136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_2204 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_2204  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0332088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0031  Tetratricopeptide repeat protein  38.97 
 
 		 192 aa  97.8  8e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0070  TPR repeat-containing protein  26.6 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000134059  normal  0.0131239 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3296  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173177  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0732  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 235 aa  66.2  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  25.74 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1720  TPR repeat-containing protein  22.04 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1786  TPR repeat-containing protein  22.41 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0173384 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2431  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.99 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.232516  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2936  TPR repeat-containing protein  25.71 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.196962 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0668  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.541497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2192  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 319 aa  58.5  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000199858  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1051  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1796  TPR repeat-containing protein  24.57 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2007  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.73 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2615  TPR domain-containing protein  24.09 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.1 
 
 		 256 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1206  hypothetical protein  26.83 
 
 		 436 aa  51.6  0.000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1520  Tetratricopeptide repeat protein  34.78 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2032  TPR repeat-containing protein  27.01 
 
 		 883 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.192732  normal  0.125101 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1897  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.05 
 
 		 758 aa  49.7  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4917  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.73 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000226435  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0757  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 222 aa  49.3  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.572611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.94 
 
 		 1694 aa  49.3  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 357 aa  49.3  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  18.8 
 
 		 352 aa  48.9  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0631  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0214  tetratricopeptide repeat domain protein  22.9 
 
 		 1004 aa  49.3  0.00004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467703  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  22.5 
 
 		 1297 aa  48.5  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 245 aa  48.9  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 1421 aa  48.5  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  29.37 
 
 		 667 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  27.21 
 
 		 409 aa  47.8  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1139  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 357 aa  47.8  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000045072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1405  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 399 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00694073  normal  0.0323168 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 750 aa  47.8  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3752  TPR repeat-containing protein  28.07 
 
 		 473 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  25.66 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  26.56 
 
 		 730 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.74 
 
 		 572 aa  46.6  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  27.42 
 
 		 4079 aa  46.6  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0322  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 401 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000024467  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.07 
 
 		 557 aa  46.6  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0058  TPR repeat-containing protein  24.71 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.393003  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 942 aa  46.2  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.35 
 
 		 249 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0319  TPR repeat-containing protein  23.73 
 
 		 301 aa  46.2  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0540059  normal  0.098872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.35 
 
 		 249 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 643 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 1121 aa  45.8  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1567  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 339 aa  45.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00816314  normal  0.0470804 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0415  TPR domain-containing protein  26.34 
 
 		 405 aa  45.4  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.53 
 
 		 738 aa  45.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 		 371 aa  45.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 405 aa  45.4  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3996  cytochrome c-type biogenesis protein CcmI  29.53 
 
 		 407 aa  45.4  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1127  TPR domain-containing protein  23.96 
 
 		 725 aa  45.1  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.08 
 
 		 397 aa  45.1  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  25.53 
 
 		 407 aa  45.1  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1616  TPR repeat-containing protein  25.84 
 
 		 544 aa  45.1  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.797217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  26.14 
 
 		 708 aa  44.7  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 938 aa  44.7  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000435275  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0939  hypothetical protein  23.14 
 
 		 287 aa  44.7  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3999  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 279 aa  44.7  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.2 
 
 		 1979 aa  43.9  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2764  TPR repeat-containing protein  26.81 
 
 		 683 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0762539  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1208  TPR repeat-containing protein  24.11 
 
 		 389 aa  43.9  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 329 aa  44.3  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  21.93 
 
 		 409 aa  44.3  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  29.13 
 
 		 864 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  22.34 
 
 		 687 aa  43.5  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2293  tetratricopeptide TPR_2  28.91 
 
 		 384 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 567 aa  43.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5110  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 288 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  29.27 
 
 		 827 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25.21 
 
 		 543 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0987  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.67 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00201205  hitchhiker  0.000380468 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2945  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 1184 aa  43.5  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2511  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 254 aa  43.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00503968  hitchhiker  0.000246366 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.48 
 
 		 572 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0430  TPR domain-containing protein  30.59 
 
 		 338 aa  42.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0605051  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0447  TPR domain-containing protein  27.66 
 
 		 992 aa  42.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000620141  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  18.57 
 
 		 323 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 634 aa  42.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 		 399 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 1127 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 3035 aa  43.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0934  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.19 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1000  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 486 aa  42.7  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.326539  normal  0.768066 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  25.83 
 
 		 561 aa  42.7  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  21.67 
 
 		 1276 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  25.51 
 
 		 1005 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3432  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 153 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  26.28 
 
 		 778 aa  42.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.69 
 
 		 927 aa  42.4  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1475  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 467 aa  42.4  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1499  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 329 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00502134  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1676 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>