More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3058 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 377 aa  785    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  63.59 
 
 		 358 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  58.56 
 
 		 405 aa  449  1e-125  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2901  Radical SAM domain protein  59.71 
 
 		 359 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.297507 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1955  Radical SAM domain protein  60.64 
 
 		 363 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.356683 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0287  Radical SAM domain protein  57.14 
 
 		 414 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  57.77 
 
 		 346 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  57.85 
 
 		 399 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2577  Elongator protein 3/MiaB/NifB  53.91 
 
 		 397 aa  423  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.720803  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  55.59 
 
 		 349 aa  419  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  50.81 
 
 		 561 aa  401  1e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  54.36 
 
 		 769 aa  379  1e-104  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3149  Fe-S oxidoreductase, putative component of heme biosynthesis  47.44 
 
 		 366 aa  349  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000504303  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0015  Radical SAM domain protein  44.8 
 
 		 358 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0014  Radical SAM domain protein  44.51 
 
 		 358 aa  335  7e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3122  Radical SAM domain protein  45.38 
 
 		 354 aa  335  9e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000519465  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0014  radical SAM domain-containing protein  44.8 
 
 		 357 aa  333  3e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0107505  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0015  radical SAM family protein  44.8 
 
 		 356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0300598  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3454  radical SAM domain-containing protein  44.8 
 
 		 356 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  43.4 
 
 		 413 aa  325  5e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2942  radical SAM domain-containing protein  44.22 
 
 		 358 aa  322  6e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0608132  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  45.61 
 
 		 330 aa  318  7e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  45.16 
 
 		 330 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  42.65 
 
 		 333 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  44.83 
 
 		 335 aa  302  8.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  45.29 
 
 		 325 aa  294  2e-78  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  42.9 
 
 		 334 aa  291  1e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  43.86 
 
 		 332 aa  287  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1875  coenzyme PQQ synthesis protein  40.44 
 
 		 377 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1737  coenzyme PQQ synthesis protein  40.44 
 
 		 378 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  42.31 
 
 		 327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1910  putative coenzyme PQQ synthesis protein  40.17 
 
 		 377 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.302049 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  42.6 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1713  coenzyme PQQ synthesis protein  40.17 
 
 		 377 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00161975  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0817  radical SAM family Fe-S protein  43.06 
 
 		 375 aa  283  4.0000000000000003e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0856567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1573  Radical SAM domain protein  39.56 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  44.93 
 
 		 349 aa  280  3e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  42.14 
 
 		 333 aa  279  6e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  42.61 
 
 		 372 aa  275  8e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  41.95 
 
 		 380 aa  273  4.0000000000000004e-72  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4381  radical SAM domain-containing protein  40.34 
 
 		 381 aa  264  2e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0634497  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0047  Radical SAM domain protein  38.95 
 
 		 386 aa  260  3e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.834961  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  40.76 
 
 		 364 aa  259  4e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  40.76 
 
 		 353 aa  258  1e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  40.76 
 
 		 367 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  34.96 
 
 		 381 aa  251  2e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0512  radical SAM domain-containing protein  37.32 
 
 		 347 aa  249  6e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000575478  hitchhiker  0.000767983 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1687  coenzyme PQQ synthesis protein  39.51 
 
 		 342 aa  249  7e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  38.42 
 
 		 399 aa  243  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  37.46 
 
 		 479 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1430  radical SAM domain-containing protein  38.16 
 
 		 389 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.733862  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3125  Radical SAM domain protein  37.5 
 
 		 376 aa  235  8e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  34.21 
 
 		 364 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  34.31 
 
 		 367 aa  233  6e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  35.04 
 
 		 496 aa  232  7.000000000000001e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2983  Radical SAM domain protein  35.47 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2907  radical SAM domain-containing protein  37.77 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.386551  normal  0.342339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4255  radical SAM domain-containing protein  37.81 
 
 		 444 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.13913 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  35.64 
 
 		 356 aa  225  8e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  34.2 
 
 		 501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1716  radical SAM domain-containing protein  35.54 
 
 		 378 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.174012 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2255  radical SAM domain-containing protein  34.82 
 
 		 369 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.209492  normal  0.0610472 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1901  radical SAM domain-containing protein  34.55 
 
 		 368 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.13165 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2637  Radical SAM domain protein  33.7 
 
 		 350 aa  217  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.295239  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  35.51 
 
 		 399 aa  216  7e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1900  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 382 aa  215  9.999999999999999e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.816144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0113  radical SAM domain-containing protein  33.99 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.389414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  36.68 
 
 		 398 aa  209  7e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1148  Radical SAM domain protein  34.04 
 
 		 375 aa  206  6e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  34.48 
 
 		 390 aa  204  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  35.06 
 
 		 391 aa  203  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2740  radical SAM domain-containing protein  35.6 
 
 		 392 aa  203  4e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.28006 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  35.23 
 
 		 399 aa  202  6e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  34.36 
 
 		 393 aa  200  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  33.78 
 
 		 391 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  34.52 
 
 		 342 aa  196  6e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  33.83 
 
 		 418 aa  193  4e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  32.36 
 
 		 394 aa  192  9e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  32.38 
 
 		 394 aa  191  1e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  31.05 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 		 380 aa  190  4e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.6 
 
 		 399 aa  189  5e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  36.1 
 
 		 380 aa  189  8e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  32.34 
 
 		 422 aa  188  1e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  32 
 
 		 395 aa  186  4e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2161  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 390 aa  186  6e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000156576  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3170  radical SAM family protein  34.56 
 
 		 387 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  35.67 
 
 		 377 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  32.16 
 
 		 379 aa  184  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2609  Radical SAM domain protein  32.96 
 
 		 402 aa  184  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.342022  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  33.14 
 
 		 378 aa  183  4.0000000000000006e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  35.67 
 
 		 389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  31.82 
 
 		 394 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  31.46 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  31.09 
 
 		 404 aa  181  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 		 480 aa  181  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  32.43 
 
 		 393 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  33.05 
 
 		 382 aa  180  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  31.62 
 
 		 397 aa  180  4e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1253  Radical SAM domain protein  31.76 
 
 		 396 aa  179  7e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.942502  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>