204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1099 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1099  SMC domain-containing protein  100 
 
 		 1346 aa  2709    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.00011196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1063  exonuclease SbcCD, C subunit  45.04 
 
 		 1307 aa  420  1e-116  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1399  SMC protein-like  45.04 
 
 		 1303 aa  416  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2539  SMC domain protein  43.14 
 
 		 1085 aa  328  5e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0704  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)  34.61 
 
 		 1091 aa  326  2e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.859038  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0568  SMC domain-containing protein  34.26 
 
 		 1091 aa  321  6e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.564542  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1730  exonuclease  33.38 
 
 		 1223 aa  318  3e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0842079  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0204  ATP-dependent dsDNA exonuclease (SbcC)-like  33.59 
 
 		 1088 aa  314  9e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18794  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2570  SMC domain-containing protein  45.84 
 
 		 1230 aa  311  5.9999999999999995e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1354  SMC domain-containing protein  34.46 
 
 		 1224 aa  304  9e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1315  SMC domain protein  31.99 
 
 		 1223 aa  298  3e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.082994  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1980  SMC domain-containing protein  32.47 
 
 		 1227 aa  295  4e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3304  exonuclease SbcC  36.83 
 
 		 1227 aa  294  7e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2080  exonuclease SbcC  32.59 
 
 		 1219 aa  289  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1158  SMC domain protein  31.49 
 
 		 1226 aa  288  4e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1908  normal  0.473044 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1006  SMC domain protein  32.28 
 
 		 1227 aa  288  7e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.817412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3108  SMC domain protein  33.58 
 
 		 1227 aa  283  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.885936  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11550  ATP-dependent dsDNA exonuclease SbcC  33.81 
 
 		 1137 aa  283  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.055976  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2917  SMC domain protein  32.5 
 
 		 1227 aa  276  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605657  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2451  SMC domain-containing protein  40.68 
 
 		 1232 aa  272  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2355  SMC domain-containing protein  39.18 
 
 		 1247 aa  259  2e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03135  exonuclease SbcC  31.16 
 
 		 1238 aa  258  8e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.520091  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2637  SMC domain-containing protein  44.82 
 
 		 1164 aa  252  3e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257916  normal  0.0339127 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0451  exonuclease subunit SbcC  50.19 
 
 		 1046 aa  251  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.8799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0424  exonuclease subunit SbcC  38.84 
 
 		 1047 aa  251  8e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0432  exonuclease subunit SbcC  49.81 
 
 		 1046 aa  251  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2505  SMC protein-like protein  32.98 
 
 		 1265 aa  250  2e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0217131  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3538  SMC domain-containing protein  52.73 
 
 		 1144 aa  249  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.862786  normal  0.561749 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0493  exonuclease subunit SbcC  49.81 
 
 		 1046 aa  249  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0433  exonuclease subunit SbcC  49.81 
 
 		 1046 aa  249  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0438  exonuclease subunit SbcC  49.81 
 
 		 1046 aa  249  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0426  exonuclease subunit SbcC  48.68 
 
 		 1047 aa  249  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.442969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3289  nuclease SbcCD, C subunit  47.49 
 
 		 1220 aa  248  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.267466 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3139  nuclease SbcCD, C subunit  47.49 
 
 		 1229 aa  248  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.642669  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3278  SMC domain-containing protein  47.49 
 
 		 1229 aa  248  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3236  exonuclease subunit SbcC  48.3 
 
 		 1047 aa  247  9e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.528521  hitchhiker  0.0000322457 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0316  exonuclease subunit SbcC  38.6 
 
 		 1047 aa  247  9e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.53041  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0472  exonuclease subunit SbcC  48.3 
 
 		 1047 aa  247  9e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.227308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0464  exonuclease subunit SbcC  48.3 
 
 		 1047 aa  247  9e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00345  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  48.3 
 
 		 1048 aa  247  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1919  SMC protein, N-terminal  46.67 
 
 		 1155 aa  247  9.999999999999999e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00349  hypothetical protein  48.3 
 
 		 1048 aa  247  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3212  exonuclease SbcC  48.68 
 
 		 1048 aa  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.223053  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1039  exonuclease SbcC  51.08 
 
 		 1083 aa  244  6e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.772605  normal  0.479303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  42.38 
 
 		 1234 aa  239  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0894  SMC domain-containing protein  49.57 
 
 		 1165 aa  239  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1333  nuclease sbcCD subunit C  53.6 
 
 		 1226 aa  238  6e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0865  exonuclease subunit SbcC  50.23 
 
 		 1042 aa  234  8.000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.379439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3443  SMC protein-like  49.55 
 
 		 1232 aa  232  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4886  SMC domain protein  29.08 
 
 		 1244 aa  191  9e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110633  normal  0.678618 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3217  exonuclease SbcC  28.94 
 
 		 1213 aa  187  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1714  exonuclease SbcC  29.28 
 
 		 1214 aa  184  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.595206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4849  nuclease sbcCD subunit C  27.9 
 
 		 1211 aa  182  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0713621  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1584  SMC domain-containing protein  32.97 
 
 		 1214 aa  181  1e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.999097  hitchhiker  0.00383377 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3766  exonuclease SbcC  28.77 
 
 		 1214 aa  179  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55650  putative exonuclease  41 
 
 		 1211 aa  177  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.49463  normal  0.712595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1556  SMC domain-containing protein  32.91 
 
 		 1214 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2024  SMC domain protein  36.9 
 
 		 1214 aa  175  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3718  SMC domain-containing protein  36.9 
 
 		 1214 aa  174  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2848  exonuclease SbcC  51.22 
 
 		 1308 aa  172  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1540  SMC domain protein  35.56 
 
 		 1182 aa  170  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1149  SMC protein-like protein  44.39 
 
 		 1101 aa  159  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0305  SMC domain-containing protein  39.33 
 
 		 1248 aa  154  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.447501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0349  SMC domain protein  38.4 
 
 		 1248 aa  154  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.920237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0381  SMC domain protein  37.97 
 
 		 1248 aa  147  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.610563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1821  SMC domain protein  42.72 
 
 		 1280 aa  142  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.137398  normal  0.989347 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0433  exonuclease SbcC  45.73 
 
 		 1245 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0782061  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0467  exonuclease SbcC  45.73 
 
 		 1245 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.929503  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2633  SMC domain-containing protein  30.41 
 
 		 1018 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.158627  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1268  exonuclease SbcC, putative  30.43 
 
 		 1020 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0566832  hitchhiker  0.000365685 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10590  DNA repair ATPase  46.1 
 
 		 1081 aa  119  5e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.659565  hitchhiker  0.0000000614784 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2703  SMC domain protein  39.23 
 
 		 1018 aa  119  5e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0776806  hitchhiker  0.0000173958 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1655  SMC domain-containing protein  39.23 
 
 		 1018 aa  119  5e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00224161  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1640  SMC domain-containing protein  39.23 
 
 		 1018 aa  119  5e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0173468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1677  SMC domain-containing protein  39.23 
 
 		 1018 aa  119  5e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0491089  normal  0.364632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1532  SMC domain-containing protein  39.23 
 
 		 1018 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000252521  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0205  SMC domain-containing protein  34.89 
 
 		 1180 aa  116  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0462  exonuclease SbcC  40.31 
 
 		 1247 aa  116  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.345469  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3060  SMC domain-containing protein  37.38 
 
 		 1018 aa  116  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.496903  normal  0.0254363 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0454  putative exonuclease SbcC  49.63 
 
 		 1013 aa  115  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01050  DNA repair ATPase  40.76 
 
 		 953 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2843  exonuclease SbcC, putative  39.01 
 
 		 1018 aa  115  8.000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1408  DNA repair ATPase-like protein  36.75 
 
 		 1009 aa  114  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000306703  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1435  putative exonuclease SbcC  36.75 
 
 		 1009 aa  114  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00155429  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1589  exonuclease SbcC, putative  37.86 
 
 		 1018 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000033  exonuclease SbcC  33.33 
 
 		 1018 aa  114  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00466596  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2449  SMC domain-containing protein  39.01 
 
 		 1018 aa  113  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634989  unclonable  0.0000000000799023 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2519  SMC domain-containing protein  38.46 
 
 		 1018 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00280637  unclonable  0.0000395857 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2611  exonuclease SbcC, putative  39.01 
 
 		 1018 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.153819  hitchhiker  0.0000000100584 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0171  nuclease SbcCD, C subunit, putative  45.77 
 
 		 1030 aa  112  6e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0052  SMC domain protein  32.04 
 
 		 1049 aa  112  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2456  SMC domain-containing protein  43.8 
 
 		 1018 aa  110  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.053709  unclonable  0.00000627318 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  32 
 
 		 1038 aa  109  3e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0918  exonuclease SbcC  41.11 
 
 		 1009 aa  109  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.286851  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2199  exonuclease  39.55 
 
 		 1029 aa  108  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2360  exonuclease  39.55 
 
 		 1029 aa  108  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.293135  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2167  SMC domain-containing protein  37.95 
 
 		 1029 aa  107  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0876433  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0733  DNA repair exonuclease, SbcC  46.31 
 
 		 962 aa  107  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2326  putative exonuclease  38.98 
 
 		 1029 aa  107  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.678825  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2702  putative exonuclease  28.76 
 
 		 881 aa  107  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0098926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>