More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4888 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  100 
 
 		 842 aa  1636    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  72.06 
 
 		 843 aa  1182    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  44.72 
 
 		 848 aa  594  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2300  protein of unknown function DUF214  44.93 
 
 		 834 aa  591  1e-167  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0183109  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  43.78 
 
 		 847 aa  576  1.0000000000000001e-163  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  41.44 
 
 		 845 aa  528  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2233  hypothetical protein  40.3 
 
 		 849 aa  489  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  40 
 
 		 849 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  39.26 
 
 		 852 aa  463  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4859  protein of unknown function DUF214  38.8 
 
 		 806 aa  436  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  37.36 
 
 		 853 aa  426  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  36.66 
 
 		 859 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  36.64 
 
 		 856 aa  393  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2119  protein of unknown function DUF214  34.54 
 
 		 873 aa  376  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.5367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  34.55 
 
 		 855 aa  379  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  34.78 
 
 		 854 aa  375  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1744  ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis permease component-like protein  35.17 
 
 		 836 aa  374  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.338557  normal  0.695745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8289  protein of unknown function DUF214  36.27 
 
 		 853 aa  360  7e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32350  predicted ABC-type transport system involved in lysophospholipase L1 biosynthesis, permease component  35.91 
 
 		 861 aa  354  4e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.490585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3229  protein of unknown function DUF214  37.28 
 
 		 857 aa  345  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.248518  normal  0.0371702 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  36.16 
 
 		 838 aa  335  2e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  34.57 
 
 		 873 aa  325  3e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3058  protein of unknown function DUF214  33.41 
 
 		 853 aa  318  2e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  32.65 
 
 		 855 aa  299  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1888  protein of unknown function DUF214  31.15 
 
 		 861 aa  290  1e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  32.06 
 
 		 841 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  34.35 
 
 		 866 aa  284  4.0000000000000003e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  32.32 
 
 		 825 aa  282  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  34.45 
 
 		 839 aa  275  4.0000000000000004e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  32.6 
 
 		 821 aa  262  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4186  hypothetical protein  33.12 
 
 		 828 aa  242  2.9999999999999997e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.471594 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  32.74 
 
 		 846 aa  232  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0672  SalY-type ABC antimicrobial peptide transport system permease component  27.68 
 
 		 880 aa  209  1e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  30.41 
 
 		 871 aa  209  3e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  31.87 
 
 		 930 aa  198  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2825  protein of unknown function DUF214  32.68 
 
 		 855 aa  196  1e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08470  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  30.6 
 
 		 859 aa  190  1e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.737903 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0642  efflux ABC transporter, permease protein  28.96 
 
 		 897 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.17637 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  29.17 
 
 		 835 aa  177  8e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2393  protein of unknown function DUF214  28.08 
 
 		 857 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0227275  hitchhiker  0.00295901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  24.28 
 
 		 849 aa  154  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2644  hypothetical protein  27.87 
 
 		 852 aa  147  7.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.90448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  24.71 
 
 		 851 aa  147  9e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2698  protein of unknown function DUF214  26.25 
 
 		 855 aa  144  5e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0506019  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  23.61 
 
 		 857 aa  144  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4412  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  25.34 
 
 		 863 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.823513  normal  0.01571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  24.63 
 
 		 850 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  24.34 
 
 		 850 aa  141  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  25.56 
 
 		 870 aa  140  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2759  hypothetical protein  24.88 
 
 		 854 aa  139  2e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.732322  normal  0.0170519 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  23.5 
 
 		 855 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  25.96 
 
 		 866 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0089  ABC-type transport system involved in lipoprotein release permease component-like protein  26.15 
 
 		 807 aa  129  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1875  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 		 878 aa  127  9e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0737612  normal  0.417003 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2760  protein of unknown function DUF214  26.15 
 
 		 822 aa  126  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000148915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  25.96 
 
 		 849 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3007  protein of unknown function DUF214  30.86 
 
 		 801 aa  123  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2177  hypothetical protein  21.39 
 
 		 856 aa  122  3.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  26.82 
 
 		 884 aa  115  4.0000000000000004e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0693  protein of unknown function DUF214  26.72 
 
 		 828 aa  113  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  27.3 
 
 		 844 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  26.34 
 
 		 857 aa  107  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0529  hypothetical protein  26.38 
 
 		 841 aa  106  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.628545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  22.99 
 
 		 858 aa  102  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2238  protein of unknown function DUF214  26.58 
 
 		 822 aa  100  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2272  protein of unknown function DUF214  35.87 
 
 		 846 aa  100  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000721038 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  24.67 
 
 		 839 aa  100  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  24.92 
 
 		 858 aa  99.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  23.46 
 
 		 847 aa  99  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21950  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  32.69 
 
 		 738 aa  97.1  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  23.65 
 
 		 847 aa  96.3  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4458  protein of unknown function DUF214  26.03 
 
 		 822 aa  94.7  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  27.12 
 
 		 858 aa  94.4  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  26.5 
 
 		 867 aa  94  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  25.45 
 
 		 849 aa  92.4  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  23.88 
 
 		 857 aa  90.1  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3508  protein of unknown function DUF214  25.25 
 
 		 838 aa  89.4  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.40387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2246  hypothetical protein  24.49 
 
 		 838 aa  87.8  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.388065  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0850  protein of unknown function DUF214  26.52 
 
 		 874 aa  86.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0147973  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  31.61 
 
 		 842 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  25.76 
 
 		 853 aa  83.6  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0682  ABC transporter, permease protein  24.44 
 
 		 404 aa  84  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.834808  normal  0.683549 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3218  permease, putative  24.01 
 
 		 850 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.479064  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  24.28 
 
 		 855 aa  81.3  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3762  protein of unknown function DUF214  31.54 
 
 		 452 aa  81.3  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  29.12 
 
 		 400 aa  81.3  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  28.81 
 
 		 842 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1942  protein of unknown function DUF214  29.05 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  23.31 
 
 		 846 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0193  hypothetical protein  23.88 
 
 		 413 aa  79.7  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00183424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2074  protein of unknown function DUF214  22.65 
 
 		 405 aa  78.2  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  29.49 
 
 		 842 aa  77.8  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  27 
 
 		 403 aa  77  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2994  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  24.48 
 
 		 417 aa  77.4  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0434  hypothetical protein  38.71 
 
 		 425 aa  77  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  22.69 
 
 		 404 aa  77  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1639  hypothetical protein  25.41 
 
 		 415 aa  75.9  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1949  hypothetical protein  32.11 
 
 		 475 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.519015  hitchhiker  0.00836465 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3419  hypothetical protein  23.39 
 
 		 821 aa  75.9  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319511  normal  0.0789128 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  28.02 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>