More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1892 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_1876  permease  56.62 
 
 
804 aa  841    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  100 
 
 
798 aa  1590    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  44.06 
 
 
808 aa  608  9.999999999999999e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  44.73 
 
 
835 aa  568  1e-160  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  39.03 
 
 
802 aa  554  1e-156  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  39.7 
 
 
805 aa  538  1e-151  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  41.76 
 
 
806 aa  506  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  38.17 
 
 
810 aa  477  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  37.5 
 
 
810 aa  462  1e-129  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  36.1 
 
 
803 aa  446  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.09 
 
 
817 aa  430  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  35.75 
 
 
821 aa  412  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.32 
 
 
882 aa  405  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.11 
 
 
823 aa  404  1e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  35.34 
 
 
814 aa  401  9.999999999999999e-111  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  35.08 
 
 
816 aa  398  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  37.36 
 
 
871 aa  396  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  36.13 
 
 
809 aa  391  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.54 
 
 
807 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.83 
 
 
813 aa  383  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.05 
 
 
822 aa  385  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  34.78 
 
 
817 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  34.16 
 
 
796 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  35.51 
 
 
869 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.5 
 
 
808 aa  375  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  32.44 
 
 
804 aa  372  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  33.78 
 
 
809 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  35.3 
 
 
805 aa  369  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.39 
 
 
915 aa  366  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  34.34 
 
 
807 aa  364  3e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  32.06 
 
 
797 aa  355  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  36.39 
 
 
803 aa  349  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  34.49 
 
 
811 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  32.82 
 
 
887 aa  344  2.9999999999999997e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.05 
 
 
809 aa  340  9e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  34.35 
 
 
816 aa  340  9e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.15 
 
 
805 aa  337  3.9999999999999995e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  33.91 
 
 
800 aa  335  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.62 
 
 
821 aa  333  5e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  34.92 
 
 
808 aa  333  8e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.48 
 
 
893 aa  333  1e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  32.74 
 
 
831 aa  331  4e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  33.54 
 
 
819 aa  330  5.0000000000000004e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.15 
 
 
805 aa  329  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.12 
 
 
874 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  31.45 
 
 
803 aa  328  2.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.21 
 
 
805 aa  327  4.0000000000000003e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.65 
 
 
805 aa  326  1e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.55 
 
 
849 aa  323  8e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.69 
 
 
878 aa  322  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  32.93 
 
 
865 aa  320  5e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.74 
 
 
913 aa  318  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.83 
 
 
810 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.3 
 
 
844 aa  313  1e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.52 
 
 
883 aa  310  5e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.37 
 
 
919 aa  304  5.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  30.92 
 
 
887 aa  303  8.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  29.6 
 
 
845 aa  303  9e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.79 
 
 
855 aa  294  5e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  34.06 
 
 
808 aa  293  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.74 
 
 
817 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  28.75 
 
 
810 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  32.94 
 
 
848 aa  282  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.5 
 
 
820 aa  281  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.72 
 
 
812 aa  281  4e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  33.95 
 
 
819 aa  280  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  30.15 
 
 
843 aa  279  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.72 
 
 
879 aa  275  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  27.28 
 
 
813 aa  275  3e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  30.87 
 
 
808 aa  271  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  31.54 
 
 
844 aa  270  8.999999999999999e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.37 
 
 
880 aa  267  7e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  27.02 
 
 
809 aa  261  2e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0021  permease  31.36 
 
 
861 aa  262  2e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.8 
 
 
862 aa  261  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.68 
 
 
884 aa  261  4e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.25 
 
 
888 aa  259  1e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  27.46 
 
 
810 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  25.51 
 
 
807 aa  246  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  30.39 
 
 
931 aa  238  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.35 
 
 
846 aa  233  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.29 
 
 
828 aa  231  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0925  protein of unknown function DUF214  25.29 
 
 
794 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1102  normal  0.614514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  24.71 
 
 
795 aa  140  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0960  protein of unknown function DUF214  25.44 
 
 
803 aa  134  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000834077  normal  0.437277 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4858  protein of unknown function DUF214  24.68 
 
 
809 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0512952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1806  protein of unknown function DUF214  22.52 
 
 
790 aa  127  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4368  protein of unknown function DUF214  22.75 
 
 
800 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.129517 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1215  protein of unknown function DUF214  25.74 
 
 
791 aa  124  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000164974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0936  protein of unknown function DUF214  27.09 
 
 
793 aa  124  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146106  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  25.41 
 
 
802 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1450  protein of unknown function DUF214  22.21 
 
 
789 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.264856  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  27.4 
 
 
805 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0603  protein of unknown function DUF214  22.47 
 
 
809 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.237353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4899  protein of unknown function DUF214  23.06 
 
 
802 aa  122  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000216897  normal  0.089059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  25.97 
 
 
808 aa  121  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4619  protein of unknown function DUF214  25.31 
 
 
817 aa  121  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.231177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5137  protein of unknown function DUF214  26.13 
 
 
792 aa  120  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.11243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4630  protein of unknown function DUF214  28 
 
 
816 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  24.01 
 
 
795 aa  120  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>