More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0065 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  100 
 
 
930 aa  1914  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  44.07 
 
 
696 aa  481  1e-134  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  2.05441e-05 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  41.59 
 
 
1523 aa  432  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  40.91 
 
 
1454 aa  417  1e-115  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  41.78 
 
 
1163 aa  417  1e-115  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  39.88 
 
 
1363 aa  417  1e-115  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  40.04 
 
 
1236 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  37.81 
 
 
1652 aa  401  1e-110  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  42.91 
 
 
1557 aa  393  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  39.16 
 
 
947 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  36.78 
 
 
1188 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  37.66 
 
 
1364 aa  372  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  55.77 
 
 
617 aa  365  2e-99  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  36.36 
 
 
1868 aa  362  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  38.48 
 
 
1221 aa  360  5e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  36.27 
 
 
1247 aa  359  2e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  55.77 
 
 
623 aa  358  2e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  35.56 
 
 
1474 aa  354  5e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  36.19 
 
 
1196 aa  353  7e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  37.31 
 
 
1686 aa  345  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  34.68 
 
 
1193 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  31.65 
 
 
1831 aa  343  9e-93  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  38.45 
 
 
1510 aa  343  1e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  39.02 
 
 
1357 aa  339  2e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.99 
 
 
1481 aa  338  2e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  36.94 
 
 
1367 aa  337  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  37.55 
 
 
1553 aa  336  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  34.69 
 
 
1552 aa  333  8e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  39.22 
 
 
919 aa  331  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  37.33 
 
 
1789 aa  329  1e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  35.07 
 
 
1190 aa  328  2e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  37.74 
 
 
1443 aa  320  6e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  34.05 
 
 
1760 aa  317  5e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3060  serine/threonine protein kinase  49.36 
 
 
602 aa  317  8e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799021  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  32.44 
 
 
1262 aa  315  2e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  36.73 
 
 
1711 aa  315  3e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  35.32 
 
 
1211 aa  311  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  3.73823e-05 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1432  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.43 
 
 
1609 aa  310  6e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1417  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.18 
 
 
1598 aa  308  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.29 
 
 
1583 aa  306  9e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  34.76 
 
 
1229 aa  306  1e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  35.82 
 
 
1217 aa  302  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3296  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.06 
 
 
1547 aa  301  5e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.558559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  34.75 
 
 
1607 aa  296  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  32.69 
 
 
1901 aa  294  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  33.58 
 
 
1213 aa  293  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  31.88 
 
 
1242 aa  292  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  33.46 
 
 
728 aa  291  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  39.35 
 
 
1656 aa  291  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  28.67 
 
 
1188 aa  291  5e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  37.3 
 
 
1714 aa  291  5e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  36 
 
 
1661 aa  288  4e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.85 
 
 
1626 aa  288  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3823  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.59 
 
 
1617 aa  288  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0782446 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1343  WD40 repeat, subgroup  34.66 
 
 
1280 aa  287  7e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365079  normal  0.118221 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  30.95 
 
 
1416 aa  286  2e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  32.73 
 
 
1599 aa  283  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  31.97 
 
 
505 aa  281  3e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  31.72 
 
 
1684 aa  278  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.3 
 
 
1267 aa  277  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  32.95 
 
 
1348 aa  276  1e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  31.87 
 
 
1766 aa  274  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  28.98 
 
 
1208 aa  271  6e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4789  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  30.77 
 
 
1623 aa  270  9e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.702991  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  30.75 
 
 
1807 aa  270  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  34.36 
 
 
1161 aa  268  3e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  31.96 
 
 
1176 aa  266  1e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  34.17 
 
 
1161 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  32.85 
 
 
1177 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  30.09 
 
 
1484 aa  262  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  44.91 
 
 
1240 aa  257  6e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  31.56 
 
 
1411 aa  252  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  30.91 
 
 
1164 aa  253  2e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  30.67 
 
 
1344 aa  250  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  33.33 
 
 
924 aa  248  3e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  31.81 
 
 
1373 aa  246  1e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17344e-06 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3213  WD-40 repeat-containing protein  30.95 
 
 
1304 aa  245  3e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.297689  normal  0.929062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  30.75 
 
 
1041 aa  242  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  30.62 
 
 
1330 aa  243  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  35.45 
 
 
1878 aa  242  3e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  29.07 
 
 
1856 aa  242  3e-62  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  40.73 
 
 
742 aa  240  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.3 
 
 
676 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  31.28 
 
 
1858 aa  240  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3295  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.88 
 
 
1398 aa  239  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  37.61 
 
 
740 aa  239  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  31.61 
 
 
608 aa  238  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  28.12 
 
 
687 aa  238  6e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.38 
 
 
1039 aa  236  2e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  27.61 
 
 
1214 aa  234  6e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.35295e-06 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02021  conserved hypothetical protein  30.14 
 
 
1311 aa  230  9e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.836257  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  30.45 
 
 
1399 aa  230  9e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  26.71 
 
 
1209 aa  229  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  37.01 
 
 
1599 aa  228  5e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.76 
 
 
630 aa  228  6e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  29.98 
 
 
1209 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.49 
 
 
682 aa  226  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.54 
 
 
677 aa  225  3e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  37.39 
 
 
344 aa  224  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.25 
 
 
664 aa  224  5e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>