More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1704 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
265 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  97.36 
 
 
265 aa  525  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  3.26196e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  67.68 
 
 
265 aa  382  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.21078e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  58.02 
 
 
267 aa  320  1e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  1.43988e-05  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1166  TPR domain-containing protein  55.85 
 
 
266 aa  293  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.194624  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  53.1 
 
 
265 aa  286  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  6.60918e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1755  TPR repeat-containing protein  46.9 
 
 
265 aa  254  1e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  4.4478e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.14 
 
 
810 aa  148  7e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  33.47 
 
 
272 aa  148  1e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 
878 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.19 
 
 
632 aa  127  2e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  32.02 
 
 
1676 aa  125  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  33.64 
 
 
725 aa  119  5e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  33.33 
 
 
936 aa  116  4e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  30.22 
 
 
837 aa  115  8e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  31.67 
 
 
594 aa  113  2e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.18 
 
 
620 aa  113  4e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.18 
 
 
620 aa  112  8e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  28.94 
 
 
1486 aa  111  1e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 
927 aa  110  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 
615 aa  109  4e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 
3172 aa  109  4e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 
3145 aa  109  4e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  28.89 
 
 
626 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 
649 aa  108  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 
3301 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 
639 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
681 aa  107  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.12 
 
 
689 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 
612 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  28.88 
 
 
462 aa  105  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 
636 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.66 
 
 
1276 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 
685 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  30.22 
 
 
865 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  30.84 
 
 
764 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.36 
 
 
1154 aa  102  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
614 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 
614 aa  102  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.89 
 
 
626 aa  102  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 
2240 aa  102  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  28.11 
 
 
362 aa  102  6e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 
637 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  31.21 
 
 
340 aa  102  9e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 
589 aa  101  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 
366 aa  101  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 
315 aa  101  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
614 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  26.96 
 
 
681 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  28.44 
 
 
614 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28 
 
 
818 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  28.44 
 
 
614 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  28.44 
 
 
626 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.55 
 
 
909 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.86 
 
 
988 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.32 
 
 
1022 aa  100  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.27 
 
 
784 aa  99.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  28 
 
 
1694 aa  99  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
635 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 
635 aa  99  8e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  28.89 
 
 
816 aa  98.2  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.17 
 
 
1056 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8213  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 
392 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0720948  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.8 
 
 
1056 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  26.55 
 
 
827 aa  97.1  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  26.3 
 
 
611 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 
4079 aa  97.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2320  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
617 aa  97.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 
634 aa  97.1  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1260  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 
573 aa  96.7  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.439457 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 
847 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 
399 aa  96.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 
467 aa  96.3  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  4.642e-05 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 
543 aa  96.3  5e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
637 aa  95.9  5e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.88 
 
 
264 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0224916  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.44 
 
 
820 aa  95.5  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.32 
 
 
576 aa  95.5  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.88 
 
 
3035 aa  94.7  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  28.7 
 
 
1979 aa  94.7  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  34.39 
 
 
789 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.05 
 
 
586 aa  94.4  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.43 
 
 
718 aa  94.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  27.43 
 
 
706 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
1737 aa  94.4  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  28.22 
 
 
739 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 
1069 aa  93.6  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  29.06 
 
 
733 aa  93.6  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2975  TPR repeat-containing protein  27.32 
 
 
716 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  29.13 
 
 
875 aa  93.6  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1092  TPR repeat-containing protein  28.31 
 
 
612 aa  93.2  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 
1038 aa  93.2  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 
711 aa  92.8  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  30.26 
 
 
1297 aa  92.4  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.44 
 
 
397 aa  92.4  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_002620  TC0055  type III secretion chaperone, putative  30 
 
 
335 aa  92  8e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  30.41 
 
 
1450 aa  92  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  34 
 
 
465 aa  92  9e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  28.06 
 
 
280 aa  92  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 
594 aa  91.7  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>