118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2178 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2178  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  100 
 
 
673 aa  1380    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00232015  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2996  endoglucanase-like  31.39 
 
 
853 aa  153  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0689244  hitchhiker  0.000000433363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1104  glycoside hydrolase family protein  30.34 
 
 
468 aa  147  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0389149  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07770  conserved hypothetical protein  27.24 
 
 
847 aa  143  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.622601  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2580  glycoside hydrolase family 18  26.88 
 
 
1115 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.492458  normal  0.158237 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  31.86 
 
 
869 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05710  endoglucanase  30.93 
 
 
601 aa  128  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.118041  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0282  metallophosphoesterase  38.95 
 
 
459 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4284  Carbohydrate binding family 6  27.89 
 
 
705 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.162289  normal  0.0937971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2319  family 5 glycoside hydrolase  26.73 
 
 
456 aa  110  7.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.182404  normal  0.298559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4045  glycoside hydrolase family 5  27.4 
 
 
573 aa  107  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5221  glycoside hydrolase family 3 domain protein  45.8 
 
 
1357 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0332695  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5218  lipolytic protein G-D-S-L family  46.88 
 
 
542 aa  104  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5220  hypothetical protein  45.31 
 
 
723 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.840911  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1999  protease-like protein  44.53 
 
 
682 aa  99  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911328  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2693  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 
489 aa  98.6  4e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39320  endoglucanase family 5 glycoside hydrolase  28.5 
 
 
481 aa  96.3  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.280438 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02120  expressed protein  28.5 
 
 
470 aa  95.1  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5219  hypothetical protein  39.84 
 
 
1176 aa  93.6  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4178  hypothetical protein  43.75 
 
 
358 aa  93.6  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0714985  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39160  Endoglucanase C (EGC) (Endo-1,4-beta-glucanase) (Cellulase C)  25.1 
 
 
483 aa  92.8  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.151498  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4460  hypothetical protein  42.28 
 
 
438 aa  91.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2177  glycoside hydrolase family protein  47.54 
 
 
578 aa  91.3  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0141597  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4149  glycoside hydrolase family 5  25.64 
 
 
590 aa  90.9  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.533031  normal  0.39445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0943  glycoside hydrolase family protein  23.37 
 
 
493 aa  90.9  8e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.8 
 
 
477 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  27.92 
 
 
863 aa  87.8  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4972  Xylan 1,4-beta-xylosidase  42.64 
 
 
632 aa  87.4  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122581  normal  0.3032 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3845  hypothetical protein  41.22 
 
 
557 aa  85.5  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66312  Endo-1,4-beta-glucanase  26.17 
 
 
481 aa  84.3  0.000000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0233843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1518  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  41.67 
 
 
734 aa  84.3  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000763318  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7478  Xylan 1,4-beta-xylosidase  38.51 
 
 
635 aa  84.3  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414529  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1938  endoglucanase  23.88 
 
 
401 aa  80.1  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0704  hypothetical protein  30.64 
 
 
384 aa  77.4  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3714  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  40.35 
 
 
666 aa  76.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00391353 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04052  beta-1,3-exoglucosidase (Eurofung)  27.31 
 
 
486 aa  71.2  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.137005  normal  0.167106 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1696  hypothetical protein  38.06 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000261124 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3051  hypothetical protein  38.97 
 
 
182 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.123826  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3286  hypothetical protein  38.97 
 
 
182 aa  65.9  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3277  hypothetical protein  38.97 
 
 
182 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2807  glycoside hydrolase family protein  33.87 
 
 
343 aa  65.1  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000151011  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  32.9 
 
 
409 aa  64.3  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1842  retaining beta-glycosidase  25.49 
 
 
551 aa  64.3  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229195 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1689  glycoside hydrolase family protein  25.77 
 
 
365 aa  62.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0715346 
 
 
-
 
NC_006686  CND00790  glucan 1,3-beta-glucosidase, putative  27.6 
 
 
402 aa  61.6  0.00000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.221095  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0862  Glucan 1,3-beta-glucosidase  30.61 
 
 
368 aa  62  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07130  glucan 1,3-beta-glucosidase  29.1 
 
 
368 aa  61.2  0.00000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.486796  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1511  glycoside hydrolase family protein  23.83 
 
 
411 aa  60.1  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0670  glycoside hydrolase family 5  22.33 
 
 
312 aa  59.7  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6250  Glucan endo-1,6-beta-glucosidase  31.14 
 
 
627 aa  59.7  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02900  cytoplasm protein, putative  27.47 
 
 
498 aa  58.9  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2014  glycoside hydrolase family protein  20.5 
 
 
501 aa  58.2  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3093  glycoside hydrolase family protein  21.31 
 
 
377 aa  57.8  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.288487  normal  0.253195 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03777  Endo-beta-1,6-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B6Q3]  29.19 
 
 
409 aa  57  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_78873  Glucan 1,3-beta-glucosidase precursor (Exo-1,3-beta-glucanase)  30.97 
 
 
438 aa  57  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1089  glycoside hydrolase family protein  26.49 
 
 
566 aa  56.6  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122836  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03150  cellulase, putative  25.78 
 
 
431 aa  55.5  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0077  glycoside hydrolase family 5  22.55 
 
 
400 aa  54.3  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0888  glycoside hydrolase family protein  29.68 
 
 
337 aa  54.3  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2063  ROK family protein  51.02 
 
 
210 aa  54.3  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794901  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1290  endoglucanase  19.66 
 
 
393 aa  53.1  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00901224  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0847  endoglucanase  21.67 
 
 
382 aa  53.5  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  23.81 
 
 
562 aa  53.9  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1073  glycoside hydrolase family protein  25.69 
 
 
329 aa  53.5  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3317  glycoside hydrolase family protein  26.71 
 
 
357 aa  53.5  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0276  Cellulase  21.02 
 
 
335 aa  52.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.166979  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1074  glycoside hydrolase family protein  22.63 
 
 
335 aa  51.6  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0289  glycoside hydrolase family 5  25.31 
 
 
378 aa  51.6  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014441  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1471  glycoside hydrolase family protein  23.67 
 
 
561 aa  51.2  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1572  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase  27.96 
 
 
365 aa  51.2  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  28.49 
 
 
608 aa  50.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0025  glycoside hydrolase family 5  28.57 
 
 
358 aa  50.8  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3396  hypothetical protein  32.62 
 
 
433 aa  50.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494224 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0078  hypothetical protein  29.77 
 
 
421 aa  50.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.656506  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  28.07 
 
 
496 aa  50.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0671  glycoside hydrolase family 5  23.38 
 
 
331 aa  49.7  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0840  glycoside hydrolase family 5  23.21 
 
 
584 aa  49.3  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  26.84 
 
 
633 aa  48.9  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4311  coagulation factor 5/8 type domain protein  35 
 
 
755 aa  49.3  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0177286  hitchhiker  0.00166201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3753  Carbohydrate binding family 6  31.16 
 
 
639 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000661715 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  33.61 
 
 
637 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1902  glycoside hydrolase family protein  21.86 
 
 
359 aa  47.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1941  Cellulase  21.15 
 
 
347 aa  47.8  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.966513  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2195  glycoside hydrolase family 5  28.1 
 
 
337 aa  47.8  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07533  Beta-1,3-glucanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AVZ7]  25 
 
 
831 aa  47.4  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0180474  normal  0.0747834 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  27.39 
 
 
542 aa  47.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1404  cellulase  25 
 
 
457 aa  47.4  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.690204  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0736  glycoside hydrolase family 5  21.26 
 
 
399 aa  47.4  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.651733  hitchhiker  0.000337788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0079  glycoside hydrolase family 5  25.55 
 
 
391 aa  47.4  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.265461  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04840  exo-beta-1,3-glucanase  32 
 
 
827 aa  47.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.226873  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1713  glycoside hydrolase family protein  24.12 
 
 
472 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.217477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  28.89 
 
 
658 aa  47.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4887  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.93 
 
 
581 aa  47.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.825597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6252  Cellulase  20 
 
 
370 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  25.58 
 
 
660 aa  46.6  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3338  glycoside hydrolase family 5  24.69 
 
 
382 aa  46.2  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.542716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4412  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  33.33 
 
 
578 aa  46.2  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.835766 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1560  glycoside hydrolase family protein  18.95 
 
 
343 aa  45.8  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000321145  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  28.21 
 
 
596 aa  46.6  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0182  Cellulase  20.99 
 
 
593 aa  46.2  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>