More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_55450 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  67.25 
 
 		 783 aa  979    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  56.47 
 
 		 793 aa  728    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  96.01 
 
 		 803 aa  1388    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  100 
 
 		 803 aa  1587    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  45.22 
 
 		 781 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  45.08 
 
 		 781 aa  536  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  42.99 
 
 		 738 aa  535  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  43.94 
 
 		 747 aa  529  1e-149  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  44.91 
 
 		 783 aa  526  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  44.62 
 
 		 728 aa  525  1e-147  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  42.2 
 
 		 789 aa  521  1e-146  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  42.47 
 
 		 805 aa  509  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  42.34 
 
 		 736 aa  512  1e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  43.26 
 
 		 753 aa  511  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  42.25 
 
 		 740 aa  511  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  43.6 
 
 		 807 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  43.85 
 
 		 717 aa  504  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  42.53 
 
 		 803 aa  496  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  44.16 
 
 		 804 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  43.06 
 
 		 744 aa  490  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  42.34 
 
 		 814 aa  491  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  42.7 
 
 		 757 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  42.55 
 
 		 750 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  42.55 
 
 		 757 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  38.89 
 
 		 787 aa  485  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  42.41 
 
 		 757 aa  482  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  42.41 
 
 		 757 aa  482  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  42.41 
 
 		 757 aa  482  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  42.41 
 
 		 757 aa  482  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3936  general secretion pathway protein D  41.58 
 
 		 791 aa  481  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  40.9 
 
 		 777 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  41.54 
 
 		 771 aa  475  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  32.4 
 
 		 750 aa  316  9.999999999999999e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  49.6 
 
 		 702 aa  308  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  33 
 
 		 758 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  31.55 
 
 		 703 aa  289  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  47.23 
 
 		 810 aa  286  9e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1274  type II protein secretion LspD  29.34 
 
 		 791 aa  276  1.0000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  33.03 
 
 		 776 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1275  type II protein secretion LspD  29.78 
 
 		 791 aa  276  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  31.98 
 
 		 682 aa  274  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  38.54 
 
 		 655 aa  272  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  29.62 
 
 		 675 aa  271  5e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1073  general secretion pathway protein D  44.67 
 
 		 774 aa  270  5.9999999999999995e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  30.89 
 
 		 748 aa  264  4.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  29.4 
 
 		 710 aa  261  5.0000000000000005e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  29.03 
 
 		 705 aa  257  6e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  29.45 
 
 		 650 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  29.3 
 
 		 654 aa  256  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  29.45 
 
 		 654 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  27.89 
 
 		 662 aa  253  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  47.74 
 
 		 787 aa  251  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  46.11 
 
 		 670 aa  250  6e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3244  type II and III secretion system protein  45.94 
 
 		 781 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2401  general secretion pathway protein D  42.02 
 
 		 673 aa  246  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.539176  hitchhiker  0.000473161 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0063  general secretion pathway protein D  45.58 
 
 		 775 aa  245  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0008  Type II secretion system gspD  45.23 
 
 		 774 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0062  general secretion pathway protein D  45.23 
 
 		 774 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348368  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0081  general secretion pathway protein D  44.88 
 
 		 780 aa  243  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0730  general secretion pathway protein D  29.93 
 
 		 892 aa  237  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116775  normal  0.828359 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  27.31 
 
 		 686 aa  215  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  27.31 
 
 		 686 aa  215  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  27.31 
 
 		 686 aa  215  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  27.25 
 
 		 686 aa  214  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  27.15 
 
 		 686 aa  212  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  29.39 
 
 		 689 aa  211  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  31.64 
 
 		 681 aa  210  1e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0381  general secretion pathway protein D  39.88 
 
 		 650 aa  208  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.693227  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4180  general secretion pathway protein D  30.93 
 
 		 650 aa  207  7e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  43.29 
 
 		 634 aa  207  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  32.77 
 
 		 748 aa  207  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3580  helix-turn-helix, AraC type  39.58 
 
 		 666 aa  206  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18181  normal  0.716334 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  27.86 
 
 		 672 aa  206  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  27.06 
 
 		 696 aa  204  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0141  general secretion pathway protein D  39.23 
 
 		 725 aa  204  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  38.58 
 
 		 641 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  28.14 
 
 		 658 aa  202  1.9999999999999998e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  36.57 
 
 		 697 aa  200  9e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4206  general secretion pathway protein D  36.51 
 
 		 705 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.016769  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  35.57 
 
 		 724 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0153  general secretion pathway protein D  36.46 
 
 		 706 aa  198  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0244288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2927  general secretion pathway protein D  34.06 
 
 		 645 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319356  normal  0.290619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0153  general secretion pathway protein D  36.02 
 
 		 705 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109917  normal  0.0543101 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0149  general secretion pathway protein D  36.39 
 
 		 704 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  36.02 
 
 		 703 aa  195  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0156  general secretion pathway protein D  34.86 
 
 		 700 aa  195  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00486082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0151  general secretion pathway protein D  34.86 
 
 		 700 aa  195  3e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.124297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0151  general secretion pathway protein D  35.48 
 
 		 702 aa  194  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0216761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  34.52 
 
 		 710 aa  194  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4734  general secretion pathway protein D  36.67 
 
 		 714 aa  194  6e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000953864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  36.47 
 
 		 716 aa  193  8e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0166  general secretion pathway protein D  35.75 
 
 		 704 aa  193  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  36.59 
 
 		 635 aa  193  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0169  type II and III secretion system protein  35.75 
 
 		 703 aa  191  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000616881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1087  general secretion pathway protein D  38.75 
 
 		 584 aa  190  7e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.57571  normal  0.616621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1046  general secretion pathway protein D  38.75 
 
 		 584 aa  190  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.603917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  40.65 
 
 		 658 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2173  general secretion pathway protein D  27.5 
 
 		 745 aa  188  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2608  general secretion pathway protein D  27.89 
 
 		 842 aa  187  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  38.99 
 
 		 636 aa  187  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>