More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2669 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 226 aa  462  1e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  34.58 
 
 		 220 aa  115  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 220 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 220 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 212 aa  113  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 214 aa  111  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  31 
 
 		 207 aa  108  9.000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  36.47 
 
 		 212 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 244 aa  105  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 208 aa  105  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  35.67 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 215 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  35 
 
 		 230 aa  103  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 200 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 207 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 216 aa  99.4  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 210 aa  99  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 209 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 213 aa  97.8  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  33.93 
 
 		 219 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 205 aa  97.1  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 207 aa  96.3  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 208 aa  95.5  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  95.1  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 216 aa  94.7  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 213 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 247 aa  93.6  2e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 231 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 213 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 208 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 210 aa  92  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 226 aa  91.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  30.69 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  32.38 
 
 		 234 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 207 aa  89.7  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  32.7 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  34.73 
 
 		 217 aa  89  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 205 aa  89  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 289 aa  87.8  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 202 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 257 aa  86.3  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 208 aa  85.9  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 220 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 207 aa  85.1  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  29.85 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 210 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  34.15 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 192 aa  81.6  0.000000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 236 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 214 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 248 aa  80.5  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 230 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 216 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  30.43 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2732  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
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NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
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NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  33.59 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
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NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
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NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 191 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 228 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  29.73 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 211 aa  78.2  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 222 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 245 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
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