More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_0019 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4128  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  58.52 
 
 
663 aa  822  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0021  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  99.1 
 
 
668 aa  1366  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0019  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  100 
 
 
668 aa  1375  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  41.62 
 
 
1079 aa  389  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2535  diguanylate cyclase  37.12 
 
 
1099 aa  306  8e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.12937  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0953  diguanylate cyclase  43.4 
 
 
494 aa  288  3e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0926  diguanylate cyclase  43.11 
 
 
494 aa  284  4e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  45.61 
 
 
547 aa  273  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2333  hypothetical protein  39 
 
 
565 aa  263  9e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01741  Putative CHASE3/GGDEF domain-containing signal protein  40.88 
 
 
563 aa  258  3e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0034  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.06 
 
 
728 aa  256  9e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0283  hypothetical protein  33.07 
 
 
709 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0299  hypothetical protein  33.27 
 
 
609 aa  251  4e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.8 
 
 
708 aa  249  9e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5079  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.23 
 
 
695 aa  246  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.929766 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1977  membrane associated GGDEF protein  36.52 
 
 
583 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2740  diguanylate cyclase  37.25 
 
 
555 aa  238  3e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0402  diguanylate cyclase  36.6 
 
 
866 aa  236  1e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.362695  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  57.53 
 
 
882 aa  236  1e-60  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2290  diguanylate cyclase  39.26 
 
 
646 aa  235  2e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.666302 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1155  diguanylate cyclase  37.13 
 
 
605 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.290971  normal  0.125636 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  59.28 
 
 
468 aa  224  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2477  hypothetical protein  43.02 
 
 
273 aa  219  9e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2008  diguanylate cyclase  35.12 
 
 
574 aa  214  5e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1689  diguanylate cyclase  35.12 
 
 
574 aa  212  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1298  diguanylate cyclase  38.84 
 
 
576 aa  209  2e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.135306  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1315  diguanylate cyclase  34.65 
 
 
608 aa  205  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.243862  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1169  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.04 
 
 
596 aa  195  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0126253 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4588  diguanylate cyclase  33.85 
 
 
613 aa  189  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0646445  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1457  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  31.43 
 
 
624 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.659998  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0825  diguanylate cyclase  32.18 
 
 
594 aa  176  1e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1431  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  30.49 
 
 
625 aa  175  3e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  41.45 
 
 
545 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.99 
 
 
675 aa  170  9e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  7.98179e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1298  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.99 
 
 
353 aa  169  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.0214e-05  hitchhiker  0.00354722 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1650  sensory box protein  50.71 
 
 
819 aa  167  4e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00487383  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0349  diguanylate cyclase  32 
 
 
523 aa  167  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.291431  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4748  diguanylate cyclase  48.57 
 
 
377 aa  166  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2350  putative PAS/PAC sensor protein  33.04 
 
 
450 aa  166  1e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1282  diguanylate cyclase with GAF sensor  30.86 
 
 
550 aa  166  1e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000101268  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1171  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.35 
 
 
916 aa  164  3e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2544  diguanylate cyclase  47.67 
 
 
398 aa  163  9e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.871243  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1885  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.39 
 
 
558 aa  162  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  48.26 
 
 
721 aa  162  3e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3860  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.01 
 
 
520 aa  160  8e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1221  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  50.99 
 
 
532 aa  160  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3508  diguanylate cyclase  44.57 
 
 
638 aa  159  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0970585 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2258  diguanylate cyclase  36.25 
 
 
353 aa  157  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.22425e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1870  GGDEF domain-containing protein  28.96 
 
 
342 aa  157  9e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1614  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.51 
 
 
531 aa  156  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.423577 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4169  ATPase domain-containing protein  36.24 
 
 
435 aa  154  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0180001  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4538  histidine kinase  36.24 
 
 
417 aa  154  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4930  diguanylate cyclase  33.72 
 
 
530 aa  154  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.22973 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2731  diguanylate cyclase  30.72 
 
 
714 aa  153  9e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3745  diguanylate cyclase  30.47 
 
 
681 aa  153  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.96 
 
 
499 aa  151  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4682  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.25 
 
 
424 aa  151  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.266378  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2704  diguanylate cyclase with GAF sensor  31.98 
 
 
494 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0570321  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3430  diguanylate cyclase  37.61 
 
 
513 aa  148  4e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1202  diguanylate cyclase  34.2 
 
 
356 aa  147  4e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0240122  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0895  GAF domain/GGDEF domain-containing protein  30.99 
 
 
688 aa  148  4e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0507  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.91 
 
 
557 aa  147  7e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3072  diguanylate cyclase  34.2 
 
 
356 aa  146  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.86718e-10 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0662  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.14 
 
 
918 aa  145  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0359693 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0466  diguanylate cyclase  35.81 
 
 
320 aa  144  5e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.02 
 
 
843 aa  144  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0241  diguanylate cyclase  36.53 
 
 
640 aa  143  8e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2721  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.33 
 
 
686 aa  143  1e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.53529  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3835  diguanylate cyclase  44.39 
 
 
316 aa  143  1e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  48.1 
 
 
493 aa  142  1e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5118  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.41 
 
 
837 aa  142  2e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.657918 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1719  diguanylate cyclase with GAF sensor  33.2 
 
 
563 aa  141  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4311  diguanylate cyclase  48.1 
 
 
493 aa  141  4e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.245548  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2106  diguanylate cyclase  34.11 
 
 
720 aa  140  5e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  32.05 
 
 
498 aa  140  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0509  diguanylate cyclase  33.21 
 
 
498 aa  140  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480754 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2189  diguanylate cyclase with GAF sensor  36.24 
 
 
415 aa  140  8e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2380  diguanylate cyclase  41.86 
 
 
410 aa  140  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0195  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.93 
 
 
309 aa  139  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0106599  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0620  diguanylate cyclase  31.49 
 
 
517 aa  139  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089586 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2240  diguanylate cyclase  34.96 
 
 
758 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.365812 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1148  diguanylate cyclase  33.59 
 
 
634 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0203006  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1387  cyclic nucleotide-binding protein  43.21 
 
 
320 aa  139  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000243824  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1805  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  27.52 
 
 
960 aa  139  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08240  GGDEF domain protein  46.39 
 
 
448 aa  139  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2169  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.36 
 
 
713 aa  139  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1753  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.21 
 
 
1073 aa  139  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2048  diguanylate cyclase with GAF sensor  38.36 
 
 
704 aa  138  3e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1658  diguanylate cyclase  40.57 
 
 
354 aa  138  3e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.287196  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0207  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.93 
 
 
772 aa  138  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.53871  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2322  diguanylate cyclase  41.14 
 
 
354 aa  138  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3846  diguanylate cyclase  40.98 
 
 
405 aa  137  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0680  diguanylate cyclase  43.58 
 
 
466 aa  138  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1741  diguanylate cyclase  34.2 
 
 
374 aa  137  6e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.564976  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  36.71 
 
 
343 aa  137  6e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1484  diguanylate cyclase  36.16 
 
 
615 aa  137  7e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1306  diguanylate cyclase  33.77 
 
 
615 aa  137  7e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.550913  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1817  GGDEF family protein  40.53 
 
 
512 aa  137  7e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  45.71 
 
 
418 aa  137  9e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1228  diguanylate cyclase  44.64 
 
 
490 aa  136  1e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>