More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5557 on replicon NC_008703
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008703  Mkms_5557  DNA ligase (ATP)  100 
 
 		 328 aa  660    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.756283  normal  0.365478 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5528  DNA ligase (ATP)  57.28 
 
 		 329 aa  305  7e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.418116  normal  0.413759 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5930  DNA ligase (ATP)  57.28 
 
 		 329 aa  305  7e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.030161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5248  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  37.58 
 
 		 495 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.19885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20210  DNA polymerase LigD-like ligase domain-containing protein  39.37 
 
 		 376 aa  179  5.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0459497  normal  0.30843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2120  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  40.26 
 
 		 436 aa  170  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0836628  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2338  DNA polymerase LigD ligase domain-containing subunit  40.45 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.738121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1208  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  38.11 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.433755  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0501  DNA ligase D  36.13 
 
 		 863 aa  155  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.535245  normal  0.0602088 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0128  ATP-dependent DNA ligase  38.46 
 
 		 831 aa  155  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2097  ATP-dependent DNA ligase  34.71 
 
 		 848 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.64367  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3173  ATP-dependent DNA ligase  36.34 
 
 		 847 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0011  ATP-dependent DNA ligase  34.91 
 
 		 864 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0339968 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36910  ATP-dependent DNA ligase  35.71 
 
 		 840 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0564843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4915  ATP-dependent DNA ligase  36.77 
 
 		 763 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735483  normal  0.531274 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2635  ATP-dependent DNA ligase  34.53 
 
 		 833 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.232561  normal  0.576376 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1828  ATP-dependent DNA ligase  36.36 
 
 		 766 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13060  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  39.81 
 
 		 852 aa  151  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0779  ATP dependent DNA ligase  31.86 
 
 		 608 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.991922  normal  0.120219 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1695  ATP dependent DNA ligase  34.39 
 
 		 843 aa  149  6e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.616199  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0488  DNA ligase D  35.33 
 
 		 867 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.160576  normal  0.373477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4339  ATP-dependent DNA ligase  36.51 
 
 		 871 aa  147  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0275716 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0026  DNA ligase D  37.5 
 
 		 825 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.282762  hitchhiker  0.00000000359668 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3464  DNA ligase, ATP-dependent, putative  33.02 
 
 		 851 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2247  ATP-dependent DNA ligase  34.77 
 
 		 846 aa  145  6e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2977  DNA ligase D  33.33 
 
 		 845 aa  146  6e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.246159 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07110  ATP-dependent DNA ligase  35.99 
 
 		 847 aa  145  7.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1488  ATP dependent DNA ligase, central  34.52 
 
 		 320 aa  145  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4732  ATP-dependent DNA ligase  35.39 
 
 		 758 aa  144  1e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.333349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4352  ATP-dependent DNA ligase  35.71 
 
 		 758 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4438  ATP-dependent DNA ligase  35.71 
 
 		 758 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0862477 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2501  ATP-dependent DNA ligase  33.77 
 
 		 833 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0832  DNA ligase D  36.28 
 
 		 684 aa  143  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2233  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  35 
 
 		 858 aa  143  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2814  ATP dependent DNA ligase  34.95 
 
 		 358 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34920  DNA ligase D/DNA polymerase LigD  36.1 
 
 		 477 aa  142  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.140848  normal  0.164362 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2002  ATP dependent DNA ligase  33.75 
 
 		 316 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1305  DNA polymerase LigD ligase region  34.93 
 
 		 343 aa  142  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3003  ATP-dependent DNA ligase  33.43 
 
 		 882 aa  141  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0636525  normal  0.554248 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6876  ATP dependent DNA ligase  34.29 
 
 		 343 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.747253  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10956  ATP-dependent DNA ligase  35.37 
 
 		 759 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2631  DNA ligase D  32.89 
 
 		 865 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1951  DNA ligase D  34.19 
 
 		 822 aa  140  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00524792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3103  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  36.63 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6253  DNA polymerase LigD ligase subunit  34.77 
 
 		 343 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0234052  normal  0.998306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2651  ATP-dependent DNA ligase  32.9 
 
 		 832 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.819142  normal  0.570676 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0832  DNA ligase D  35.9 
 
 		 656 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3245  ATP-dependent DNA ligase  33.02 
 
 		 866 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.833216  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3260  ATP-dependent DNA ligase  32.25 
 
 		 833 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0784  ATP dependent DNA ligase  36.22 
 
 		 658 aa  138  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2523  ATP-dependent DNA ligase  36.06 
 
 		 837 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000543878 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3217  ATP-dependent DNA ligase  35.03 
 
 		 837 aa  136  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.311781 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0981  DNA ligase D  34.39 
 
 		 954 aa  136  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5730  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  33.78 
 
 		 350 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.996793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5079  ATP-dependent DNA ligase  34.06 
 
 		 901 aa  136  6.0000000000000005e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.795218  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1858  DNA ligase D  33.77 
 
 		 940 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.170046  normal  0.216644 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2396  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  34.53 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.788698 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5638  ATP-dependent DNA ligase  32.59 
 
 		 882 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5705  ATP-dependent DNA ligase  33.23 
 
 		 883 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7010  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  35.46 
 
 		 350 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2328  putative ATP-dependent DNA ligase  33.12 
 
 		 1001 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0455665  normal  0.455767 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6989  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  35.81 
 
 		 354 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5331  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  34.77 
 
 		 346 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.51032 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2519  ATP-dependent DNA ligase  32.67 
 
 		 939 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1769  ATP-dependent DNA ligase  33.66 
 
 		 918 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4716  DNA ligase D  34.73 
 
 		 815 aa  129  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.795355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5341  ATP-dependent DNA ligase  32.29 
 
 		 881 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0581605 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1177  ATP-dependent DNA ligase  31.19 
 
 		 853 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.601183  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03420  ATP dependent DNA ligase  28.26 
 
 		 285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2239  DNA ligase D  35.99 
 
 		 856 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.839838 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4532  DNA polymerase LigD, polymerase domain protein  32.42 
 
 		 797 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.684574  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1903  DNA polymerase LigD, ligase domain protein  36.25 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4772  DNA ligase D  35.03 
 
 		 651 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0382  DNA ligase D  32.13 
 
 		 644 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4309  DNA polymerase LigD ligase subunit  32.62 
 
 		 603 aa  127  4.0000000000000003e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8017  ATP-dependent DNA ligase  31.61 
 
 		 893 aa  126  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0836  DNA ligase D  35.02 
 
 		 683 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3968  ATP dependent DNA ligase  36.21 
 
 		 312 aa  125  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.697199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1235  ATP dependent DNA ligase  36.57 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.898519  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1729  DNA ligase D  28.25 
 
 		 813 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0256122  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2837  ATP-dependent DNA ligase  30.23 
 
 		 896 aa  123  5e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7782  putative ATP-dependent DNA ligase  32.34 
 
 		 351 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.119022 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0294  ATP-dependent DNA ligase  35.22 
 
 		 845 aa  122  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0952  ATP dependent DNA ligase  26.19 
 
 		 307 aa  122  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7582  DNA ligase D  32.39 
 
 		 651 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.373122 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0939  DNA ligase D  36.48 
 
 		 847 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3685  ATP-dependent DNA ligase  31.43 
 
 		 911 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4315  DNA ligase D  32.8 
 
 		 834 aa  121  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3852  ATP dependent DNA ligase  33.01 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4424  ATP-dependent DNA ligase  36.16 
 
 		 825 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0379748  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0998  DNA ligase D  30.23 
 
 		 861 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3490  ATP-dependent DNA ligase  31.41 
 
 		 930 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3303  ATP dependent DNA ligase  28.57 
 
 		 855 aa  120  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.300283  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0653  ATP-dependent DNA ligase  33.33 
 
 		 816 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5282  DNA ligase D  32.89 
 
 		 658 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.889453 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1660  ATP-dependent DNA ligase  30.77 
 
 		 847 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.600549  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0448  ATP-dependent DNA ligase  30.61 
 
 		 866 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3242  DNA ligase D  30.38 
 
 		 657 aa  119  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.99209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3982  DNA ligase D  34.11 
 
 		 837 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.242041 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2135  DNA ligase D  30.48 
 
 		 815 aa  117  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>