More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2917 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  100 
 
 		 1611 aa  3231    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3004  TPR repeat-containing protein  38.39 
 
 		 1082 aa  378  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  39.49 
 
 		 1087 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  31.57 
 
 		 1526 aa  292  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  27.66 
 
 		 2145 aa  198  7e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4523  TPR repeat-containing protein  27.02 
 
 		 1119 aa  195  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  30.15 
 
 		 799 aa  192  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 817 aa  192  5e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  30.05 
 
 		 732 aa  189  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  27.69 
 
 		 1328 aa  188  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  19.59 
 
 		 1238 aa  179  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  30.31 
 
 		 1044 aa  166  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2008  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.94 
 
 		 730 aa  166  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.196869  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  27.16 
 
 		 1550 aa  161  9e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 1215 aa  160  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3535  hypothetical protein  28.29 
 
 		 1123 aa  151  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.878105 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  33.14 
 
 		 843 aa  142  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1241  TPR repeat-containing protein  22.01 
 
 		 1366 aa  140  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0870262  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.08 
 
 		 1186 aa  136  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.29 
 
 		 771 aa  135  7.999999999999999e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  24.51 
 
 		 1180 aa  135  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  21.91 
 
 		 1063 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  22.38 
 
 		 1101 aa  133  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3868  Tetratricopeptide TPR_4  29.67 
 
 		 1736 aa  130  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0314468 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1912  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 578 aa  126  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.62 
 
 		 1676 aa  126  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1262  Tetratricopeptide TPR_4  28.05 
 
 		 1429 aa  126  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.803703  normal  0.0826044 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  25.83 
 
 		 1507 aa  123  3e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 649 aa  122  4.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  26.38 
 
 		 493 aa  121  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  22.75 
 
 		 1060 aa  118  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.71 
 
 		 885 aa  116  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  25.04 
 
 		 1313 aa  115  7.000000000000001e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.02 
 
 		 767 aa  110  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 949 aa  107  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.35 
 
 		 787 aa  107  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  24.86 
 
 		 725 aa  106  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3262  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1020 aa  103  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3350  GUN4-like  25.86 
 
 		 979 aa  103  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  30.51 
 
 		 977 aa  102  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.56 
 
 		 991 aa  100  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.82 
 
 		 3172 aa  98.2  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0873  TPR repeat-containing protein  22.64 
 
 		 567 aa  97.4  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127126  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  24.95 
 
 		 1039 aa  96.3  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  24.46 
 
 		 454 aa  95.9  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  23.72 
 
 		 822 aa  94.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  23.43 
 
 		 825 aa  94  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.18 
 
 		 2240 aa  94  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2028  TPR repeat-containing protein  24.47 
 
 		 1285 aa  93.2  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.628704  normal  0.0470638 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  23.62 
 
 		 1266 aa  91.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 568 aa  89.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 568 aa  89.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  28.68 
 
 		 919 aa  89.4  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  25.39 
 
 		 639 aa  89  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3214  hypothetical protein  25.32 
 
 		 691 aa  88.6  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  24.63 
 
 		 828 aa  88.2  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  21.68 
 
 		 810 aa  86.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  43.1 
 
 		 314 aa  85.9  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 443 aa  85.9  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  26.52 
 
 		 1694 aa  85.5  0.000000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1420  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 809 aa  85.5  0.000000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00128456  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 681 aa  84.7  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  28.84 
 
 		 1228 aa  85.1  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.69 
 
 		 943 aa  84.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8810  Tetratricopeptide domain protein  28.4 
 
 		 724 aa  83.6  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.872699  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  23.68 
 
 		 1040 aa  83.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  22.24 
 
 		 3301 aa  83.6  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  26.04 
 
 		 837 aa  83.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  21.23 
 
 		 878 aa  82.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3533  hypothetical protein  23.83 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.674186  normal  0.782695 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  31 
 
 		 1714 aa  82  0.00000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2267  TPR repeat-containing protein  20.33 
 
 		 1519 aa  82  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00539  conserved hypothetical protein  23.18 
 
 		 1363 aa  81.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.304551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  25.78 
 
 		 865 aa  81.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  25.77 
 
 		 2262 aa  81.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  21.9 
 
 		 1486 aa  81.6  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  27.86 
 
 		 594 aa  80.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  22.71 
 
 		 909 aa  80.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6111  hypothetical protein  31.11 
 
 		 599 aa  79  0.0000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1249  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 702 aa  79  0.0000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0879927  normal  0.272595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4338  hypothetical protein  27.1 
 
 		 711 aa  78.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.969695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 481 aa  78.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_002950  PG1130  TPR domain-containing protein  28.03 
 
 		 665 aa  76.6  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  24.83 
 
 		 1147 aa  76.6  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  24.69 
 
 		 1088 aa  75.5  0.000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  24.64 
 
 		 957 aa  75.5  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3483  TPR repeat-containing protein  18.68 
 
 		 1054 aa  75.1  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.423026 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.83 
 
 		 1195 aa  75.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4219  heterocyst differentiation protein  26.47 
 
 		 806 aa  75.1  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.638928 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  21.24 
 
 		 1488 aa  74.3  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0685  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 436 aa  74.7  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.105073  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1404 aa  73.2  0.00000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3474  Toll-interleukin receptor  41.8 
 
 		 311 aa  72.8  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.593743  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6113  hypothetical protein  26.56 
 
 		 596 aa  72  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 927 aa  72  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7217  Tetratricopeptide TPR_4  25.71 
 
 		 994 aa  71.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  29.41 
 
 		 1914 aa  72  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  23.76 
 
 		 1009 aa  71.6  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03325  conserved hypothetical protein  21.66 
 
 		 1476 aa  70.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0160  TPR repeat-containing protein  21.7 
 
 		 897 aa  70.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>