104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1094 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  100 
 
 		 249 aa  507  1e-143  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  62.85 
 
 		 244 aa  315  4e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  54.28 
 
 		 270 aa  256  2e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  32.64 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  37.2 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  29.61 
 
 		 238 aa  92.4  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  35.93 
 
 		 261 aa  89  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  38.85 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  27.23 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  32.14 
 
 		 211 aa  82.4  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  35.04 
 
 		 219 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  28.15 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  26.79 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.91 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  36.62 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  29.46 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1999  putative phage repressor  36.3 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.148968  normal  0.25035 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  29.15 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 248 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  38.81 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  31.11 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  29.17 
 
 		 247 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  29.17 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  32.64 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  29.58 
 
 		 204 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  33.61 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  32.09 
 
 		 210 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  35.17 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  32.64 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  31.68 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  28 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4446  putative phage repressor  28.35 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4113  putative phage repressor  29.37 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0271974  hitchhiker  0.00000000858644 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3589  putative phage repressor  36.67 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136688  hitchhiker  0.00299337 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1192  putative phage repressor  29.63 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  28.16 
 
 		 248 aa  55.5  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4131  putative phage repressor  25.29 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.362406 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  28.4 
 
 		 212 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0998  transcriptional regulator, putative  28.05 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000689636  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1024  phage repressor  38.1 
 
 		 265 aa  53.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.277837  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1096  putative phage repressor  26.2 
 
 		 219 aa  52  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0889323  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2620  putative phage repressor  28.18 
 
 		 144 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0332689 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  25.34 
 
 		 233 aa  51.6  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  28.47 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  27.54 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1832  transcriptional repressor, LexA family  39.05 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000994173 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  28.49 
 
 		 292 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  27.13 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  33.09 
 
 		 222 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  29.29 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  23.78 
 
 		 289 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  27.61 
 
 		 248 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4549  putative phage repressor  29.63 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  28.47 
 
 		 302 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2143  LexA repressor  37.04 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3599  LexA repressor  37.04 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0155169  normal  0.533875 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1683  LexA repressor  37.04 
 
 		 202 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.141699  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1011  putative phage repressor  25.23 
 
 		 218 aa  45.8  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.763396  unclonable  0.00000301408 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3510  LexA repressor  37.04 
 
 		 202 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.9651  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1587  LexA repressor  31.4 
 
 		 204 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.477026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3283  LexA repressor  37.04 
 
 		 202 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3872  LexA repressor  37.04 
 
 		 202 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.315226  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1939  LexA repressor  33.33 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269028  normal  0.116637 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1395  putative phage repressor  34.41 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4418  putative phage repressor  28.57 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000888993  normal  0.473724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0641  putative phage repressor  36.96 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14510  LexA repressor  31.4 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2167  LexA repressor  36.14 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.543969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  25.97 
 
 		 244 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  24.42 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1120  LexA repressor  30.23 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1600  LexA repressor  30.23 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1637  LexA repressor  30.23 
 
 		 215 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1659  LexA repressor  34.57 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2425  LexA repressor  39.47 
 
 		 205 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1577  LexA repressor  30.23 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2954  LexA repressor  36.99 
 
 		 234 aa  42.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.832817 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08220  DNA-binding protein RDGA  25 
 
 		 196 aa  42.7  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1304  LexA repressor  35.53 
 
 		 216 aa  42.4  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1039  hypothetical protein  31.03 
 
 		 168 aa  42.4  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  28 
 
 		 241 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1689  putative phage repressor  27.9 
 
 		 239 aa  42.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556751 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  24.54 
 
 		 229 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0733  LexA repressor  32.1 
 
 		 202 aa  42.4  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.461848  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1211  LexA repressor  29.07 
 
 		 215 aa  42  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272184  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2471  LexA repressor  27.91 
 
 		 216 aa  42  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.305758  normal  0.643159 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1496  LexA repressor  29.07 
 
 		 215 aa  42  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1699  LexA repressor  29.07 
 
 		 215 aa  42  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.465061  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0356  LexA repressor  29.07 
 
 		 215 aa  42  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0456826  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1845  LexA repressor  29.07 
 
 		 215 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1859  LexA repressor  29.07 
 
 		 215 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349783  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0805  LexA repressor  29.07 
 
 		 215 aa  42  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  33.33 
 
 		 214 aa  42  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  28.42 
 
 		 259 aa  42  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4738  LexA repressor  29.07 
 
 		 215 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0483588  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25160  LexA repressor  34.57 
 
 		 204 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  28.19 
 
 		 256 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3997  LexA repressor  29.41 
 
 		 206 aa  42  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>