More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2962 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  393  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  49.71 
 
 		 220 aa  165  5e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 198 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 201 aa  103  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 214 aa  92.4  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 		 198 aa  91.3  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  38.62 
 
 		 205 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 212 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 192 aa  86.3  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 211 aa  85.5  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  85.9  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  34.12 
 
 		 211 aa  85.9  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  33.83 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  34.38 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 221 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  37.27 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 213 aa  78.6  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 223 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  36.31 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  32.3 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  32.3 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  32.3 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  32.3 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  32.3 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  32.3 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  32.3 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 178 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 206 aa  65.9  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  32.06 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  59.62 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  57.69 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  57.69 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  57.69 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  59.62 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  56.36 
 
 		 204 aa  62  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 187 aa  62  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  55.36 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 202 aa  61.2  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  29.73 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  50.91 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 190 aa  58.2  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 125 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  40.32 
 
 		 390 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0811  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.646976  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  46.15 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 677 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>