More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3684 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



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PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  419  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  82.18 
 
 		 202 aa  350  7e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  83.17 
 
 		 200 aa  348  2e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  81.68 
 
 		 202 aa  347  5e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  81.15 
 
 		 201 aa  330  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  80.63 
 
 		 201 aa  329  2e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  80.42 
 
 		 189 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  80.42 
 
 		 190 aa  325  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  80 
 
 		 201 aa  323  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  69.15 
 
 		 191 aa  272  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  64.86 
 
 		 190 aa  265  4e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  63.64 
 
 		 193 aa  260  8e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  60.29 
 
 		 205 aa  258  4e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  64.48 
 
 		 194 aa  258  6e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  65.05 
 
 		 194 aa  244  4.9999999999999997e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  60.96 
 
 		 206 aa  239  2e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 195 aa  170  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 192 aa  126  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 197 aa  122  5e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
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NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  39.42 
 
 		 203 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 196 aa  98.2  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
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NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 196 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
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NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
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NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
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NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
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NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 192 aa  74.3  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
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NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
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NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 190 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
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NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
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NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  38.82 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
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NC_008576  Mmc1_2228  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 190 aa  67  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112072 
 
 
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NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0243  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 188 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  23.65 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
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NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
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NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4864  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.935636  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5292  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.505597 
 
 
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NC_007492  Pfl01_3536  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5456  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4747  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5406  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313854  normal  0.0102978 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 198 aa  62  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 194 aa  62  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  25.13 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1679  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0706  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 188 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 221 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 214 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  22.51 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 217 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 497 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
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NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_3324  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 212 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.272078  n/a   
 
 
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