169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1423 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  43.5 
 
 
1147 aa  941    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  50.33 
 
 
1120 aa  1067    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  61.94 
 
 
1178 aa  1102    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  42.49 
 
 
1209 aa  738    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  100 
 
 
1177 aa  2378    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  33.85 
 
 
1170 aa  600  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  31.47 
 
 
1076 aa  464  1e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  29.81 
 
 
1132 aa  431  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0299  hypothetical protein  30.41 
 
 
1154 aa  414  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.309485 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1723  hypothetical protein  27.63 
 
 
1299 aa  326  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000525658  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0031  type II restriction-modification enzyme  38.68 
 
 
1257 aa  319  2e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0068  type II restriction-modification enzyme  39.57 
 
 
1244 aa  318  4e-85  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.337945  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2912  hypothetical protein  28.74 
 
 
1338 aa  311  5e-83  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.248972  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  34.39 
 
 
1159 aa  282  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  32.06 
 
 
995 aa  279  3e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1948  DNA modification methylase  33 
 
 
1089 aa  276  1.0000000000000001e-72  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.89671  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  29.42 
 
 
1036 aa  271  4e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  27.32 
 
 
1426 aa  234  5e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  30.06 
 
 
974 aa  182  2.9999999999999997e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0182  hypothetical protein  27.06 
 
 
1039 aa  178  5e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2163  hypothetical protein  27.88 
 
 
1104 aa  173  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3322  hypothetical protein  28.79 
 
 
1210 aa  159  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.178682  hitchhiker  0.00000120393 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3219  hypothetical protein  24.47 
 
 
1298 aa  154  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0043  type II restriction-modification enzyme  27.12 
 
 
1252 aa  151  8e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  26.48 
 
 
1256 aa  146  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1424  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit  24.64 
 
 
1194 aa  142  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  26.03 
 
 
1058 aa  142  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  25.55 
 
 
1020 aa  142  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  26.84 
 
 
1612 aa  139  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0465  hypothetical protein  21.96 
 
 
882 aa  137  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00310006  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3411  type II restriction-modification enzyme  36.7 
 
 
247 aa  130  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.270172 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  25.15 
 
 
410 aa  128  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3077  hypothetical protein  24.9 
 
 
562 aa  125  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000627479 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0326  hypothetical protein  27.8 
 
 
1184 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.253006  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  22.87 
 
 
950 aa  122  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  25.97 
 
 
1432 aa  121  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2385  hypothetical protein  21.58 
 
 
518 aa  116  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2210  type II restriction enzyme, methylase subunit  24.3 
 
 
836 aa  112  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000292861  normal  0.0590871 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1909  hypothetical protein  23.26 
 
 
557 aa  104  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00461375  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  25.86 
 
 
404 aa  103  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  26.56 
 
 
416 aa  99.4  3e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1310  N-6 DNA methylase  25.36 
 
 
1041 aa  92  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.881884  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0558  type II restriction-modification enzyme  26.65 
 
 
1186 aa  91.3  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  27.6 
 
 
792 aa  89  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3668  hypothetical protein  29.08 
 
 
1088 aa  87.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1478  hypothetical protein  23.53 
 
 
838 aa  85.9  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.157286  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3519  N-6 DNA methylase  29.49 
 
 
694 aa  84.3  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05210  hypothetical protein  20.68 
 
 
1209 aa  84.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3351  hypothetical protein  27.3 
 
 
1338 aa  81.6  0.00000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.465815  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  23.48 
 
 
1425 aa  80.5  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4701  hypothetical protein  25.32 
 
 
795 aa  79.3  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.313867 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1326  hypothetical protein  24.3 
 
 
1321 aa  77  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0004  type II DNA modification methyltransferase  24.83 
 
 
570 aa  76.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.606152  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  21.58 
 
 
1324 aa  76.3  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  24.51 
 
 
1180 aa  75.5  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2149  restriction endonuclease  22.06 
 
 
629 aa  75.1  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1707  restriction/modification enzyme  34.82 
 
 
1343 aa  73.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.544038  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  23.82 
 
 
1484 aa  73.6  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1545  hypothetical protein  23.53 
 
 
1195 aa  72.8  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0985179  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4784  hypothetical protein  23.94 
 
 
1365 aa  72.4  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0358899 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  22.68 
 
 
1182 aa  71.2  0.0000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  26.44 
 
 
1497 aa  71.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1956  putative type II DNA modification enzyme  28.35 
 
 
1055 aa  71.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129503  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  34.17 
 
 
423 aa  70.9  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  31.72 
 
 
652 aa  70.1  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3203  DNA methylase  20.2 
 
 
1189 aa  69.3  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0308495  normal  0.982662 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  33.63 
 
 
1336 aa  68.9  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0971  putative DNA methylase  23.99 
 
 
1222 aa  68.9  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0812  hypothetical protein  37.84 
 
 
1339 aa  68.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0828  hypothetical protein  37.84 
 
 
1339 aa  68.2  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.215826  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0713  hypothetical protein  29.07 
 
 
1250 aa  68.2  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.441526  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  35.71 
 
 
1333 aa  68.2  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0033  hypothetical protein  24.16 
 
 
1332 aa  68.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0789  hypothetical protein  28.12 
 
 
1250 aa  66.6  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4283  hypothetical protein  19.96 
 
 
1233 aa  66.6  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1882  hypothetical protein  24.83 
 
 
1422 aa  67  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  26.11 
 
 
1125 aa  66.6  0.000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  21.05 
 
 
1241 aa  66.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2017  putative type II DNA modification enzyme  27.75 
 
 
1354 aa  65.9  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.610928 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  23.41 
 
 
1162 aa  65.9  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0193  hypothetical protein  23.96 
 
 
684 aa  65.9  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2670  putative type II DNA modification enzyme  30.83 
 
 
1306 aa  65.5  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.554607  normal  0.580872 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  22.58 
 
 
1183 aa  65.1  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  28.19 
 
 
1338 aa  64.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3570  hypothetical protein  22.03 
 
 
1022 aa  64.3  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  22.03 
 
 
1282 aa  64.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3438  hypothetical protein  21.97 
 
 
1375 aa  64.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  27.22 
 
 
1358 aa  63.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03250  hypothetical protein  36.19 
 
 
1347 aa  63.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2323  hypothetical protein  34.78 
 
 
1366 aa  63.2  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.771882  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0460  hypothetical protein  29.66 
 
 
1373 aa  62.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.655713  hitchhiker  0.000401814 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4770  putative type II DNA modification enzyme  32.2 
 
 
1331 aa  62.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.773591  normal  0.43682 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2649  protein of unknown function DUF559  32.33 
 
 
1712 aa  62.4  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1315  hypothetical protein  35 
 
 
1751 aa  62.4  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3678  hypothetical protein  33.59 
 
 
1461 aa  62.4  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2953  putative DNA methylase  20.5 
 
 
1239 aa  62  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.468848  normal  0.142335 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3082  hypothetical protein  26.77 
 
 
816 aa  62  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3449  N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class  32.56 
 
 
389 aa  61.6  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0262978  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  21.28 
 
 
1231 aa  60.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3847  hypothetical protein  27.41 
 
 
1441 aa  61.2  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0166021 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>