More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_00320 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_00320  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  100 
 
 
302 aa  608  1e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06540  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  64.23 
 
 
278 aa  353  2e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23500  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  56.1 
 
 
306 aa  322  7e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23720  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  54.61 
 
 
347 aa  296  2e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08000  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  50.56 
 
 
296 aa  243  1.9999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.389173  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1223  transcriptional regulator, AraC family  30.86 
 
 
284 aa  84.3  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0726394  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6978  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain-like protein  28.38 
 
 
302 aa  79  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.16745 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2356  transcriptional regulator, AraC family  31.39 
 
 
296 aa  77  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  35.16 
 
 
330 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  42.05 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  20.79 
 
 
300 aa  67  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  20.74 
 
 
302 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2492  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3276  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
348 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3224  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3262  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4424  transcriptional regulator, AraC family  38.6 
 
 
337 aa  65.9  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.353998  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 
294 aa  65.1  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1350  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 
349 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956797  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  32.23 
 
 
333 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9341  AraC-type DNA-binding domain-containing protein- like protein  36.17 
 
 
309 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.455721  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3301  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 
331 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.688791  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 
315 aa  64.3  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4375  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 
348 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  31.25 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3991  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 
348 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4422  transcriptional regulator, AraC family  36.51 
 
 
327 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.465856  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 
155 aa  64.3  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5508  helix-turn-helix domain-containing protein  39.77 
 
 
158 aa  63.9  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  28.45 
 
 
291 aa  63.9  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  36.63 
 
 
331 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  40.38 
 
 
250 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  39.56 
 
 
325 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  28.32 
 
 
537 aa  63.9  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 
760 aa  63.5  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  35.63 
 
 
153 aa  63.5  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5186  putative AraC-like transcription regulator  37.11 
 
 
335 aa  63.5  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0167126 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3533  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 
348 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  29.17 
 
 
250 aa  63.2  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 
316 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 
145 aa  62.4  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5103  helix-turn-helix domain-containing protein  36.8 
 
 
307 aa  62.4  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  36.7 
 
 
300 aa  62.4  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  26.21 
 
 
332 aa  62  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0410  two component transcriptional regulator, AraC family  29.61 
 
 
233 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  36.78 
 
 
301 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  40.24 
 
 
346 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  39.56 
 
 
145 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  39.42 
 
 
250 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  32.95 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1600  helix-turn-helix domain-containing protein  41.51 
 
 
356 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.114816 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
323 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1220  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 
267 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.21436  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  39.53 
 
 
249 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 
146 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4617  transcriptional regulator, AraC family  40.19 
 
 
296 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.107807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 
317 aa  60.8  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 
146 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 
146 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7403  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 
316 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 
147 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  27.43 
 
 
204 aa  60.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6703  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 
329 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 
311 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2284  transcriptional regulator, AraC family  30.84 
 
 
274 aa  60.1  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6608  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 
330 aa  59.7  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  22.77 
 
 
529 aa  59.7  0.00000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0296  transcriptional regulator  32.95 
 
 
135 aa  60.1  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00196972  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5902  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 
356 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.271322  normal  0.206192 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  38.55 
 
 
168 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  38.55 
 
 
168 aa  59.7  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1813  transcription regulator protein  35.56 
 
 
303 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.881353  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0886  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 
332 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0936  transcriptional regulator, AraC family  38.37 
 
 
289 aa  59.7  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.352467  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 
327 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  34.69 
 
 
311 aa  59.3  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1228  two component transcriptional regulator, AraC family  20.18 
 
 
532 aa  59.3  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  39.24 
 
 
299 aa  59.3  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6170  AraC family transcriptional regulator  31.39 
 
 
356 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  38.64 
 
 
149 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 
311 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 
311 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3354  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 
234 aa  59.3  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174628 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 
292 aa  59.3  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2180  helix-turn-helix domain-containing protein  39.13 
 
 
281 aa  58.9  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.971115  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  39.02 
 
 
291 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  39.29 
 
 
150 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4545  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
311 aa  58.9  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 
290 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  29.88 
 
 
311 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 
362 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1012  transcriptional regulator, AraC family  33.7 
 
 
345 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0361  AraC family transcriptional regulator  34.78 
 
 
245 aa  58.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  39.33 
 
 
156 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 
329 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  34.88 
 
 
299 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1111  AraC family transcriptional regulator  22.22 
 
 
506 aa  58.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000128485  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0415  AraC family transcriptional regulator  25.12 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>