More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3245 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3245  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 212 aa  423  1e-117  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0167  TPR repeat-containing protein  74.74 
 
 		 190 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  59.41 
 
 		 454 aa  234  8e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2765  TPR repeat-containing protein  57.36 
 
 		 751 aa  231  6e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  57.87 
 
 		 1328 aa  231  8.000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  54.04 
 
 		 568 aa  228  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.04 
 
 		 568 aa  228  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  53.03 
 
 		 767 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  55.33 
 
 		 1215 aa  220  9.999999999999999e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54.55 
 
 		 771 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1773  NB-ARC domain protein  51.52 
 
 		 672 aa  211  4.9999999999999996e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  52.79 
 
 		 1507 aa  211  7.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  54 
 
 		 787 aa  210  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  51.27 
 
 		 924 aa  210  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  53.54 
 
 		 911 aa  209  3e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  53.03 
 
 		 444 aa  205  3e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1583  tetratricopeptide TPR_4  54.31 
 
 		 362 aa  205  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  52 
 
 		 919 aa  205  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  51.27 
 
 		 725 aa  202  4e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  52.5 
 
 		 785 aa  198  3.9999999999999996e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2528  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  51.01 
 
 		 991 aa  197  9e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.122653  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2707  kinesin light chain  51.56 
 
 		 311 aa  195  4.0000000000000005e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  53.3 
 
 		 1424 aa  195  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0416  TPR repeat-containing protein  48.73 
 
 		 481 aa  195  5.000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.80889 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  55.05 
 
 		 885 aa  188  5.999999999999999e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  46.94 
 
 		 1039 aa  186  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1366  hypothetical protein  49.24 
 
 		 825 aa  185  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  50 
 
 		 843 aa  186  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  44.67 
 
 		 1105 aa  183  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3866  NB-ARC domain protein  48.99 
 
 		 680 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.641069 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5265  TPR repeat-containing protein  45.69 
 
 		 284 aa  181  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  42.78 
 
 		 1288 aa  172  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.41 
 
 		 1186 aa  171  7.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1822  NB-ARC  47.72 
 
 		 977 aa  169  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244157  normal  0.101864 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  43.65 
 
 		 799 aa  167  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08457  Pfs, NB-ARC and TPR domain protein (JCVI)  42.78 
 
 		 1131 aa  166  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1587  NB-ARC  45.18 
 
 		 1044 aa  165  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.257434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3158  TPR repeat-containing protein  41.84 
 
 		 814 aa  165  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.385095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2876  NB-ARC domain protein  34.43 
 
 		 822 aa  155  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  44.39 
 
 		 493 aa  154  8e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08322  conserved hypothetical protein  36.6 
 
 		 1050 aa  145  3e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  41 
 
 		 443 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1566  TPR repeat-containing protein  42.21 
 
 		 669 aa  144  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00212448  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1855  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.45 
 
 		 667 aa  143  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.329592  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09426  conserved hypothetical protein  35.38 
 
 		 1262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.442713  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01580  conserved hypothetical protein  39.27 
 
 		 1128 aa  137  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0427699 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01071  conserved hypothetical protein  34.12 
 
 		 1185 aa  132  3.9999999999999996e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0324435  normal  0.67029 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5271  TPR repeat-containing protein  35.12 
 
 		 953 aa  132  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.650809  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10448  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G01710)  35.48 
 
 		 1488 aa  131  6.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.162575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2501  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  42.49 
 
 		 1036 aa  126  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2118  TPR repeat-containing protein  39.3 
 
 		 1028 aa  125  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  30.81 
 
 		 1550 aa  123  2e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1716  TPR repeat-containing protein  43.26 
 
 		 162 aa  123  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03881  conserved hypothetical protein  36.67 
 
 		 1125 aa  123  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.693693 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  35.24 
 
 		 732 aa  122  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3233  serine/threonine protein kinase  39.09 
 
 		 1290 aa  122  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.273331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3983  TPR repeat-containing protein  33.16 
 
 		 949 aa  121  8e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808044  normal  0.937608 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3695  Sel1 domain-containing protein  36.9 
 
 		 1475 aa  121  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.909134 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06956  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  37.04 
 
 		 1056 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5147  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 469 aa  115  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0779428  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2257  tetratricopeptide TPR_4  32.11 
 
 		 828 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  29.95 
 
 		 2145 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  35.64 
 
 		 1040 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0136  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 776 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.955072  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  36.82 
 
 		 963 aa  109  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  31.98 
 
 		 694 aa  108  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  33.84 
 
 		 919 aa  107  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5157  hypothetical protein  34.39 
 
 		 178 aa  107  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.208303  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08541  conserved hypothetical protein  28.99 
 
 		 577 aa  105  4e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  27.92 
 
 		 740 aa  102  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.97 
 
 		 968 aa  101  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4175  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.67 
 
 		 854 aa  100  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 		 937 aa  100  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1471  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 		 1283 aa  99.8  3e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.791072  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04339  conserved hypothetical protein  34.95 
 
 		 1146 aa  99  5e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.541265 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08545  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 1136 aa  98.2  8e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0820  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1212 aa  97.8  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.826533 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3272  hypothetical protein  32.03 
 
 		 801 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0494  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 1088 aa  93.2  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  28.27 
 
 		 1068 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  28.73 
 
 		 1404 aa  91.7  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  28.96 
 
 		 2413 aa  91.7  7e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0614  HI0933 family protein  30.73 
 
 		 1228 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.688496 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5601  serine/threonine protein kinase  36.73 
 
 		 900 aa  87.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5289  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 857 aa  87.8  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.752131  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  31.82 
 
 		 934 aa  86.3  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  28.14 
 
 		 708 aa  86.3  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1510  TPR repeat-containing protein  39.38 
 
 		 303 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0607189 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0409  TPR repeat-containing protein  31.49 
 
 		 851 aa  85.9  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.613133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1729  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 837 aa  85.1  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38879  predicted protein  29.01 
 
 		 807 aa  85.1  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.192146  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49558  predicted protein  30.05 
 
 		 1106 aa  84.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.022156  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5267  TPR repeat-containing protein  45.1 
 
 		 640 aa  83.2  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.433566  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05237  conserved hypothetical protein  33.09 
 
 		 551 aa  83.2  0.000000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00419082  hitchhiker  0.0029586 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3570  serine/threonine protein kinase  31.32 
 
 		 1479 aa  82.4  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0837409 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0641  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 966 aa  82.4  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.249187 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2310  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.57 
 
 		 841 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544847  normal  0.283617 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1530  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.72 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5159  TPR repeat-containing protein  29.38 
 
 		 279 aa  80.5  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.738281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>