159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1150 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  67.03 
 
 		 562 aa  788    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  63.5 
 
 		 536 aa  726    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  67.12 
 
 		 551 aa  742    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  100 
 
 		 560 aa  1154    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  58.06 
 
 		 532 aa  629  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  47.94 
 
 		 572 aa  520  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  47.04 
 
 		 522 aa  490  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  46.67 
 
 		 522 aa  483  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  45.02 
 
 		 522 aa  472  1e-132  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  45.03 
 
 		 543 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  45.67 
 
 		 525 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  38.68 
 
 		 527 aa  359  7e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  40.23 
 
 		 504 aa  325  2e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  35.01 
 
 		 746 aa  254  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  31.5 
 
 		 1195 aa  207  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  31.15 
 
 		 521 aa  194  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  29.59 
 
 		 691 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  29.54 
 
 		 1585 aa  183  9.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  28.75 
 
 		 665 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  28.41 
 
 		 519 aa  179  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  30.65 
 
 		 532 aa  173  7.999999999999999e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  37.31 
 
 		 1338 aa  171  2e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  28.51 
 
 		 550 aa  167  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  28.68 
 
 		 518 aa  165  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  28.88 
 
 		 512 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  28.3 
 
 		 500 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  28.24 
 
 		 577 aa  163  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  28.3 
 
 		 518 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  25.6 
 
 		 512 aa  156  7e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  27.68 
 
 		 516 aa  154  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  27.51 
 
 		 530 aa  153  8e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.22 
 
 		 547 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  28.89 
 
 		 566 aa  150  6e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  28.01 
 
 		 563 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.22 
 
 		 558 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  30.35 
 
 		 636 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.77 
 
 		 546 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  27.47 
 
 		 503 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.86 
 
 		 536 aa  143  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.18 
 
 		 538 aa  143  9e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  27.24 
 
 		 532 aa  142  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  26.45 
 
 		 556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.55 
 
 		 539 aa  141  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.86 
 
 		 546 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  26.48 
 
 		 514 aa  137  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  27.49 
 
 		 541 aa  136  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.67 
 
 		 537 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  30.55 
 
 		 523 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.39 
 
 		 558 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  27.57 
 
 		 547 aa  129  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.4 
 
 		 541 aa  128  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  25.49 
 
 		 537 aa  128  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.22 
 
 		 540 aa  128  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  25.54 
 
 		 540 aa  127  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  30.43 
 
 		 542 aa  127  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  29.6 
 
 		 496 aa  127  5e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  26.42 
 
 		 535 aa  127  6e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  29.48 
 
 		 537 aa  125  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  26.58 
 
 		 517 aa  125  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  29.79 
 
 		 497 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  24.52 
 
 		 553 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  26.89 
 
 		 508 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  31.07 
 
 		 581 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  26.21 
 
 		 539 aa  121  3e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  28.91 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  32.11 
 
 		 537 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  26.8 
 
 		 650 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  31.65 
 
 		 534 aa  118  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  30.39 
 
 		 515 aa  118  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  28.92 
 
 		 484 aa  116  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  31.33 
 
 		 451 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  24.39 
 
 		 498 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  31.22 
 
 		 497 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  31.09 
 
 		 545 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.43 
 
 		 559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  30.5 
 
 		 511 aa  111  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  27.48 
 
 		 552 aa  110  5e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  28.33 
 
 		 586 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  27.29 
 
 		 591 aa  110  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  25.75 
 
 		 571 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  27.61 
 
 		 526 aa  107  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  26.31 
 
 		 1474 aa  107  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 495 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.87 
 
 		 488 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  32.33 
 
 		 365 aa  96.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  27.88 
 
 		 546 aa  92.8  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  25.5 
 
 		 304 aa  87  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  23.95 
 
 		 472 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  31.03 
 
 		 522 aa  84.7  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  27.12 
 
 		 901 aa  83.2  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  25.74 
 
 		 797 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  27.78 
 
 		 537 aa  79  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  23.66 
 
 		 501 aa  78.6  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  27.13 
 
 		 510 aa  77.4  0.0000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  27.76 
 
 		 699 aa  75.1  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  26.71 
 
 		 345 aa  73.9  0.000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  26.35 
 
 		 524 aa  73.6  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  26.9 
 
 		 357 aa  73.6  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  24.71 
 
 		 503 aa  72.4  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  25.56 
 
 		 472 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>