More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1412 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 847 aa  1702    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  82.87 
 
 		 848 aa  1378    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  35.8 
 
 		 817 aa  491  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  36.66 
 
 		 817 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  36.15 
 
 		 843 aa  485  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  36 
 
 		 948 aa  482  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  36.43 
 
 		 797 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  36.35 
 
 		 797 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  36.19 
 
 		 797 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  36.92 
 
 		 803 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  36.69 
 
 		 812 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  36.42 
 
 		 853 aa  468  9.999999999999999e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  36.43 
 
 		 797 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  36.58 
 
 		 812 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  36.53 
 
 		 812 aa  465  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  36.17 
 
 		 870 aa  462  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  36.64 
 
 		 797 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 800 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  37.71 
 
 		 853 aa  453  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  35.69 
 
 		 918 aa  455  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  36.76 
 
 		 800 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  34.71 
 
 		 933 aa  432  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  35.71 
 
 		 788 aa  430  1e-119  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  34.33 
 
 		 795 aa  427  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  35.71 
 
 		 788 aa  429  1e-118  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  34.31 
 
 		 784 aa  422  1e-116  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  34.81 
 
 		 795 aa  413  1e-114  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  34.85 
 
 		 924 aa  413  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  33.66 
 
 		 795 aa  414  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  34.28 
 
 		 947 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  32.36 
 
 		 887 aa  406  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  32.89 
 
 		 857 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  33.41 
 
 		 856 aa  399  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  33.26 
 
 		 851 aa  399  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 		 867 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.76 
 
 		 799 aa  395  1e-108  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  32.48 
 
 		 874 aa  392  1e-107  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 858 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  33.29 
 
 		 793 aa  387  1e-106  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 793 aa  389  1e-106  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  32.09 
 
 		 861 aa  389  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  33.29 
 
 		 803 aa  384  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  34.02 
 
 		 867 aa  383  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  32.55 
 
 		 840 aa  385  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  32.87 
 
 		 811 aa  382  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  33.37 
 
 		 871 aa  381  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  34.16 
 
 		 823 aa  379  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 868 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  32.38 
 
 		 864 aa  374  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.66 
 
 		 811 aa  369  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  32.65 
 
 		 883 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  33.8 
 
 		 811 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  33.53 
 
 		 800 aa  357  5e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  33.01 
 
 		 884 aa  355  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  31.4 
 
 		 1015 aa  355  2.9999999999999997e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  32.41 
 
 		 821 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  32.8 
 
 		 850 aa  353  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  31.1 
 
 		 924 aa  352  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 815 aa  347  5e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  31.36 
 
 		 961 aa  346  1e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 867 aa  343  8e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 869 aa  343  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  32.43 
 
 		 804 aa  335  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 815 aa  328  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  31.83 
 
 		 835 aa  325  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  30.6 
 
 		 872 aa  324  5e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 847 aa  320  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  31.94 
 
 		 818 aa  317  8e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.59 
 
 		 832 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 		 885 aa  306  7e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  29.49 
 
 		 833 aa  296  9e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  28.54 
 
 		 987 aa  289  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  30.81 
 
 		 858 aa  280  7e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  29.75 
 
 		 816 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  28.92 
 
 		 842 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 842 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  28.68 
 
 		 813 aa  265  3e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  28.88 
 
 		 849 aa  253  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  30.83 
 
 		 948 aa  224  4e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  30.2 
 
 		 870 aa  221  5e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 877 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  26.15 
 
 		 873 aa  213  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  26.16 
 
 		 852 aa  206  2e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 879 aa  194  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 841 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0162  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 817 aa  167  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.539362  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2361  TonB-dependent receptor  26.52 
 
 		 869 aa  167  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0791716  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  26.63 
 
 		 839 aa  162  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1903  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 855 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000110647  hitchhiker  0.0000976809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2075  TonB-dependent receptor  24.56 
 
 		 855 aa  154  8.999999999999999e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00318528  hitchhiker  0.00256739 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  23.95 
 
 		 904 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1958  TonB-dependent receptor  25.22 
 
 		 853 aa  153  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0202201  normal  0.592447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2427  TonB-dependent receptor, putative  24.83 
 
 		 853 aa  152  3e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 904 aa  151  6e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0680  TonB-dependent receptor  25.33 
 
 		 852 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000204176  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0738  TonB-dependent receptor  25.62 
 
 		 847 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0108325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  25.25 
 
 		 843 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2044  TonB-dependent receptor, plug  27.49 
 
 		 709 aa  149  3e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0644838  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 		 904 aa  148  5e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 838 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>