189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8791 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 215 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0821  2'-5' RNA ligase  38.6 
 
 		 188 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  33.48 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  37.16 
 
 		 190 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  43.5 
 
 		 184 aa  91.7  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0826  2'-5' RNA ligase  36.24 
 
 		 187 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0243  2',5' RNA ligase  35.91 
 
 		 182 aa  86.3  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.938124  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7219  2'-5' RNA ligase  38.92 
 
 		 224 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.179856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  40 
 
 		 196 aa  84.7  8e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2912  2'-5' RNA ligase  39.72 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  39.04 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  33.7 
 
 		 188 aa  82  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  34.29 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1628  2'-5' RNA ligase  37.78 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.709746 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  28.47 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  29.58 
 
 		 189 aa  76.3  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1320  2'-5' RNA ligase  39.71 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.167347  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  34.7 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17160  2'-5' RNA ligase  32.98 
 
 		 196 aa  73.9  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0177806  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0420  2'-5' RNA ligase  28.96 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.451277 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  28.9 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  34.04 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  33.09 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  33.14 
 
 		 180 aa  68.9  0.00000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  31.5 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  29.14 
 
 		 176 aa  67.4  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0528  2',5' RNA ligase  36.42 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  38.03 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  28.49 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  28.65 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  34.44 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  28.26 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  35 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0088  2',5' RNA ligase  44.21 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.531948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  28.28 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  34.31 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  35.51 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  33.09 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  31.91 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  37.5 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4995  2'-5' RNA ligase  40.78 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14670  2'-5' RNA ligase  36.72 
 
 		 176 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.346276  normal  0.71286 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  30.13 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  24.64 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  28.47 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  31.62 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0679  2'-5' RNA ligase  30.94 
 
 		 192 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  26.04 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  38.19 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  35 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  26.32 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  31.88 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02479  3'-5' RNA ligase  26.8 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  27.61 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  31.88 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  29.85 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  29.52 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  32.8 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  26.12 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4364  2'-5' RNA ligase  35.77 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  32.35 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  32.64 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3995  2'-5' RNA ligase  37.93 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0173651  normal  0.591095 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  26.28 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  31.29 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  26.45 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  30.56 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2113  2'-5' RNA ligase  30.99 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0440288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4476  2'-5' RNA ligase  35.77 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19240  2'-5' RNA ligase  32.39 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0390929 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  33.88 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  25.36 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  31.88 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  23.91 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  33.16 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1013  2'-5' RNA ligase  29.27 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.184793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  34.72 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  25.93 
 
 		 182 aa  56.6  0.0000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  34.29 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1881  2'-5' RNA ligase  36.88 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1029  2'-5' RNA ligase  28 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00469  2,5 RNA ligase  33.7 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  23.36 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  27.74 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0417  2',5' RNA ligase  34.82 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.347882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  33.09 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  25.52 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  26.57 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  34.27 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  27.61 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  36.11 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  34.48 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3349  2'-5' RNA ligase  34.72 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  29.79 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  34.27 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  34.27 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  27.01 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>