More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0747 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



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Plasmid unclonability p-value
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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  426  1e-118  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0533  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 208 aa  99.4  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0518509 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  33.84 
 
 		 216 aa  97.1  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 234 aa  93.6  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 207 aa  92  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 208 aa  88.2  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 212 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  31.5 
 
 		 213 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  32.95 
 
 		 213 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2049  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 198 aa  84.7  9e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 210 aa  84.3  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  26.2 
 
 		 207 aa  84  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1511  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  26.2 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 207 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 220 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 251 aa  78.2  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2443  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 237 aa  77.8  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0506357 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  26.94 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 209 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
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NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 218 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1447  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.268108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 216 aa  75.1  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 259 aa  74.7  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  28.75 
 
 		 219 aa  74.3  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 213 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3113  TetR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 214 aa  73.6  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.527228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
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NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 213 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 225 aa  71.2  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5246  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4201  hypothetical protein  25.65 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6189  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.304814  normal  0.805788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2537  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2606  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193859  normal  0.0512709 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 219 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3466  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 245 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  27.69 
 
 		 230 aa  68.6  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 209 aa  68.6  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  24.47 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  24.21 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 210 aa  67  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  26.84 
 
 		 226 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
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NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  23.28 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
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NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
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NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  25.24 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
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NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009714  CHAB381_0566  transcription regulator protein  26 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.000000411686  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  25.37 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  23.4 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
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NC_009484  Acry_0093  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.247373  n/a   
 
 
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NC_010172  Mext_3623  regulatory protein TetR  27.93 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.755125  normal  1 
 
 
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NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  25.96 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
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