More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3289 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  53.66 
 
 		 849 aa  867    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  90.12 
 
 		 856 aa  1548    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 855 aa  1729    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  49.06 
 
 		 842 aa  775    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  48.64 
 
 		 856 aa  775    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  41.88 
 
 		 847 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  42.72 
 
 		 844 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  42.61 
 
 		 847 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  42.37 
 
 		 847 aa  610  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  42.35 
 
 		 852 aa  603  1.0000000000000001e-171  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40.4 
 
 		 846 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  39.62 
 
 		 844 aa  564  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01099  bacteriophytochrome protein  35.53 
 
 		 822 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.506628  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 		 771 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  37.83 
 
 		 783 aa  361  3e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  38.88 
 
 		 772 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 		 775 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 751 aa  334  4e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0383  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.27 
 
 		 746 aa  329  1.0000000000000001e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.269133 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.73 
 
 		 791 aa  318  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4270  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 		 751 aa  317  8e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.235212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 762 aa  313  6.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15596  normal  0.128973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 		 751 aa  312  2e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 749 aa  311  5e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  37.57 
 
 		 728 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  40.16 
 
 		 755 aa  308  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  36.64 
 
 		 728 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3820  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 755 aa  307  7e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 1013 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  39.28 
 
 		 770 aa  301  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3458  putative PAS/PAC sensor protein  42.07 
 
 		 760 aa  301  4e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0932578 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3425  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 		 775 aa  301  5e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0531418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.15 
 
 		 758 aa  300  8e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 775 aa  298  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  32.71 
 
 		 776 aa  298  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2402  ATP-binding region, ATPase-like  34.27 
 
 		 762 aa  296  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0299776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3185  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 762 aa  296  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6428  bacteriophytochrome  36.72 
 
 		 723 aa  293  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 779 aa  291  3e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 709 aa  291  3e-77  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0150  phytochrome sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 		 752 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1986  putative GAF sensor protein  38.51 
 
 		 798 aa  289  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.932658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1309  putative PAS/PAC sensor protein  33.91 
 
 		 722 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543635 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 871 aa  288  4e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  35.59 
 
 		 772 aa  287  5e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 757 aa  287  5.999999999999999e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0099  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 		 746 aa  285  2.0000000000000002e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4127  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 		 743 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313016  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 		 760 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4111  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 		 760 aa  284  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 769 aa  284  6.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3852  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 		 765 aa  280  6e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3424  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.36 
 
 		 758 aa  279  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  39.64 
 
 		 738 aa  278  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2978  putative GAF sensor protein  35.96 
 
 		 567 aa  277  7e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186  normal  0.0306937 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.14 
 
 		 769 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 		 1002 aa  271  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 874 aa  270  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 721 aa  269  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 760 aa  268  2.9999999999999995e-70  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1956  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.37 
 
 		 748 aa  268  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727974  normal  0.121547 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1726  putative PAS/PAC sensor protein  34.93 
 
 		 731 aa  267  7e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3985  putative PAS/PAC sensor protein  32.97 
 
 		 732 aa  267  7e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525883  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 756 aa  267  7e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 864 aa  267  8e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 774 aa  265  2e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.960478  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2356  phytochrome family protein, putative  34.32 
 
 		 755 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.5 
 
 		 748 aa  265  3e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 		 1002 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 		 1002 aa  265  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3740  phytochrome  33.73 
 
 		 732 aa  261  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103591  decreased coverage  0.000116427 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.01 
 
 		 745 aa  260  8e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 875 aa  259  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  30.19 
 
 		 895 aa  259  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2910  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 		 783 aa  258  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0200681  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  31.51 
 
 		 745 aa  257  7e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2377  ATP-binding region, ATPase-like  33.04 
 
 		 759 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.974028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2162  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 745 aa  251  3e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  32.62 
 
 		 1003 aa  249  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03310  GAF domain protein  34.79 
 
 		 625 aa  245  3e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0453757  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  32.79 
 
 		 993 aa  243  9e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7207  putative PAS/PAC sensor protein  30.24 
 
 		 508 aa  241  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 799 aa  242  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721204  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  25.97 
 
 		 908 aa  238  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4111  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with phytochrome (GAF) sensor  34.94 
 
 		 931 aa  238  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with phytochrome (GAF) sensor  34.61 
 
 		 980 aa  238  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2169  putative GAF sensor protein  32.52 
 
 		 812 aa  238  4e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0312851 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3914  Phytochrome central region domain protein  28.77 
 
 		 509 aa  238  4e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.218618 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 770 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1235  phytochrome-like protein  28.43 
 
 		 506 aa  230  8e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4279  diguanylate phosphodiesterase  34.76 
 
 		 936 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2235  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 865 aa  226  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0125  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.04 
 
 		 759 aa  226  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.812946  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  24.53 
 
 		 884 aa  218  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2793  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 763 aa  208  3e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal  0.714834 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1497  putative GAF sensor protein  34.13 
 
 		 689 aa  205  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3141  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.19 
 
 		 762 aa  193  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583701  normal  0.345899 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3089  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.5 
 
 		 740 aa  189  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.552133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 		 602 aa  177  6e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  33.24 
 
 		 639 aa  175  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>