131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1213 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  55.16 
 
 		 1279 aa  1012    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  100 
 
 		 1361 aa  2727    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  46.74 
 
 		 769 aa  312  2.9999999999999997e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1578  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  31.14 
 
 		 448 aa  161  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.486208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2751  cell surface protein  29.31 
 
 		 728 aa  155  5.9999999999999996e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.270179  hitchhiker  0.0050065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  31.73 
 
 		 560 aa  145  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  32.38 
 
 		 938 aa  145  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  30.96 
 
 		 675 aa  144  9e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4398  Ig domain-containing protein  25.97 
 
 		 1316 aa  144  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0506972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  30.89 
 
 		 1042 aa  140  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1018  Ig domain-containing protein  26.84 
 
 		 892 aa  138  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0702  Ig domain-containing protein  23.77 
 
 		 1281 aa  136  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0834  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like  33.44 
 
 		 1202 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00874286  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  29.93 
 
 		 1001 aa  125  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  27.3 
 
 		 403 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  28.53 
 
 		 713 aa  118  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  23.66 
 
 		 4630 aa  117  2.0000000000000002e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  32.73 
 
 		 752 aa  116  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  28.38 
 
 		 960 aa  115  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0597  hypothetical protein  25.94 
 
 		 815 aa  115  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  28.91 
 
 		 658 aa  113  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  23.02 
 
 		 1300 aa  113  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2464  surface protein, putative  26.54 
 
 		 799 aa  112  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  32.39 
 
 		 669 aa  108  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  24.94 
 
 		 1821 aa  106  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  26.91 
 
 		 581 aa  105  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0367  Ig domain-containing protein group 2 domain-containing protein  43.71 
 
 		 688 aa  103  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2713  Ig-like, group 2  27.73 
 
 		 572 aa  102  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  26.83 
 
 		 685 aa  100  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  26.35 
 
 		 971 aa  100  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2898  Ig domain protein group 2 domain protein  27.77 
 
 		 575 aa  99.8  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3341  Ig domain-containing protein  26.37 
 
 		 1180 aa  96.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.498746  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2465  surface protein, putative  25.29 
 
 		 905 aa  95.9  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  26.64 
 
 		 996 aa  93.6  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  25.7 
 
 		 2042 aa  93.6  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  45.45 
 
 		 2122 aa  90.9  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0125  hypothetical protein  25.31 
 
 		 379 aa  87.8  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00889143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2805  Ig domain protein group 2 domain protein  27.86 
 
 		 575 aa  85.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0897712  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0492  hypothetical protein  28.33 
 
 		 195 aa  84.3  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.652654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1484  hypothetical protein  25.25 
 
 		 374 aa  82.8  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.481166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0494  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  36.7 
 
 		 171 aa  82.4  0.00000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  28.99 
 
 		 2638 aa  82.4  0.00000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  33.33 
 
 		 981 aa  80.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0926  Ig domain-containing protein  23.9 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  26.1 
 
 		 679 aa  77  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0925  Ig domain-containing protein  26.15 
 
 		 466 aa  74.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  35.25 
 
 		 910 aa  73.6  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  43.84 
 
 		 517 aa  72.8  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  39.02 
 
 		 1732 aa  72.4  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1315  Ig domain-containing protein  24.86 
 
 		 1976 aa  72.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.454335  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2433  putative surface protein  26.26 
 
 		 657 aa  71.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.780319  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1889  Ig domain-containing protein  24.92 
 
 		 331 aa  69.3  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2125  Ig domain-containing protein  29.33 
 
 		 472 aa  68.2  0.0000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0371  Ig domain-containing protein  29.81 
 
 		 472 aa  68.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2618  Ig domain-containing protein  24.44 
 
 		 399 aa  66.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0608  putative invasin  24.32 
 
 		 2795 aa  66.2  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2662  Ig domain protein group 2 domain protein  31.87 
 
 		 332 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10701  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  30.32 
 
 		 1009 aa  63.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1208  calcium-binding outer membrane-like protein  30.8 
 
 		 331 aa  63.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  32.06 
 
 		 1783 aa  63.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  22.99 
 
 		 819 aa  62  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2757  Ig domain protein group 2 domain protein  30.55 
 
 		 332 aa  61.6  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0842  putative surface protein  23.84 
 
 		 649 aa  59.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1864  hypothetical protein  35.56 
 
 		 656 aa  59.3  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.935351  normal  0.282908 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3727  hypothetical protein  29.23 
 
 		 331 aa  58.9  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0495  hypothetical protein  44.59 
 
 		 126 aa  58.5  0.0000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4427  Ig domain protein group 2 domain protein  28.35 
 
 		 1174 aa  58.5  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407706  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1208  Ig domain-containing protein  28.54 
 
 		 1048 aa  57.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2308  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.51 
 
 		 1776 aa  58.2  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  26.58 
 
 		 940 aa  57.4  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0314  cadherin  28.74 
 
 		 1021 aa  57.4  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  31.58 
 
 		 437 aa  57.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  37.5 
 
 		 316 aa  57.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  26.38 
 
 		 586 aa  56.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3347  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  31.2 
 
 		 160 aa  56.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.52168  normal  0.409524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3268  hypothetical protein  23.6 
 
 		 329 aa  56.2  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0855187 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1881  Ig-like, group 2  26.83 
 
 		 526 aa  56.2  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.132497  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2755  WD40 domain-containing protein  31.2 
 
 		 160 aa  56.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0125  hypothetical protein  30.63 
 
 		 418 aa  56.2  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2108  hypothetical protein  35.42 
 
 		 373 aa  55.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3623  hypothetical protein  24.41 
 
 		 514 aa  54.3  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  28.03 
 
 		 2552 aa  55.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  33.33 
 
 		 1263 aa  54.3  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0943  hypothetical protein  32.5 
 
 		 227 aa  53.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.986751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  37.68 
 
 		 882 aa  53.5  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4167  Ig domain protein group 2 domain protein  34.43 
 
 		 1164 aa  52.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608426  normal  0.0215824 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  36.08 
 
 		 1193 aa  52.4  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0522  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.01 
 
 		 172 aa  52  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4776  hypothetical protein  34.48 
 
 		 841 aa  52  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.174765  normal  0.0133719 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1797  hypothetical protein  29.89 
 
 		 405 aa  51.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.000000000782574  normal  1 
 
 
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  29.52 
 
 		 441 aa  51.2  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  31.43 
 
 		 446 aa  51.6  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1928  hypothetical protein  32.98 
 
 		 525 aa  50.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.361746  normal  0.675694 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  32.18 
 
 		 771 aa  50.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4138  WD40 domain protein beta Propeller  30.51 
 
 		 197 aa  50.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4178  WD40 domain protein beta Propeller  30.51 
 
 		 197 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4016  WD40 domain protein beta Propeller  35.56 
 
 		 169 aa  50.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.392857 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1644  hypothetical protein  31.03 
 
 		 416 aa  50.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2428  Ig domain-containing protein  27.52 
 
 		 466 aa  50.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.177832  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  29.6 
 
 		 441 aa  50.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>