207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0566 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  394  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  57.29 
 
 		 223 aa  224  4e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4025  regulatory protein, TetR  58.01 
 
 		 197 aa  214  8e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.865842 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  53.65 
 
 		 215 aa  204  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  48.68 
 
 		 210 aa  197  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  51.83 
 
 		 229 aa  195  3e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5345  transcriptional regulator, TetR family  52.2 
 
 		 196 aa  192  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.745934  normal  0.0675507 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  48.68 
 
 		 212 aa  191  8e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  50.8 
 
 		 264 aa  189  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  50.28 
 
 		 184 aa  186  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  47.5 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 223 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  42.02 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1314  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 201 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.2142  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 217 aa  81.6  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  28.06 
 
 		 227 aa  71.2  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  26.84 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  29.7 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1901  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0306246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1996  regulatory protein TetR  28.19 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  27.8 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2836  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00562159  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  39.24 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0857  transcriptional regulator, TetR family  54.1 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.999415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0829  transcriptional regulator, TetR family  54.1 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1981  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.992174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2249  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.672555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  51.92 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 199 aa  52  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 212 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 212 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 212 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  38.67 
 
 		 227 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 214 aa  51.2  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 219 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  40 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 228 aa  49.3  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  44.44 
 
 		 210 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 213 aa  49.3  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  42.11 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 218 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  38.16 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 219 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3508  transcriptional regulator PsrA  33.33 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2069  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.118237  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  22.65 
 
 		 264 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4869  regulatory protein, TetR  25.53 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  29.85 
 
 		 278 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0249  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 		 238 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25180  transcriptional regulator PsrA  34.33 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2153  transcriptional regulator PsrA  34.33 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 235 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>