223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10210 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  100 
 
 		 272 aa  548  1e-155  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  62.45 
 
 		 246 aa  317  1e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 218 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 268 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 230 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  23.99 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 214 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 221 aa  64.7  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 211 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 223 aa  64.3  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 239 aa  62  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  22.78 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  23.85 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 237 aa  57.4  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  23.45 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  44.83 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  23.65 
 
 		 343 aa  55.5  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 210 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 223 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 222 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 283 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 239 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  22.27 
 
 		 272 aa  53.1  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 225 aa  52.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  51.02 
 
 		 203 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  25.39 
 
 		 225 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 218 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  25.39 
 
 		 225 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  25.39 
 
 		 225 aa  52.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 228 aa  52.4  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1210  regulatory protein, TetR  33.72 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  22.71 
 
 		 263 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 216 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 221 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 210 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 223 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 235 aa  50.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  43.08 
 
 		 250 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 220 aa  49.7  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 310 aa  49.7  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 255 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 223 aa  49.3  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 226 aa  49.3  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1702  regulatory protein TetR  40.58 
 
 		 199 aa  48.9  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 173 aa  48.9  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  22.05 
 
 		 258 aa  48.5  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  22.61 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  24.63 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 202 aa  48.5  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  23.02 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 199 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 195 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 185 aa  47.4  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 267 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 268 aa  47.8  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  41.18 
 
 		 315 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 238 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  36.07 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  24.25 
 
 		 231 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  21.89 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 211 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 206 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 253 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 206 aa  47.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 218 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>