More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1260 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  100 
 
 		 397 aa  771    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  46.39 
 
 		 429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  43 
 
 		 422 aa  293  3e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  46.51 
 
 		 404 aa  289  6e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  43.58 
 
 		 387 aa  277  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  43.85 
 
 		 401 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  41.44 
 
 		 400 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  40.52 
 
 		 401 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  40.59 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  40.05 
 
 		 393 aa  243  3e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  37.93 
 
 		 391 aa  237  2e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  38.92 
 
 		 396 aa  238  2e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  39.73 
 
 		 420 aa  236  6e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  38.44 
 
 		 389 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  36.17 
 
 		 402 aa  226  6e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  39.95 
 
 		 418 aa  223  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  35.71 
 
 		 395 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  36.81 
 
 		 410 aa  209  8e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  35.88 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  35.86 
 
 		 406 aa  201  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  30.14 
 
 		 402 aa  200  5e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  34.32 
 
 		 396 aa  196  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  35.41 
 
 		 503 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  32.97 
 
 		 395 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  36.24 
 
 		 408 aa  192  6e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  31.52 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  28.03 
 
 		 408 aa  187  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  36.16 
 
 		 405 aa  186  7e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  34.05 
 
 		 395 aa  186  8e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  35.42 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  28.39 
 
 		 407 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  34.29 
 
 		 418 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  27.53 
 
 		 399 aa  182  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  30.48 
 
 		 409 aa  180  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  35.16 
 
 		 395 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  37.11 
 
 		 390 aa  177  3e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  29.84 
 
 		 401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  34.84 
 
 		 392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  30.59 
 
 		 395 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  33.07 
 
 		 403 aa  173  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  32.72 
 
 		 389 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  29.26 
 
 		 397 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  26.26 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  32.35 
 
 		 405 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  28.39 
 
 		 404 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  36.14 
 
 		 392 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  33.51 
 
 		 396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  35.59 
 
 		 410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  33.24 
 
 		 393 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  31.56 
 
 		 420 aa  165  2.0000000000000002e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  26.22 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  33.67 
 
 		 409 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  31.33 
 
 		 408 aa  163  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.87 
 
 		 391 aa  162  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  29.62 
 
 		 414 aa  162  7e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.38 
 
 		 408 aa  162  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  27.39 
 
 		 399 aa  162  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  31.09 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  31.96 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  32.27 
 
 		 405 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  31.11 
 
 		 320 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  31.42 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  27.79 
 
 		 400 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  31.13 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  31.68 
 
 		 381 aa  157  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  33.42 
 
 		 414 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.48 
 
 		 315 aa  156  6e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.48 
 
 		 315 aa  156  6e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  35.06 
 
 		 389 aa  156  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  34.44 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  30.85 
 
 		 381 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  33.16 
 
 		 410 aa  155  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  32.49 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  27.34 
 
 		 410 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  30.25 
 
 		 386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  34.12 
 
 		 374 aa  153  5e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  33.07 
 
 		 443 aa  152  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  27.17 
 
 		 364 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  31.52 
 
 		 389 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  34.01 
 
 		 397 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  32.09 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  26.58 
 
 		 383 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  30.91 
 
 		 427 aa  150  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  30.34 
 
 		 380 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  34.7 
 
 		 425 aa  149  6e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  28.97 
 
 		 399 aa  149  7e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  31.3 
 
 		 347 aa  149  8e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  27.61 
 
 		 396 aa  149  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  32.29 
 
 		 322 aa  149  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  34.7 
 
 		 425 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  25.91 
 
 		 406 aa  148  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  34.3 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  26.87 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  26.87 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  26.87 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  26.87 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  35.13 
 
 		 425 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  26.87 
 
 		 406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  32.72 
 
 		 398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>