More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3604 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  57.79 
 
 		 984 aa  800    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  57.97 
 
 		 900 aa  843    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3368  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  52.84 
 
 		 919 aa  705    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00223117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0729  glycoside hydrolase family 48  54.36 
 
 		 722 aa  729    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000900741  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1857  glycoside hydrolase family 48  58.15 
 
 		 1478 aa  754    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00499056  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1134  glycoside hydrolase family 48  61.29 
 
 		 842 aa  813    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  67.06 
 
 		 1121 aa  1019    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  100 
 
 		 973 aa  1933    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0071  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  49.62 
 
 		 938 aa  644    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2089  glycoside hydrolase family protein  50.59 
 
 		 741 aa  642    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000609917  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  61.03 
 
 		 785 aa  822    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  59.15 
 
 		 966 aa  777    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  57.95 
 
 		 854 aa  780    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  59.24 
 
 		 974 aa  818    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1860  glycoside hydrolase family 48  58.15 
 
 		 1904 aa  749    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.738055  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1867  glycoside hydrolase family 48  58.15 
 
 		 1759 aa  753    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.217559  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  59.03 
 
 		 963 aa  796    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0295  glycoside hydrolase family protein  61.44 
 
 		 854 aa  791    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.271703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  62.78 
 
 		 979 aa  846    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2448  glycoside hydrolase family 48  57.38 
 
 		 894 aa  790    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  62.76 
 
 		 743 aa  325  2e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  63.45 
 
 		 608 aa  214  7.999999999999999e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  62.62 
 
 		 460 aa  188  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  52.91 
 
 		 1137 aa  183  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  47.89 
 
 		 847 aa  155  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  45.3 
 
 		 6885 aa  151  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6974  cellulose-binding family II  41.69 
 
 		 938 aa  151  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  48.98 
 
 		 2170 aa  151  6e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  40.27 
 
 		 455 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  46.81 
 
 		 1887 aa  134  6e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5296  hypothetical protein  36.22 
 
 		 385 aa  134  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.713748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  48.26 
 
 		 978 aa  133  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  45.41 
 
 		 681 aa  133  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  51.43 
 
 		 561 aa  133  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  38.74 
 
 		 459 aa  133  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  44.13 
 
 		 543 aa  132  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 455 aa  132  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  41.58 
 
 		 458 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.35 
 
 		 998 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  47.5 
 
 		 649 aa  131  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  43.94 
 
 		 880 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  40.53 
 
 		 455 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  40.53 
 
 		 455 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  40.84 
 
 		 456 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  62.38 
 
 		 562 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  50 
 
 		 1448 aa  130  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  44.07 
 
 		 680 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  38.46 
 
 		 455 aa  130  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  41.05 
 
 		 458 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  64.36 
 
 		 1209 aa  129  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  38.39 
 
 		 455 aa  128  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  38.39 
 
 		 455 aa  128  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  65.35 
 
 		 763 aa  127  9e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  39.47 
 
 		 455 aa  125  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  46.93 
 
 		 727 aa  125  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  39.27 
 
 		 456 aa  125  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  38.03 
 
 		 455 aa  124  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  61.54 
 
 		 403 aa  124  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  42.44 
 
 		 762 aa  124  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  37.56 
 
 		 455 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  40.3 
 
 		 1007 aa  124  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  41.26 
 
 		 658 aa  123  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  44.2 
 
 		 445 aa  122  3e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  46.77 
 
 		 429 aa  122  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  38.97 
 
 		 455 aa  120  9e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  44.97 
 
 		 809 aa  120  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  43.85 
 
 		 637 aa  118  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  45.6 
 
 		 854 aa  117  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  44.5 
 
 		 655 aa  115  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  39.11 
 
 		 674 aa  115  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  39.11 
 
 		 674 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  39.66 
 
 		 674 aa  114  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  64.04 
 
 		 1298 aa  114  1.0000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  38.55 
 
 		 674 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  38.55 
 
 		 674 aa  111  6e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  38.55 
 
 		 674 aa  111  6e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  39.66 
 
 		 674 aa  111  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  38.55 
 
 		 674 aa  111  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  40.22 
 
 		 674 aa  111  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  37.99 
 
 		 674 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  38.52 
 
 		 768 aa  110  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.58 
 
 		 729 aa  110  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  39.62 
 
 		 523 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  42.08 
 
 		 543 aa  108  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  61.96 
 
 		 436 aa  107  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  37.76 
 
 		 2286 aa  103  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  40.56 
 
 		 674 aa  103  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  37.5 
 
 		 438 aa  103  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  34.17 
 
 		 598 aa  101  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  38.04 
 
 		 803 aa  101  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  41.58 
 
 		 1004 aa  100  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  51.52 
 
 		 474 aa  100  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  51.09 
 
 		 628 aa  100  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  54.35 
 
 		 688 aa  100  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  55.56 
 
 		 494 aa  100  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  57.61 
 
 		 775 aa  99.4  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4962  glycoside hydrolase family 10  53.26 
 
 		 778 aa  98.2  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.59486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  44.31 
 
 		 997 aa  98.2  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  35.39 
 
 		 703 aa  96.7  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  33.64 
 
 		 465 aa  95.5  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>