More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7768 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  393  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  76.06 
 
 		 196 aa  297  8e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  66.67 
 
 		 213 aa  265  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  64.14 
 
 		 200 aa  255  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  68.82 
 
 		 204 aa  247  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  63.78 
 
 		 189 aa  243  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  44.97 
 
 		 201 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 		 208 aa  105  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 189 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 217 aa  101  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 228 aa  101  9e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 207 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 208 aa  89  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 212 aa  88.2  7e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 224 aa  86.3  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 256 aa  85.9  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  30.98 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 188 aa  82.8  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 205 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 195 aa  79  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  29.85 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 240 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 205 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  46.51 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 246 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 204 aa  71.2  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  26.6 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  26.15 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  30.05 
 
 		 210 aa  68.6  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 310 aa  65.1  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 241 aa  64.7  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2437  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  44.58 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1265  TetR family transcriptional regulator  24.57 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 242 aa  62.4  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  26.6 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>