127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1327 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  342  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  56.63 
 
 
167 aa  184  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  38.1 
 
 
181 aa  120  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  42.58 
 
 
180 aa  118  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  32.73 
 
 
170 aa  113  8.999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  36.14 
 
 
203 aa  109  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  40.14 
 
 
174 aa  105  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  33.53 
 
 
172 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  33.53 
 
 
172 aa  99.4  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  33.53 
 
 
172 aa  99  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  34.71 
 
 
189 aa  95.5  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  35.12 
 
 
175 aa  95.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  30.52 
 
 
169 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  32.7 
 
 
479 aa  92.8  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  34.3 
 
 
185 aa  92  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  31.33 
 
 
189 aa  88.6  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  30.86 
 
 
172 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  30.95 
 
 
172 aa  83.2  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  29.94 
 
 
181 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  33.77 
 
 
182 aa  82  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  33.74 
 
 
209 aa  82  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  28.14 
 
 
178 aa  81.6  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  35.16 
 
 
179 aa  75.1  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  31.4 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  32.98 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  28.57 
 
 
186 aa  63.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  28.4 
 
 
208 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  28.48 
 
 
232 aa  63.2  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  28.39 
 
 
252 aa  61.6  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1656  membrane-flanked domain-containing protein  32.97 
 
 
229 aa  60.8  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125781  hitchhiker  0.00365351 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  28.36 
 
 
219 aa  60.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  31.37 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  29.45 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  26.52 
 
 
186 aa  58.5  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  30.32 
 
 
169 aa  57.8  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  27.07 
 
 
243 aa  57.4  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  27.94 
 
 
247 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  35.38 
 
 
227 aa  57  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  28.92 
 
 
172 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3728  membrane-flanked domain protein  30.16 
 
 
176 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.557347  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  32.61 
 
 
176 aa  54.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  29.05 
 
 
158 aa  54.3  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  26.9 
 
 
175 aa  54.3  0.0000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  26.9 
 
 
180 aa  53.9  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0824  hypothetical protein  27.81 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.332875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  25.56 
 
 
176 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  32.91 
 
 
170 aa  52.4  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  23.13 
 
 
255 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  25.74 
 
 
291 aa  52  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2966  membrane-flanked domain-containing protein  28.97 
 
 
176 aa  51.6  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0781  membrane-flanked domain-containing protein  26.05 
 
 
180 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0629316 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1403  hypothetical protein  27.52 
 
 
165 aa  51.2  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.1602  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3185  membrane-flanked domain-containing protein  26.05 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269357 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0753  membrane-flanked domain-containing protein  26.05 
 
 
180 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0485052 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00240  predicted membrane protein  27.78 
 
 
673 aa  50.1  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.32403  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0162  hypothetical protein  27.37 
 
 
127 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.373951  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  30.38 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  25 
 
 
198 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  24.26 
 
 
283 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2926  membrane-flanked domain protein  32.26 
 
 
231 aa  49.3  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  32.35 
 
 
575 aa  48.9  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12860  predicted membrane protein  29.63 
 
 
587 aa  49.3  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0245605  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  24.82 
 
 
371 aa  48.9  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3631  membrane-flanked domain-containing protein  28.09 
 
 
179 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0110103  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  27.33 
 
 
229 aa  48.1  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3754  membrane-flanked domain-containing protein  28.09 
 
 
179 aa  48.1  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0473065  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3563  membrane-flanked domain protein  28.09 
 
 
179 aa  47.8  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0439159  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3352  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 
504 aa  47.8  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0680319  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3601  membrane-flanked domain protein  29.21 
 
 
173 aa  47.8  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0679  membrane-flanked domain-containing protein  27.91 
 
 
179 aa  47.4  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000277417  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0732  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 
506 aa  47.8  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.924823  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  24.72 
 
 
541 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3092  membrane-flanked domain-containing protein  32.89 
 
 
522 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4495  membrane-flanked domain protein  28.26 
 
 
483 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0787  membrane-flanked domain-containing protein  28.18 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1511  hypothetical protein  28.28 
 
 
170 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000724877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2490  membrane-flanked domain-containing protein  22.47 
 
 
449 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.728641  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04063  membrane flanked domain family  30.17 
 
 
501 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0245  membrane-flanked domain protein  25.93 
 
 
619 aa  46.6  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2654  hypothetical protein  27.27 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2524  hypothetical protein  27.27 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  24.85 
 
 
282 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0948  membrane-flanked domain-containing protein  30.85 
 
 
174 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.405275 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2094  hypothetical protein  25.53 
 
 
178 aa  45.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.859623  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  27.61 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0354  membrane-flanked domain protein  26.92 
 
 
486 aa  45.4  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.813844  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2913  membrane protein  32.05 
 
 
492 aa  44.7  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4033  membrane-flanked domain-containing protein  32.05 
 
 
514 aa  44.7  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3697  membrane-flanked domain-containing protein  28.72 
 
 
174 aa  44.3  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.505338  normal  0.0305659 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3849  hypothetical protein  32.91 
 
 
180 aa  44.3  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  32.05 
 
 
513 aa  44.3  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01220  predicted membrane protein  26.74 
 
 
700 aa  43.9  0.0009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1159  hypothetical protein  22.46 
 
 
480 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.576203  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  23.03 
 
 
179 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  24.64 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3577  membrane-flanked domain  27.03 
 
 
512 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.298166  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1149  membrane-flanked domain protein  28.85 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1759  membrane-flanked domain protein  32.79 
 
 
493 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0974  hypothetical protein  23.42 
 
 
486 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.748155  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1800  hypothetical protein  25.17 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.504578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>