More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2597 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  100 
 
 		 1238 aa  2532    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 1526 aa  416  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1504  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 1313 aa  365  2e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  35.36 
 
 		 782 aa  288  5e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0788  TPR repeat-containing protein  25.96 
 
 		 1101 aa  287  7e-76  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000957174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2583  TPR repeat-containing protein  35.57 
 
 		 1714 aa  269  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0791  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 1063 aa  264  8e-69  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0118647  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3695  Tetratricopeptide TPR_4  32.2 
 
 		 1914 aa  258  3e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.174493 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  32.36 
 
 		 1060 aa  237  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0475  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.09 
 
 		 1279 aa  229  2e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.894605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0414  hypothetical protein  50.19 
 
 		 490 aa  229  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0243225  normal  0.732046 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0966  hypothetical protein  34.22 
 
 		 2145 aa  216  2.9999999999999995e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.360119 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0963  hypothetical protein  36.13 
 
 		 1550 aa  215  4.9999999999999996e-54  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.424465 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5154  TPR repeat-containing protein  35.64 
 
 		 1596 aa  214  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.89 
 
 		 991 aa  211  8e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3705  TPR repeat-containing protein  22.76 
 
 		 1450 aa  208  6e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0896934  hitchhiker  0.00000122857 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0458  NB-ARC domain protein  30.87 
 
 		 941 aa  197  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  31.22 
 
 		 985 aa  197  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1376  TPR repeat-containing protein  28.76 
 
 		 1261 aa  184  8.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0670144  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  19.82 
 
 		 1611 aa  184  9.000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0166  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 454 aa  183  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0362369  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0529  tetratricopeptide TPR_2  32.58 
 
 		 1266 aa  180  1e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.696941 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  28.45 
 
 		 1180 aa  177  8e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3637  TPR repeat-containing protein  30.64 
 
 		 1285 aa  173  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  27.55 
 
 		 957 aa  174  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1591  TPR repeat-containing protein  33.44 
 
 		 412 aa  170  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  30.29 
 
 		 1328 aa  165  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2610  hypothetical protein  72.55 
 
 		 120 aa  164  7e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.577355  normal  0.387449 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2142  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.33 
 
 		 943 aa  163  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.624762  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2400  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 649 aa  162  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.179753  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  30.55 
 
 		 1215 aa  161  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0461  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.15 
 
 		 1195 aa  159  4e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1804  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.66 
 
 		 1186 aa  155  4e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03547  conserved hypothetical protein  30.79 
 
 		 1288 aa  153  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.204102  normal  0.74316 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.53 
 
 		 852 aa  153  2e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  27.22 
 
 		 725 aa  152  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0357  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.66 
 
 		 1424 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127061 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4871  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.73 
 
 		 636 aa  150  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3130  TPR repeat-containing protein  27.73 
 
 		 408 aa  149  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180384 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2533  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 1025 aa  147  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  29.83 
 
 		 732 aa  146  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1169  TPR repeat-containing protein  34.02 
 
 		 444 aa  147  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1245  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.03 
 
 		 568 aa  146  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0199548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1215  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 568 aa  146  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43422  predicted protein  24.7 
 
 		 836 aa  145  5e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.293567  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1304  hypothetical protein  28.21 
 
 		 1404 aa  144  8e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46573  TPR repeat-contain kinesin light chain  26.97 
 
 		 694 aa  143  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4077  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 		 1298 aa  142  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  27.03 
 
 		 828 aa  141  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  24.64 
 
 		 1009 aa  139  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_54602  predicted protein  26.03 
 
 		 740 aa  136  3e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0438  signal transduction histidine kinase-like protein  27.49 
 
 		 755 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.128515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1746  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.67 
 
 		 767 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2132  hypothetical protein  33.33 
 
 		 699 aa  133  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.565923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1300  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.55 
 
 		 771 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2040  TPR repeat-containing protein  21.34 
 
 		 924 aa  128  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.962873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2968  kinesin light chain  30.15 
 
 		 493 aa  128  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.220917  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1066  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.27 
 
 		 609 aa  128  8.000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.94417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0238  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.67 
 
 		 787 aa  128  8.000000000000001e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.463685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.46 
 
 		 1295 aa  128  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1453  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 639 aa  126  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.899031  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  27.86 
 
 		 809 aa  126  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1995  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 443 aa  127  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194004  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3544  lysine decarboxylase transcriptional regulator, CadC  26.76 
 
 		 945 aa  126  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0810782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  28.51 
 
 		 999 aa  125  4e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1102  tetratricopeptide TPR_2  27.45 
 
 		 1507 aa  125  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 		 911 aa  124  8e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2114  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 872 aa  123  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.566849  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1718  tetratricopeptide TPR_4  30.16 
 
 		 799 aa  123  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4084  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 843 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  23.97 
 
 		 816 aa  123  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0853  ATPase  23 
 
 		 844 aa  122  4.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1712  TPR repeat-containing protein  25.07 
 
 		 817 aa  121  6e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.347733  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  23.32 
 
 		 649 aa  122  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3386  NB-ARC domain-containing protein  26.85 
 
 		 834 aa  121  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.167354 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.53 
 
 		 885 aa  121  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1072  tetratricopeptide TPR_2  21.52 
 
 		 1087 aa  121  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0256  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 1298 aa  120  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.636433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_52685  beta-glucan elicitor receptor  26.94 
 
 		 708 aa  120  1.9999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  25.57 
 
 		 340 aa  119  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1210  hypothetical protein  26.27 
 
 		 496 aa  118  6.9999999999999995e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0023593  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2652  hypothetical protein  30.13 
 
 		 919 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00496775  normal  0.0664064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.97 
 
 		 818 aa  117  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.6 
 
 		 878 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 343 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2611  hypothetical protein  71.25 
 
 		 87 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.735379  normal  0.540073 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3708  hypothetical protein  26.49 
 
 		 1039 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  24.19 
 
 		 689 aa  117  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43095  predicted protein  24.37 
 
 		 2327 aa  117  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.30291  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.06 
 
 		 1162 aa  116  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1546  Protein of unknown function DUF835  26.22 
 
 		 1147 aa  116  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.933731  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3208  hypothetical protein  25.24 
 
 		 689 aa  116  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.905159  normal  0.252675 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  24.87 
 
 		 1021 aa  115  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 		 1162 aa  115  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.43 
 
 		 632 aa  115  5e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4363  hypothetical protein  29.91 
 
 		 534 aa  115  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.394148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3796  tetratricopeptide TPR_2  26.67 
 
 		 1040 aa  115  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.32 
 
 		 1022 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2936  transcriptional regulator, SARP family  27.1 
 
 		 1054 aa  114  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.281225  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2236  hypothetical protein  29.18 
 
 		 467 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.555143  normal  0.628114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>