
 
 		 568 aa  95.5  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  29.86 
 
 		 282 aa  95.5  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  29.53 
 
 		 269 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  29.95 
 
 		 392 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  30 
 
 		 566 aa  94.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 263 aa  94.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  29.53 
 
 		 269 aa  94.7  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  29.53 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4143  peptidase M48, Ste24p  28.36 
 
 		 347 aa  93.6  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.724866  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  27.76 
 
 		 497 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  27.85 
 
 		 272 aa  93.2  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  30.54 
 
 		 427 aa  92.8  6e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  30.18 
 
 		 268 aa  92.4  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 503 aa  92.4  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  27.43 
 
 		 266 aa  92.4  8e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  27.1 
 
 		 262 aa  92  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  33.71 
 
 		 493 aa  92  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  26.42 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  30.81 
 
 		 262 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  31.4 
 
 		 524 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  29.09 
 
 		 513 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  34.97 
 
 		 273 aa  91.3  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02491  protease  29.44 
 
 		 533 aa  90.9  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  28.92 
 
 		 487 aa  90.9  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  30.29 
 
 		 482 aa  90.5  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2092  peptidase M48 Ste24p  25.82 
 
 		 280 aa  90.1  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  34.07 
 
 		 262 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3171  peptidase M48 Ste24p  28.05 
 
 		 445 aa  90.5  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0539  peptidase M48, Ste24p  26.81 
 
 		 478 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  27.49 
 
 		 496 aa  90.1  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  29.81 
 
 		 513 aa  89.7  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  28.43 
 
 		 487 aa  89.4  6e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  30.46 
 
 		 284 aa  89.7  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  26.55 
 
 		 271 aa  89.4  7e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1099  peptidase M48, Ste24p  26.29 
 
 		 365 aa  89.4  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000343868  hitchhiker  0.000201004 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  29.3 
 
 		 480 aa  89  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1362  peptidase M48 Ste24p  28.37 
 
 		 516 aa  88.2  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0606393 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  28.73 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0404  peptidase M48 Ste24p  30.67 
 
 		 604 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.527715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  28.73 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  27.99 
 
 		 503 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  29.47 
 
 		 487 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  28.99 
 
 		 478 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  29.47 
 
 		 500 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  29.57 
 
 		 497 aa  87.8  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  27.02 
 
 		 505 aa  87.8  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  30.19 
 
 		 488 aa  87.8  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  28.5 
 
 		 278 aa  87.8  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 268 aa  87  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  29.05 
 
 		 255 aa  87  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  31.72 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  27.5 
 
 		 494 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  30.34 
 
 		 268 aa  87  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  28.36 
 
 		 487 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>