148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4681 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 492 aa  987    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  50.49 
 
 		 586 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  51.09 
 
 		 526 aa  443  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  48.9 
 
 		 497 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  47.15 
 
 		 484 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  48.27 
 
 		 488 aa  374  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  46.27 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  41.05 
 
 		 497 aa  312  6.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  40.27 
 
 		 517 aa  299  8e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  37.07 
 
 		 519 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  38.98 
 
 		 496 aa  279  7e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  34.92 
 
 		 516 aa  259  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  38.85 
 
 		 512 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  45.17 
 
 		 538 aa  254  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  33.2 
 
 		 498 aa  242  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  36.05 
 
 		 515 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  35.52 
 
 		 563 aa  231  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  33.72 
 
 		 566 aa  228  3e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  32.83 
 
 		 577 aa  227  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  32.78 
 
 		 581 aa  210  4e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  44.52 
 
 		 542 aa  208  2e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  42.24 
 
 		 556 aa  208  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.41 
 
 		 558 aa  207  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  36.2 
 
 		 514 aa  207  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  32.75 
 
 		 523 aa  205  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.19 
 
 		 536 aa  204  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  36.61 
 
 		 550 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  30.25 
 
 		 546 aa  200  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  35.06 
 
 		 512 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  41.2 
 
 		 532 aa  199  1.0000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  40.42 
 
 		 546 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  33.93 
 
 		 636 aa  196  7e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.76 
 
 		 539 aa  194  3e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  40.52 
 
 		 547 aa  193  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  38.36 
 
 		 541 aa  193  6e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.92 
 
 		 541 aa  190  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  40.82 
 
 		 540 aa  190  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.89 
 
 		 537 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  39.01 
 
 		 537 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  29.85 
 
 		 571 aa  180  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  38.89 
 
 		 546 aa  181  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  29.96 
 
 		 539 aa  172  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  27.36 
 
 		 553 aa  169  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.56 
 
 		 559 aa  167  4e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  26.84 
 
 		 558 aa  163  6e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  36.92 
 
 		 591 aa  157  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  31.23 
 
 		 552 aa  155  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  34.35 
 
 		 522 aa  144  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  31.98 
 
 		 522 aa  143  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  31.91 
 
 		 545 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  30.58 
 
 		 537 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  32.09 
 
 		 572 aa  138  3.0000000000000003e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  30.83 
 
 		 547 aa  137  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  27.46 
 
 		 536 aa  133  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  26.9 
 
 		 590 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  32.88 
 
 		 522 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  33.56 
 
 		 540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  27.79 
 
 		 527 aa  130  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  31.02 
 
 		 537 aa  130  6e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  34.78 
 
 		 511 aa  129  9.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  32.43 
 
 		 535 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  27.87 
 
 		 518 aa  123  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  30.65 
 
 		 504 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  29.29 
 
 		 525 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.32 
 
 		 562 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  28.91 
 
 		 560 aa  119  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  27.24 
 
 		 543 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  26.84 
 
 		 551 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  24.25 
 
 		 532 aa  113  6e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  30.13 
 
 		 1195 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  28.92 
 
 		 534 aa  111  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  32.62 
 
 		 365 aa  110  8.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  30.42 
 
 		 521 aa  107  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  26.33 
 
 		 1338 aa  104  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  26.93 
 
 		 665 aa  100  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  24.08 
 
 		 746 aa  94.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  30.28 
 
 		 1474 aa  91.7  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  25.33 
 
 		 500 aa  90.1  7e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  26.76 
 
 		 530 aa  90.1  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  45.45 
 
 		 343 aa  88.6  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  26.83 
 
 		 650 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  25.75 
 
 		 522 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  24.92 
 
 		 501 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 345 aa  84  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  25.53 
 
 		 495 aa  83.6  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  24.16 
 
 		 518 aa  80.1  0.00000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  25.79 
 
 		 691 aa  77.8  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  24.83 
 
 		 524 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  24.49 
 
 		 1585 aa  77.4  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  27.5 
 
 		 699 aa  74.3  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  20.94 
 
 		 508 aa  72.4  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  25 
 
 		 472 aa  70.5  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25.25 
 
 		 472 aa  70.1  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  28.85 
 
 		 304 aa  70.1  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  25.49 
 
 		 532 aa  67.8  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.64 
 
 		 341 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  33.1 
 
 		 797 aa  64.3  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  26.23 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  24.15 
 
 		 901 aa  62.8  0.00000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  26.91 
 
 		 324 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>