More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1467 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  66.73 
 
 
504 aa  667    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  100 
 
 
499 aa  995    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1782  protease Do  67.06 
 
 
498 aa  651    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0494  peptidase S1C, Do  65.67 
 
 
506 aa  633  1e-180  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  64.98 
 
 
505 aa  630  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  62.75 
 
 
502 aa  627  1e-178  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  59.8 
 
 
502 aa  583  1.0000000000000001e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000901531  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  43.42 
 
 
479 aa  360  3e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  43.05 
 
 
471 aa  339  7e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  42.58 
 
 
497 aa  336  5e-91  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  39.68 
 
 
474 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  43.6 
 
 
476 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  44.27 
 
 
511 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000307319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  42.67 
 
 
472 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  43.12 
 
 
478 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  40.47 
 
 
476 aa  325  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  48.69 
 
 
511 aa  324  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  43.15 
 
 
466 aa  323  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2091  peptidase S1C, Do  43.89 
 
 
464 aa  323  5e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  40.51 
 
 
476 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  41.43 
 
 
474 aa  320  5e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4753  serine protease MucD precursor  41.74 
 
 
474 aa  319  7e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249411  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  43.28 
 
 
457 aa  318  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1102  protease Do  40.72 
 
 
469 aa  317  3e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.432426  normal  0.334771 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54390  serine protease MucD precursor  41.29 
 
 
474 aa  317  4e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  40.98 
 
 
479 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  39.49 
 
 
476 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13730  HtrA serine protease  40.58 
 
 
473 aa  315  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  41.16 
 
 
477 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  45.88 
 
 
513 aa  312  6.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1952  protease Do  42.44 
 
 
473 aa  312  9e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151255  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  40.72 
 
 
492 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  43.21 
 
 
458 aa  311  2e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  41.07 
 
 
477 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  45.94 
 
 
475 aa  311  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  42.26 
 
 
464 aa  310  4e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  42.09 
 
 
493 aa  310  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1343  protease Do  41.25 
 
 
481 aa  310  4e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.139056  normal  0.641282 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3955  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  40.61 
 
 
481 aa  307  3e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  40.89 
 
 
479 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0859  peptidase S1C, Do  41.39 
 
 
477 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.078917  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1003  peptidase S1C, Do  41.39 
 
 
477 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0749587  normal  0.0653423 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  40.74 
 
 
480 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  42.44 
 
 
506 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  42.44 
 
 
493 aa  306  7e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  40.57 
 
 
477 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  40.31 
 
 
476 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  41.15 
 
 
473 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  42.54 
 
 
494 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  39.5 
 
 
473 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  39.92 
 
 
465 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  41.61 
 
 
494 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  42.32 
 
 
494 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  42.06 
 
 
493 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  42.06 
 
 
493 aa  302  9e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1628  peptidase S1C, Do  40.98 
 
 
478 aa  302  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  39.12 
 
 
472 aa  302  1e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  42.28 
 
 
494 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  41.19 
 
 
495 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  41.19 
 
 
495 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  41.19 
 
 
495 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  39.15 
 
 
482 aa  301  2e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  41.19 
 
 
483 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  37.42 
 
 
467 aa  301  2e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  41.19 
 
 
495 aa  301  2e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  41.19 
 
 
483 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  41.19 
 
 
483 aa  301  2e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  42.51 
 
 
493 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  41.19 
 
 
495 aa  300  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  40.55 
 
 
461 aa  300  3e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  41.22 
 
 
492 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  41.16 
 
 
461 aa  298  1e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  41.22 
 
 
492 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  41.24 
 
 
481 aa  297  3e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  40.48 
 
 
482 aa  297  3e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  44.8 
 
 
404 aa  296  9e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  42.01 
 
 
462 aa  295  1e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2470  serine protease, MucD  40.27 
 
 
502 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  44.51 
 
 
404 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0539  serine protease, MucD  40.49 
 
 
461 aa  294  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.794345  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2479  protease Do  43.04 
 
 
450 aa  295  2e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2898  peptidase  40.49 
 
 
485 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1793  serine protease, MucD  40.27 
 
 
502 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.455589  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2462  peptidase S1C, Do  43.19 
 
 
471 aa  295  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2783  Do family protease  40.27 
 
 
502 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.96749  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2811  serine protease, MucD  40.27 
 
 
502 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2845  Do family protease  40.27 
 
 
502 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  40.82 
 
 
464 aa  293  6e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  44.01 
 
 
485 aa  293  7e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1726  serine protease, MucD  40.27 
 
 
485 aa  292  1e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1088  protease Do  39.83 
 
 
498 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.648763  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0701  serine protease  38.99 
 
 
503 aa  292  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1130  protease Do  39.83 
 
 
498 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0650  peptidase S1C, Do  39.83 
 
 
498 aa  292  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  41.13 
 
 
503 aa  291  2e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  41.08 
 
 
488 aa  291  2e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  39.18 
 
 
514 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3265  protease Do  38.46 
 
 
504 aa  290  3e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3065  protease Do  40.32 
 
 
491 aa  290  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  43.98 
 
 
460 aa  290  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>