More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4591 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4591  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 182 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.539807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0896  transcriptional regulator, MarR family  81.53 
 
 		 156 aa  223  8e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02614  putative transcription regulator protein  58.33 
 
 		 153 aa  169  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.532202  normal  0.750512 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03887  transcriptional regulator MarR family  54.25 
 
 		 152 aa  164  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  57.32 
 
 		 153 aa  164  8e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 154 aa  161  5.0000000000000005e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  56.69 
 
 		 153 aa  161  5.0000000000000005e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  55.15 
 
 		 157 aa  156  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  53.38 
 
 		 157 aa  155  3e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  49.08 
 
 		 160 aa  154  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27230  MarR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 151 aa  151  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  47.97 
 
 		 156 aa  151  5.9999999999999996e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0519  MarR family transcriptional regulator  57.72 
 
 		 150 aa  150  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587381 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  53.9 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  55 
 
 		 151 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 151 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 151 aa  148  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 151 aa  147  6e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1768  transcriptional regulator, MarR family  51.06 
 
 		 157 aa  147  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  52.21 
 
 		 149 aa  147  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  51.47 
 
 		 149 aa  147  9e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2306  putative transcriptional regulator  51.05 
 
 		 151 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0108  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  53.19 
 
 		 152 aa  144  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.879191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  52.21 
 
 		 162 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  52.17 
 
 		 161 aa  143  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  52.14 
 
 		 145 aa  142  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  53.19 
 
 		 162 aa  142  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 170 aa  141  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3996  MarR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 154 aa  141  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000674162  normal  0.401287 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 151 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 152 aa  140  7e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 151 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0623  MarR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 151 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  47.22 
 
 		 158 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  48.23 
 
 		 157 aa  138  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 149 aa  137  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0474  transcriptional regulator, MarR family  47.02 
 
 		 155 aa  137  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1196  MarR family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 155 aa  137  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  50 
 
 		 158 aa  137  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0421  MarR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0670441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  50.74 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  46.53 
 
 		 159 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  47.89 
 
 		 153 aa  135  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0925  regulatory protein MarR  47.18 
 
 		 195 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.101489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6797  transcriptional regulator, MarR family  50.35 
 
 		 150 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000341321  decreased coverage  0.0000000109708 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 150 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 143 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0886  transcriptional regulator, MarR family  47.18 
 
 		 161 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541526  normal  0.759862 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0483  MarR family transcriptional regulator  48.92 
 
 		 151 aa  134  7.000000000000001e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0397178 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0598  MarR family transcriptional regulator  50.35 
 
 		 267 aa  134  9e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  48.91 
 
 		 161 aa  134  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0057  MarR family transcriptional regulator  50.38 
 
 		 185 aa  134  9e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.584189  normal  0.103539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 149 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  52.55 
 
 		 150 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15300  transcriptional regulator, MarR family  50.36 
 
 		 162 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.408936  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  48.55 
 
 		 143 aa  131  3.9999999999999996e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  52.55 
 
 		 150 aa  131  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  43.07 
 
 		 156 aa  131  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  52.55 
 
 		 150 aa  131  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4410  MarR family transcriptional regulator  48 
 
 		 176 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 165 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 150 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 150 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 150 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1203  transcriptional regulator, TrmB  47.1 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.529625  normal  0.0362733 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0200  transcriptional regulator, MarR family  46.94 
 
 		 159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  45.89 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4766  transcriptional regulator, MarR family  46.43 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.462626  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 144 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  41.89 
 
 		 156 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3056  MarR family transcriptional regulator  49.22 
 
 		 168 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 153 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 		 156 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 149 aa  128  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2422  MarR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.934023  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0304  MarR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0862  MarR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 158 aa  128  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182256  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2559  transcriptional regulator  48.95 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.970675  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1483  MarR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.553037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1679  MarR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0335  MarR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 158 aa  128  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.663008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 154 aa  127  6e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0835  transcriptional regulator, MarR family protein  42.55 
 
 		 150 aa  127  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3208  MarR family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 165 aa  127  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.469767 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2845  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 		 145 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.648486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 171 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4256  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.973283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1176  transcriptional regulator, TrmB  46.38 
 
 		 146 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.713709  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  50.36 
 
 		 157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3311  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1193  transcriptional regulator, TrmB  46.38 
 
 		 146 aa  127  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  47.66 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2313  MarR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 147 aa  126  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.708353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  46.81 
 
 		 146 aa  125  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0861  transcriptional regulator, MarR family  46.38 
 
 		 161 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.440211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 159 aa  125  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1068  MarR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 147 aa  125  4.0000000000000003e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>