More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4459 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 167 aa  333  5e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  60.54 
 
 		 163 aa  175  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  67.2 
 
 		 157 aa  173  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 154 aa  130  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 178 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 		 179 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3505  MarR family transcriptional regulator  46.92 
 
 		 145 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000513952 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 144 aa  116  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 140 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2942  MarR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 171 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.930234 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  43.94 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 161 aa  114  7.999999999999999e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.137049 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  40.15 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1592  transcription regulator protein  41.22 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  40.15 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  40.15 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  40.15 
 
 		 148 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3494  MarR family transcriptional regulator  44.7 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.748077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0956  homoprotocatechuate degradation operon regulator HpaR  42.11 
 
 		 140 aa  111  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.199121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3701  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.156019 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3191  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1953  transcriptional regulator, MarR family  41.98 
 
 		 154 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0098  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1625  transcriptional regulator, MarR family  41.22 
 
 		 154 aa  106  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1784  MarR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 155 aa  104  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.902391  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 146 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 155 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 155 aa  104  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3652  MarR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 146 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4375  MarR family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 148 aa  101  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.906445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0624  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 151 aa  101  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1736  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  39.85 
 
 		 145 aa  98.6  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0455429  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2462  MarR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 155 aa  98.6  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10480  putative transcriptional regulator  42.37 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2366  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  39.39 
 
 		 155 aa  98.6  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.738628  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 161 aa  98.2  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1649  homoprotocatechuate degradative operon repressor  39.39 
 
 		 155 aa  98.6  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.976372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0099  homoprotocatechuate degradative operon repressor  39.1 
 
 		 145 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1141  homoprotocatechuate degradative operon repressor  39.1 
 
 		 145 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.132048  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1514  homoprotocatechuate degradative operon repressor  39.1 
 
 		 145 aa  97.1  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0687296  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1022  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  39.1 
 
 		 145 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299298  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1059  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  36.36 
 
 		 146 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1175  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  36.36 
 
 		 146 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.051458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1210  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  36.36 
 
 		 146 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  0.971845 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1195  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  36.36 
 
 		 146 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.711605 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1164  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  36.36 
 
 		 146 aa  95.1  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0126682  normal  0.965749 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4307  MarR family transcriptional regulator  42.34 
 
 		 152 aa  94.4  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0246  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 		 144 aa  94.4  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2262  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  38.35 
 
 		 145 aa  94  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0937  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  38.35 
 
 		 145 aa  94  8e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  38.46 
 
 		 140 aa  94  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5823  transcriptional regulator, MarR family  36.62 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.186038  normal  0.534085 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 152 aa  93.2  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2027  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 150 aa  92.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0422371 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1560  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 163 aa  91.3  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.853327  normal  0.443205 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4194  MarR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 158 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1215  MarR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.940566  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2174  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.789823  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2581  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 167 aa  62.4  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.562153 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2456  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 168 aa  61.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.768302  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  25.55 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  29.92 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0969  transcriptional regulator, MarR family  24.63 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000000635233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2058  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000115689  normal  0.149195 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  32.61 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  27.42 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  30.67 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0283  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1578  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0267314 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  39.73 
 
 		 152 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0294  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  30.39 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6436  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.408457 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4591  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2326  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2472  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.161606  normal  0.735248 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7252  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>