More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1902 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1902  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 789 aa  1581    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0584402  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2529  general secretion pathway protein D  45.93 
 
 		 728 aa  553  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151487  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3392  type II and III secretion system protein  46.01 
 
 		 783 aa  545  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849213  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3114  general secretory pathway D transmembrane protein  46.11 
 
 		 805 aa  531  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.442209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3399  general secretion pathway protein D  44.7 
 
 		 807 aa  530  1e-149  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3136  general secretion pathway protein D  45.15 
 
 		 736 aa  528  1e-148  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.81817  hitchhiker  0.003504 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3229  type II and III secretion system protein:NolW-like  43.95 
 
 		 804 aa  520  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3052  general secretion pathway protein D  42.71 
 
 		 803 aa  520  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0756  general secretion pathway protein D  44.85 
 
 		 738 aa  513  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.2147 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5697  general secretion pathway protein D  43.84 
 
 		 787 aa  514  1e-144  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0549216 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1329  type II and III secretion system protein  45.06 
 
 		 747 aa  508  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3427  general secretion pathway protein D  43.48 
 
 		 753 aa  499  1e-140  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000756806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55450  putative type II secretion system protein  40.97 
 
 		 803 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000555876  normal  0.092125 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4825  putative type II secretion system protein  41.1 
 
 		 803 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0565778  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0007  general secretion pathway protein D  42.34 
 
 		 744 aa  497  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7395  general secretion pathway protein D  43 
 
 		 717 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103776  normal  0.699876 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2211  general secretion pathway protein D  41.76 
 
 		 793 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.971398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0007  general secretion pathway protein D  42.51 
 
 		 757 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3529  general secretion pathway protein D  42.84 
 
 		 740 aa  492  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22216  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2786  general secretion pathway protein D  42.49 
 
 		 757 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136433  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0220  general secretion pathway protein D  42.49 
 
 		 750 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.960002  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3175  type II and III secretion system protein  41.58 
 
 		 783 aa  490  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.114854  normal  0.0336738 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3518  general secretion pathway protein D  42.49 
 
 		 757 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1890  general secretion pathway protein D  42.49 
 
 		 757 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.189433  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2662  general secretion pathway protein D  42.49 
 
 		 757 aa  491  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0007  general secretion pathway protein D  42.12 
 
 		 757 aa  490  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0646  general secretion pathway protein D  42.12 
 
 		 781 aa  483  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255398  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4501  putative general secretory pathway protein D  41.17 
 
 		 814 aa  482  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.322148 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0667  general secretion pathway protein D  41.98 
 
 		 781 aa  481  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.509623 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0062  general secretion pathway protein D  41.56 
 
 		 771 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0052  general secretion pathway protein D  41.5 
 
 		 777 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2401  general secretion pathway protein D  34.06 
 
 		 673 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.539176  hitchhiker  0.000473161 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1954  type II and III secretion system protein  32.39 
 
 		 750 aa  324  4e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0109975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0250  type II and III secretion system protein  34.35 
 
 		 703 aa  323  9.999999999999999e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.980463  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2927  general secretion pathway protein D  34.41 
 
 		 645 aa  317  7e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.319356  normal  0.290619 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1416  general secretion pathway protein D  33.73 
 
 		 634 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0141  general secretion pathway protein D  34.7 
 
 		 725 aa  309  1.0000000000000001e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4180  general secretion pathway protein D  34.97 
 
 		 650 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2591  general secretion pathway protein D  32.99 
 
 		 682 aa  308  3e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0683  general secretion pathway protein D  31.18 
 
 		 641 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00528314  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2924  general secretion pathway protein D  31.56 
 
 		 675 aa  306  1.0000000000000001e-81  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2653  type II and III secretion system protein  35.33 
 
 		 748 aa  301  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0231  general secretion pathway protein D  31.27 
 
 		 689 aa  300  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3420  general secretion pathway protein D  32.79 
 
 		 758 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.454827  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1274  type II protein secretion LspD  33.38 
 
 		 791 aa  295  3e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03956  general secretion pathway protein D  31.39 
 
 		 681 aa  292  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00601  general secretion pathway protein D  31.23 
 
 		 658 aa  292  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1275  type II protein secretion LspD  33.38 
 
 		 791 aa  291  3e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0542  type II and III secretion system protein  48.54 
 
 		 702 aa  288  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40320  secretion protein XqhA  32.63 
 
 		 776 aa  288  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.386319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1041  general secretion pathway protein D  30.63 
 
 		 799 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0180927  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001892  general secretion pathway protein D/type II secretion outermembrane pore forming protein (PulD)  29.6 
 
 		 672 aa  281  5e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0381  general secretion pathway protein D  30.82 
 
 		 650 aa  280  8e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.693227  normal  0.206619 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0097  general secretion pathway protein D  29.78 
 
 		 662 aa  279  2e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.395857  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0329  general secretion pathway protein D, putative  31.91 
 
 		 632 aa  278  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4358  general secretion pathway protein D  30.07 
 
 		 724 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000917218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3244  type II and III secretion system protein  43.82 
 
 		 781 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.549479 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0917  general secretion pathway protein D  45.11 
 
 		 810 aa  276  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.460737  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0063  general secretion pathway protein D  42.7 
 
 		 775 aa  274  5.000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3364  type II and III secretion system protein:NolW-like  32.39 
 
 		 636 aa  273  7e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000168391  normal  0.0105147 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3519  general secretion pathway protein D  32.49 
 
 		 654 aa  273  8.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0147755  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0121  type II and III secretion system protein  30.24 
 
 		 705 aa  272  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00685103  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0105  general secretion pathway protein D  28.94 
 
 		 710 aa  272  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0388  general secretion pathway protein D  32.34 
 
 		 654 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0226374 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0609  general secretion pathway protein D  30.67 
 
 		 635 aa  271  5e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.73081e-17 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3936  general secretion pathway protein D  43.06 
 
 		 791 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.765741 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0062  general secretion pathway protein D  43.39 
 
 		 774 aa  270  7e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348368  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0008  Type II secretion system gspD  43.39 
 
 		 774 aa  270  7e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0388  general secretion pathway protein D  32.05 
 
 		 650 aa  268  2e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0081  general secretion pathway protein D  42.82 
 
 		 780 aa  269  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2306  general secretion pathway protein D  31.04 
 
 		 674 aa  268  4e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1073  general secretion pathway protein D  45.14 
 
 		 774 aa  265  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1281  general secretion pathway protein D  29.56 
 
 		 648 aa  264  6e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0144  general secretion pathway protein D  28.81 
 
 		 710 aa  262  2e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0730  general secretion pathway protein D  29.66 
 
 		 892 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.116775  normal  0.828359 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0003  general secretion pathway protein D  30.58 
 
 		 655 aa  249  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0438473 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1004  general secretion pathway protein D  28.79 
 
 		 640 aa  248  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0953  general secretion pathway protein D  28.79 
 
 		 640 aa  248  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.198389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3269  general secretion pathway protein D  28.79 
 
 		 640 aa  248  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000207036  hitchhiker  0.00000000000000178028 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0225  general secretion pathway protein D  40.28 
 
 		 655 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3070  general secretion pathway protein D  47.53 
 
 		 787 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00279328 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2370  general secretion pathway protein D  38.67 
 
 		 670 aa  232  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0720  general secretion pathway protein D  28.13 
 
 		 904 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.566529  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02838  GspD, hypothetical type II secretion protein  36.1 
 
 		 686 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000664316  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3427  general secretion pathway protein D  37.33 
 
 		 686 aa  221  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0721  general secretion pathway protein D  28.12 
 
 		 902 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.451172  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02788  hypothetical protein  36.1 
 
 		 686 aa  221  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000655056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3138  general secretion pathway protein D  37.33 
 
 		 686 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3247  general secretion pathway protein GspD  37.33 
 
 		 686 aa  220  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0686  type II and III secretion system protein  27.6 
 
 		 897 aa  219  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.433191  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3315  general secretion pathway protein D  27.45 
 
 		 696 aa  216  1.9999999999999998e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4591  general secretion pathway protein D  34.75 
 
 		 697 aa  207  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4160  general secretion pathway protein D  42.73 
 
 		 748 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1087  general secretion pathway protein D  34.3 
 
 		 584 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.57571  normal  0.616621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1046  general secretion pathway protein D  31.82 
 
 		 584 aa  194  4e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.603917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23970  general secretion pathway protein D  40.45 
 
 		 658 aa  194  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.598956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2028  general secretion pathway protein D  39.43 
 
 		 658 aa  193  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3580  helix-turn-helix, AraC type  36.63 
 
 		 666 aa  192  1e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.18181  normal  0.716334 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1299  general secretion pathway protein D  35.96 
 
 		 716 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3567  general secretion pathway protein D  35.23 
 
 		 703 aa  189  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000019891  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>