More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3185 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  429  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 202 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  37.81 
 
 		 220 aa  131  6e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 213 aa  131  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  37.76 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 210 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 225 aa  127  9.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  35.42 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 210 aa  122  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 212 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  34.5 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 231 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 211 aa  118  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  34.5 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 213 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 213 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 213 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  37.31 
 
 		 207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  37.19 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  37.13 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 210 aa  112  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  37.88 
 
 		 205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 211 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5949  transcriptional regulator TetR family  32 
 
 		 250 aa  112  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 204 aa  111  6e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 209 aa  111  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 207 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 207 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  36.6 
 
 		 208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 207 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 244 aa  108  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 259 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 220 aa  107  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  36.1 
 
 		 212 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  33.84 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  32.64 
 
 		 230 aa  105  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 216 aa  105  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 226 aa  105  7e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 208 aa  104  9e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 212 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 210 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 207 aa  102  6e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 209 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  33.17 
 
 		 217 aa  99.8  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 211 aa  99  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  28.71 
 
 		 251 aa  99  5e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  30.46 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 220 aa  95.5  5e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 207 aa  94.4  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  32.8 
 
 		 213 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 216 aa  93.6  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 251 aa  92.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 248 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 224 aa  92  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1187  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 221 aa  91.7  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.49367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  29.69 
 
 		 201 aa  89.4  3e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 204 aa  88.6  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
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NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 206 aa  88.2  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 222 aa  87.8  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 198 aa  87.8  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 207 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_1059  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 230 aa  87  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
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NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
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NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 228 aa  85.5  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
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NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 215 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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