More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2960 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2960  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 463 aa  928    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.401825 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3158  efflux transporter, RND family, MFP subunit  99.78 
 
 		 463 aa  926    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2744  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.94 
 
 		 475 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.24 
 
 		 467 aa  244  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.96 
 
 		 422 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.656128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.15 
 
 		 496 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.36 
 
 		 496 aa  241  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3839  secretion protein HlyD  35.04 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2492  RND family efflux transporter subunit MFP  35.04 
 
 		 437 aa  218  2e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.311613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.35 
 
 		 401 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1067  secretion protein HlyD  30.48 
 
 		 364 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2368  secretion protein HlyD  29.02 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.108323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2818  secretion protein HlyD  28.67 
 
 		 376 aa  137  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1441  RND family efflux transporter MFP subunit  37.24 
 
 		 634 aa  128  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02661  membrane-fusion protein  32.47 
 
 		 375 aa  107  6e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.489029 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0389  secretion protein HlyD  26.6 
 
 		 380 aa  96.7  7e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0233087  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4132  RND family efflux transporter MFP subunit  23.82 
 
 		 384 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2303  secretion protein HlyD  31.58 
 
 		 357 aa  90.9  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.951849  normal  0.284037 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.66 
 
 		 377 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  27.21 
 
 		 517 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  26.22 
 
 		 609 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.17 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.45 
 
 		 487 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1966  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.68 
 
 		 487 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  27.78 
 
 		 421 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  27.78 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.83 
 
 		 490 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  26.36 
 
 		 417 aa  82  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.01 
 
 		 420 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0098  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.83 
 
 		 432 aa  80.5  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1456  RND family efflux transporter MFP subunit  23.79 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  24.6 
 
 		 376 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2408  secretion protein HlyD  24.82 
 
 		 404 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000198894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1188  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3265  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.61 
 
 		 404 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.48 
 
 		 407 aa  77  0.0000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  35.2 
 
 		 376 aa  76.6  0.0000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1154  RND family efflux transporter MFP subunit  29.44 
 
 		 375 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1161  RND family efflux transporter MFP subunit  25 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0203325  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2700  secretion protein HlyD  28.83 
 
 		 403 aa  76.3  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  24.19 
 
 		 379 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0573  macrolide secretion protein MacA  24.58 
 
 		 455 aa  75.1  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.00000000000123833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  26.14 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  26.09 
 
 		 354 aa  75.1  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.52 
 
 		 383 aa  75.1  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.62 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.81 
 
 		 407 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.84 
 
 		 387 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2519  secretion protein HlyD  25 
 
 		 382 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000015375  normal  0.24357 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  25.66 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  24.58 
 
 		 405 aa  73.6  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.71 
 
 		 442 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  26.55 
 
 		 372 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  27.16 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  23.62 
 
 		 399 aa  72  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  28.63 
 
 		 397 aa  72.4  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0986  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.09 
 
 		 405 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.831389 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  26.07 
 
 		 421 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2284  secretion protein HlyD  28.83 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.831641  normal  0.154042 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4299  RND family efflux transporter MFP subunit  27.88 
 
 		 405 aa  71.2  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01671  membrane-fusion protein  23.65 
 
 		 366 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  26.55 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000335121  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.58 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.44 
 
 		 462 aa  71.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.05 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  26.67 
 
 		 370 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09530  RND efflux membrane fusion protein precursor  27.68 
 
 		 370 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0206  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.87 
 
 		 386 aa  70.5  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0768  acriflavin resistance periplasmic protein  30.39 
 
 		 348 aa  70.5  0.00000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.69171  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.06 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  25.22 
 
 		 370 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1809  secretion protein HlyD  27.48 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1389  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.75 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  26.71 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2665  RND family efflux transporter MFP subunit  27.86 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.87 
 
 		 379 aa  69.7  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  23.56 
 
 		 400 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2956  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.12 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.232515 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1057  RND family efflux transporter MFP subunit  28.29 
 
 		 373 aa  68.6  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.347653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.4 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  24.81 
 
 		 390 aa  69.3  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  24.67 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  24.67 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4297  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.69 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.430357  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  28.22 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2543  secretion protein HlyD  23.14 
 
 		 471 aa  67.8  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0563  secretion protein HlyD  24.63 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1564  RND family efflux transporter MFP subunit  28.42 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000112948  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  24.32 
 
 		 404 aa  67  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1791  secretion protein HlyD  26.51 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4226  RND family efflux transporter MFP subunit  27.39 
 
 		 426 aa  67  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.499264  normal  0.926991 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1650  secretion protein HlyD  27.98 
 
 		 397 aa  66.6  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  28.94 
 
 		 372 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3081  RND family efflux transporter MFP subunit  29.26 
 
 		 371 aa  66.6  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.153012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  22.52 
 
 		 421 aa  66.6  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5404  secretion protein HlyD family protein  28.04 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.629231 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  24.23 
 
 		 369 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3002  membrane-fusion protein, component of multidrug efflux system  24.02 
 
 		 367 aa  66.6  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.6 
 
 		 384 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.23 
 
 		 369 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>