96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0931 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0931  hypothetical protein  100 
 
 		 616 aa  1284    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0714  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  34.36 
 
 		 611 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0731  AAA ATPase  32.03 
 
 		 569 aa  324  3e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0912969  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2528  AAA ATPase  30.58 
 
 		 621 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2973  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  29.71 
 
 		 659 aa  212  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0132  hypothetical protein  26.15 
 
 		 699 aa  160  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000387943 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0025  hypothetical protein  26.15 
 
 		 699 aa  160  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0226  hypothetical protein  26.15 
 
 		 699 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0177  hypothetical protein  25.25 
 
 		 696 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4080  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.8 
 
 		 631 aa  148  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.020005  normal  0.0495521 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2548  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.98 
 
 		 629 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0379852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1693  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  23.45 
 
 		 629 aa  135  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000521447  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2744  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.94 
 
 		 630 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00908166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4995  hypothetical protein  24.56 
 
 		 893 aa  117  8.999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124549  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6849  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.47 
 
 		 608 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0610151  normal  0.925039 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8579  type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.73 
 
 		 595 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161073  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0167  hypothetical protein  27.87 
 
 		 322 aa  98.2  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0100015  hitchhiker  6.88403e-24 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2211  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  24.82 
 
 		 618 aa  94  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6728  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.48 
 
 		 657 aa  93.2  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.726364  normal  0.776114 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1395  type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  25.23 
 
 		 616 aa  93.6  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0290868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1816  truncated type IV secretory pathway VirB4 component protein  23.53 
 
 		 668 aa  90.9  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3629  Type IV secretory pathway VirB4 protein  22.79 
 
 		 866 aa  87  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1342  ATP-binding protein  21.85 
 
 		 461 aa  83.2  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1505  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.97 
 
 		 836 aa  80.1  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0609191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2162  ATPase  26.2 
 
 		 847 aa  79  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.532567  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0791  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.26 
 
 		 815 aa  79  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1815  putative type IV secretory pathway VirB4 protein  21.54 
 
 		 747 aa  78.6  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1056  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.24 
 
 		 566 aa  78.6  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000236301  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0914  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.72 
 
 		 1043 aa  78.6  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1287  Tn5252, Orf26  22.04 
 
 		 776 aa  77.4  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4178  hypothetical protein  24.73 
 
 		 874 aa  77.4  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0161122 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18940  hypothetical protein  21.86 
 
 		 908 aa  75.5  0.000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0727779 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0371  F-pilin subunit assembly into extended F pili  22.07 
 
 		 809 aa  73.9  0.000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.221651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1688  transfer complex protein  23.32 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.330287  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0179  membrane bound ATPase, putative  21.85 
 
 		 955 aa  69.7  0.0000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5371  Type-IV secretion system protein TraC  24.45 
 
 		 864 aa  70.1  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.622531 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1089  type-IV secretion system protein TraC  22.39 
 
 		 866 aa  70.1  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4006  type IV secretion/conjugal transfer ATPase  24.69 
 
 		 868 aa  68.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.840318  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0936  putative pillus assembly protein  23.67 
 
 		 690 aa  68.9  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0253  sex pilus assembly protein  24.87 
 
 		 815 aa  68.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0029  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  22.11 
 
 		 875 aa  67.4  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0505  type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TraC  21.66 
 
 		 843 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6919  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.16 
 
 		 792 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0518  Type IV secretory pathway VirB4 protein  20.92 
 
 		 845 aa  64.7  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.832849  normal  0.194578 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0163  hypothetical protein  24.58 
 
 		 323 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427999  hitchhiker  1.86977e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0316  sex pilus assembly protein  23.92 
 
 		 815 aa  62.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5435  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  24.48 
 
 		 515 aa  62  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.62909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6801  hypothetical protein  23.66 
 
 		 864 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0095  type IV conjugative transfer system protein TraC  21.82 
 
 		 815 aa  61.2  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.124816 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4226  hypothetical protein  22.79 
 
 		 827 aa  59.7  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1502  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.42 
 
 		 609 aa  57.8  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3184  hypothetical protein  22.03 
 
 		 884 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2885  hypothetical protein  21.89 
 
 		 885 aa  55.5  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0417447 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3322  putative ATP-binding protein  21.07 
 
 		 480 aa  54.7  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.540198 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3127  hypothetical protein  21.59 
 
 		 610 aa  53.5  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2964  transfer complex protein  21.86 
 
 		 711 aa  53.5  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8941  hypothetical protein  22.28 
 
 		 505 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.57395  normal  0.334134 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8298  hypothetical protein  22.98 
 
 		 575 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0389  hypothetical protein  21.39 
 
 		 508 aa  52.4  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.559063  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1133  hypothetical protein  23.24 
 
 		 496 aa  51.6  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0645  hypothetical protein  41.18 
 
 		 686 aa  51.6  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.549524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  21.67 
 
 		 711 aa  51.6  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7298  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  21.36 
 
 		 696 aa  50.8  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  0.0433123 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4438  type-IV secretion system protein TraC  21.43 
 
 		 862 aa  50.8  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.314552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4442  Type-IV secretion system protein TraC  21.43 
 
 		 862 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4535  type-IV secretion system protein TraC  21.43 
 
 		 862 aa  50.8  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.862751 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4627  type-IV secretion system protein TraC  21.43 
 
 		 862 aa  50.8  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.997489 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4378  type-IV secretion system protein TraC  21.43 
 
 		 862 aa  50.4  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0805  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.34 
 
 		 495 aa  50.4  0.00009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3900  hypothetical protein  21.81 
 
 		 931 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010579  XfasM23_2228  conjugal transfer protein TrbE  27.27 
 
 		 854 aa  50.1  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0444639  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2753  hypothetical protein  25.15 
 
 		 610 aa  50.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4502  type-IV secretion system protein TraC  20.53 
 
 		 862 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2948  Type IV secretory pathway VirB4 component, ATPase TRAC  20.82 
 
 		 841 aa  49.3  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0575  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  22.15 
 
 		 802 aa  49.3  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3176  conjugation protein  20.45 
 
 		 1085 aa  48.9  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06770  hypothetical protein  21.1 
 
 		 495 aa  48.9  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3057  AAA ATPase  21.63 
 
 		 816 aa  48.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2460  hypothetical protein  21.27 
 
 		 940 aa  47.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.133962 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3253  type IV secretory pathway VirB4 components-like  20.04 
 
 		 861 aa  47.4  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1617  CagE, TrbE, VirB component of type IV transporter system, conserved region  20.25 
 
 		 819 aa  47.4  0.0008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0020  hypothetical protein  19.77 
 
 		 865 aa  47.4  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5240  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like  30 
 
 		 779 aa  46.6  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1535  hypothetical protein  22.93 
 
 		 860 aa  46.6  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.324807 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5109  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like  33.65 
 
 		 695 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0162  hypothetical protein  29.27 
 
 		 591 aa  46.2  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.222598  normal  0.0745617 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1374  protein of unknown function DUF87  27.5 
 
 		 538 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.627609 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00150  hypothetical protein  20.43 
 
 		 495 aa  45.8  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3115  Type IV secretory pathway VirB4 protein-like protein  23.63 
 
 		 802 aa  45.4  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2190  AAA ATPase  26.28 
 
 		 622 aa  45.8  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0020112  hitchhiker  0.0000768998 
 
 
-
 
NC_002950  PG1481  conjugative transposon protein TraG  20.54 
 
 		 841 aa  45.1  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.612602 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1385  protein of unknown function DUF87  26.84 
 
 		 496 aa  45.4  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.177775  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1720  ATPase  31.65 
 
 		 504 aa  45.4  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4290  conjugal transfer ATP-binding protein TraC  19.75 
 
 		 866 aa  44.7  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06480  type IV secretory pathway VirB4 component-like protein  30 
 
 		 500 aa  43.9  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.132231  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3545  Type IV secretory pathway VirB4 components-like protein  19.18 
 
 		 811 aa  43.5  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0653304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>