97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3582 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  99.57 
 
 		 463 aa  929    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  933    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  933    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  65.3 
 
 		 465 aa  625  1e-178  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  64.37 
 
 		 436 aa  570  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  40.43 
 
 		 524 aa  323  5e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  38.48 
 
 		 516 aa  301  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  35.71 
 
 		 496 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  37.99 
 
 		 512 aa  290  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  35.93 
 
 		 494 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  38.22 
 
 		 507 aa  286  4e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  36.08 
 
 		 498 aa  285  9e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  36.44 
 
 		 500 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  34.66 
 
 		 511 aa  265  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  34.53 
 
 		 520 aa  264  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  35.88 
 
 		 500 aa  256  6e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  34.72 
 
 		 511 aa  256  7e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  33.76 
 
 		 480 aa  256  8e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  36.7 
 
 		 500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  31.89 
 
 		 549 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  29.17 
 
 		 472 aa  238  2e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  31.18 
 
 		 519 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  29.5 
 
 		 1033 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  29.02 
 
 		 538 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  28.36 
 
 		 539 aa  194  3e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  27.86 
 
 		 537 aa  192  1e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  31.8 
 
 		 450 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  25.69 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  24.65 
 
 		 436 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  27.96 
 
 		 437 aa  124  5e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  25.5 
 
 		 447 aa  119  9e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  25.86 
 
 		 465 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  27.43 
 
 		 452 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  24.02 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  25.95 
 
 		 435 aa  100  5e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  20.85 
 
 		 428 aa  96.3  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  26.06 
 
 		 428 aa  96.3  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  20.43 
 
 		 459 aa  95.1  3e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  23.86 
 
 		 454 aa  94.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  22.74 
 
 		 722 aa  93.6  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  25.11 
 
 		 489 aa  93.6  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  20.22 
 
 		 459 aa  92.4  2e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  21.44 
 
 		 431 aa  87  6e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  23.42 
 
 		 538 aa  85.1  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  25.37 
 
 		 532 aa  80.5  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  23.67 
 
 		 1293 aa  79  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  25.16 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  26.01 
 
 		 460 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  21.81 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  26.34 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  19.8 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  23.33 
 
 		 421 aa  67.4  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  24.45 
 
 		 449 aa  67  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  24.63 
 
 		 491 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  27.65 
 
 		 448 aa  65.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  27.7 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  19.16 
 
 		 427 aa  61.2  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  24.46 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  19.63 
 
 		 427 aa  60.5  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  24.88 
 
 		 370 aa  59.3  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3903  UDP-galactopyranose mutase  33.72 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  22.14 
 
 		 441 aa  57.4  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  24.23 
 
 		 436 aa  57  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0404  FAD dependent oxidoreductase  23.33 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  25.08 
 
 		 427 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0291  protoporphyrinogen oxidase, putative  21.57 
 
 		 412 aa  54.3  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695837  normal  0.0192055 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  23.63 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  23.42 
 
 		 367 aa  53.5  0.000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  24.77 
 
 		 427 aa  53.5  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  25.71 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5043  UDP-galactopyranose mutase  27.07 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  25.71 
 
 		 383 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0168  hypothetical protein  25.63 
 
 		 414 aa  52.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  25.71 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  34.59 
 
 		 421 aa  50.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  23.29 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  25.14 
 
 		 509 aa  47.8  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3621  UDP-galactopyranose mutase  27.32 
 
 		 372 aa  47.4  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.585126  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0811  phytoene dehydrogenase  31.3 
 
 		 523 aa  47.4  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0324739  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  45.76 
 
 		 438 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  23.55 
 
 		 429 aa  47  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  38.54 
 
 		 462 aa  46.6  0.0009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  35.58 
 
 		 437 aa  46.6  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  24.62 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  31.15 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_715  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 500 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5440  UDP-galactopyranose mutase  25.48 
 
 		 369 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  25.08 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  21.32 
 
 		 437 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3894  UDP-galactopyranose mutase  25.24 
 
 		 391 aa  45.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  25.87 
 
 		 373 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  43.75 
 
 		 439 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0088  UDP-galactopyranose mutase  31.14 
 
 		 390 aa  44.3  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616523  normal  0.0498418 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  43.1 
 
 		 462 aa  44.3  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  24.19 
 
 		 447 aa  43.9  0.007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0731  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  42.59 
 
 		 500 aa  43.1  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.444322  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  25.29 
 
 		 467 aa  43.1  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>