More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1189 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 702 aa  1430    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  39.22 
 
 		 719 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  38.33 
 
 		 727 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  39.4 
 
 		 687 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  39.4 
 
 		 687 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  39.08 
 
 		 724 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  39.34 
 
 		 713 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  37.26 
 
 		 692 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  38.99 
 
 		 742 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  38.9 
 
 		 681 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  38.67 
 
 		 693 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  38.99 
 
 		 677 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  38.47 
 
 		 682 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  38.84 
 
 		 677 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  39.13 
 
 		 685 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  38.84 
 
 		 694 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  38.19 
 
 		 680 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  38.24 
 
 		 685 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  38.92 
 
 		 725 aa  388  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  37.44 
 
 		 727 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  38.62 
 
 		 681 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  38.62 
 
 		 698 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  38.77 
 
 		 751 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  38.62 
 
 		 698 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  38.62 
 
 		 681 aa  383  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  34.58 
 
 		 694 aa  383  1e-105  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  38.46 
 
 		 698 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  37.94 
 
 		 702 aa  380  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  38.62 
 
 		 751 aa  382  1e-104  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.54 
 
 		 600 aa  295  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  31.42 
 
 		 681 aa  276  7e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 734 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 681 aa  274  5.000000000000001e-72  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 730 aa  266  8.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 706 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  27.5 
 
 		 744 aa  244  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 699 aa  243  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 695 aa  238  2e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 689 aa  238  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  29.34 
 
 		 709 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  32.15 
 
 		 693 aa  237  7e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  30.36 
 
 		 709 aa  226  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  28.79 
 
 		 758 aa  221  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  28.57 
 
 		 758 aa  220  6e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 783 aa  220  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  28.41 
 
 		 685 aa  220  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 689 aa  219  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 		 758 aa  217  5e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  28.61 
 
 		 751 aa  217  5.9999999999999996e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  27.96 
 
 		 758 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  27.96 
 
 		 758 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  31.17 
 
 		 705 aa  213  7e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 707 aa  213  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 682 aa  212  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 		 719 aa  207  6e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 719 aa  204  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 784 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  26.34 
 
 		 821 aa  201  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  31.67 
 
 		 714 aa  201  5e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  30.39 
 
 		 676 aa  201  5e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  30.24 
 
 		 714 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  30.61 
 
 		 774 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 		 784 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  29.9 
 
 		 731 aa  197  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  29.62 
 
 		 723 aa  197  8.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  28.61 
 
 		 782 aa  196  2e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  28.76 
 
 		 695 aa  196  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  30.06 
 
 		 789 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  25.45 
 
 		 835 aa  192  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  25.45 
 
 		 801 aa  189  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  28.55 
 
 		 702 aa  189  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 709 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  26.02 
 
 		 797 aa  187  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 708 aa  180  7e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  23.73 
 
 		 778 aa  179  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  25.46 
 
 		 744 aa  177  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  28.19 
 
 		 799 aa  174  5.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 705 aa  170  8e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  24.38 
 
 		 766 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2015  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 732 aa  134  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104514  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  26.65 
 
 		 733 aa  124  8e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 763 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  23.62 
 
 		 759 aa  110  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 836 aa  101  6e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  23.11 
 
 		 678 aa  97.4  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  38.27 
 
 		 249 aa  95.1  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  22.48 
 
 		 824 aa  87  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  25.43 
 
 		 672 aa  86.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  26.83 
 
 		 868 aa  86.7  0.000000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 776 aa  85.1  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  24.42 
 
 		 667 aa  84.3  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2339  TonB-dependent receptor  22.44 
 
 		 797 aa  82  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.608898  normal  0.596694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3198  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 766 aa  80.5  0.00000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  24.63 
 
 		 724 aa  80.1  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  21.95 
 
 		 760 aa  78.6  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  22.08 
 
 		 655 aa  77.8  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7106  TonB-dependent receptor  23.9 
 
 		 818 aa  77.8  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.385774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0465  TonB-dependent receptor  24.73 
 
 		 758 aa  74.7  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  20.59 
 
 		 776 aa  74.7  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  25.14 
 
 		 750 aa  73.9  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>