More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0038 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_00391  TPR repeat-containing protein  80.99 
 
 
502 aa  807    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.264497  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0038  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
494 aa  1004    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  56.28 
 
 
685 aa  484  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00371  hypothetical protein  48.58 
 
 
529 aa  482  1e-135  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15741  hypothetical protein  51.7 
 
 
514 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00421  hypothetical protein  47.09 
 
 
484 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.391795  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15821  hypothetical protein  48.31 
 
 
482 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.978409  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  48.36 
 
 
594 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12261  TPR repeat-containing sulfotransferase  40.81 
 
 
614 aa  249  6e-65  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  25.27 
 
 
673 aa  148  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3684  sulfotransferase  25.49 
 
 
542 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  48.97 
 
 
865 aa  144  3e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3721  sulfotransferase  24.22 
 
 
637 aa  140  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 
697 aa  140  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  45.83 
 
 
750 aa  139  1e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 
1406 aa  139  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  47.26 
 
 
583 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  48.3 
 
 
430 aa  138  2e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2196  sulfotransferase  25.34 
 
 
648 aa  137  5e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  47.59 
 
 
637 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00381  hypothetical protein  45.88 
 
 
437 aa  134  5e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  42.26 
 
 
739 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  46.9 
 
 
603 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1675  tetratricopeptide TPR_4  24.27 
 
 
542 aa  132  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  42.26 
 
 
909 aa  131  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  25.85 
 
 
1764 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0601  sulfotransferase  23.66 
 
 
525 aa  130  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3035  sulfotransferase  24.75 
 
 
677 aa  130  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.530133  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  32.06 
 
 
681 aa  130  7.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4275  TPR domain/sulfotransferase domain-containing protein  26.42 
 
 
527 aa  129  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3470  sulfotransferase  26.4 
 
 
532 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2501  sulfotransferase  23.19 
 
 
717 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.957515 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  44.14 
 
 
612 aa  127  5e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3132  sulfotransferase  23.15 
 
 
720 aa  126  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.915715  hitchhiker  0.000116891 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 
362 aa  125  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0534  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 
573 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  43.84 
 
 
816 aa  123  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0815  TPR repeat-containing protein  42.6 
 
 
235 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0605859  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3169  tetratricopeptide TPR_2  23.43 
 
 
604 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.120053  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02385  TPR domain protein  26.4 
 
 
652 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  23.89 
 
 
762 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  23.89 
 
 
762 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1051  sulfotransferase  24.11 
 
 
536 aa  120  7e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2992  tetratricopeptide TPR_2  27.04 
 
 
548 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0107405  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1262  sulfotransferase  25.37 
 
 
546 aa  117  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0215668 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1812  TPR repeat-containing protein  22.15 
 
 
713 aa  117  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.154682 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16741  hypothetical protein  44.3 
 
 
467 aa  116  6.9999999999999995e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  24.78 
 
 
530 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  21.47 
 
 
725 aa  115  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  24.17 
 
 
695 aa  114  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1727  sulfotransferase  30.57 
 
 
519 aa  114  3e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00214225  normal  0.298549 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2213  sulfotransferase  23.27 
 
 
656 aa  114  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0843  hypothetical protein  28.15 
 
 
322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.552979  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  28.94 
 
 
700 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  39.86 
 
 
425 aa  109  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3323  TPR repeat protein  21.6 
 
 
578 aa  108  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.96902  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  36.69 
 
 
780 aa  108  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  39.35 
 
 
435 aa  107  5e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0167  sulfotransferase  25.14 
 
 
488 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0768  sulfotransferase  24.6 
 
 
663 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1757  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.19 
 
 
530 aa  103  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3336  sulfotransferase  24.05 
 
 
670 aa  101  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.850036 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  39.86 
 
 
402 aa  100  5e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2649  sulfotransferase  28.39 
 
 
669 aa  100  8e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  42.75 
 
 
878 aa  98.6  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1174  sulfotransferase  22.47 
 
 
531 aa  95.5  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3141  sulfotransferase  22.26 
 
 
625 aa  95.5  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.423755  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1057  TPR domain/sulfotransferase domain protein  25.23 
 
 
549 aa  93.6  7e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0505037  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0890  sulfotransferase  22.68 
 
 
524 aa  92.4  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42741  predicted protein  26.21 
 
 
742 aa  92  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1288  sulfotransferase  25.62 
 
 
636 aa  91.3  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.494721  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.01 
 
 
810 aa  90.1  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2900  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
538 aa  89.7  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0817  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 
661 aa  87.8  4e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.975986  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2846  sulfotransferase  26.03 
 
 
889 aa  87  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03828  tetratricopeptide repeat family  25.52 
 
 
533 aa  86.3  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2112  sulfotransferase  20.24 
 
 
624 aa  85.1  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.214082 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  37.6 
 
 
217 aa  84  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  34.53 
 
 
622 aa  83.6  0.000000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4327  TPR domain-containing protein  25.21 
 
 
899 aa  82.8  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 
3145 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.82 
 
 
725 aa  81.6  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.66 
 
 
632 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  28.78 
 
 
764 aa  81.3  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  32.94 
 
 
594 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  33.11 
 
 
587 aa  77.4  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  35.34 
 
 
4489 aa  77.4  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  26.19 
 
 
279 aa  77  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2992  sulfotransferase  20.88 
 
 
634 aa  76.3  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.49268  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  28.57 
 
 
795 aa  75.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  33.33 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.88 
 
 
620 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2322  TPR repeat-containing protein  41.44 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  23.23 
 
 
714 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.48 
 
 
1034 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.43 
 
 
620 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  32.65 
 
 
505 aa  72.4  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 
441 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>