More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1053 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  100 
 
 		 462 aa  920    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1497  MATE efflux family protein  35.73 
 
 		 460 aa  297  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00584213  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1822  MATE efflux family protein  36.53 
 
 		 440 aa  289  7e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.286977  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0577  Na+-driven multidrug efflux pump  33.56 
 
 		 454 aa  282  1e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00131825  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5639  MATE efflux family protein  34.22 
 
 		 450 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.75001  normal  0.399325 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1081  MATE efflux family protein  31.76 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000165796  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  33.63 
 
 		 455 aa  248  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  35.6 
 
 		 447 aa  244  3e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0383  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 451 aa  243  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.504119  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0393  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 451 aa  243  6e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.530968  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1575  hypothetical protein  32.59 
 
 		 459 aa  242  1e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195902  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  34.38 
 
 		 447 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  34.69 
 
 		 449 aa  229  9e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 477 aa  228  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0006  MATE efflux family protein  31.43 
 
 		 442 aa  225  1e-57  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0243937 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1577  MATE efflux family protein  34.32 
 
 		 447 aa  223  4e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.283423  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0827  MATE efflux family protein  30.85 
 
 		 452 aa  221  1.9999999999999999e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1446  MATE efflux family protein  31.54 
 
 		 439 aa  220  3.9999999999999997e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.484247 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2651  MATE efflux family protein  32.81 
 
 		 449 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000524124  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1409  MATE efflux family protein  32.69 
 
 		 460 aa  212  9e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.851568  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11870  putative efflux protein, MATE family  29.76 
 
 		 485 aa  209  7e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3319  MATE efflux family protein  31.54 
 
 		 460 aa  208  1e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00330578  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1225  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 452 aa  208  2e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1218  Na+ driven multidrug efflux pump  32.1 
 
 		 464 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.530621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  31.64 
 
 		 454 aa  206  7e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0313  hypothetical protein  31.92 
 
 		 455 aa  206  8e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00088835  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1796  MATE efflux family protein  30.49 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  unclonable  0.00000000911844 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  31.4 
 
 		 456 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  30.09 
 
 		 460 aa  200  3.9999999999999996e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  29.98 
 
 		 454 aa  199  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2080  MATE efflux family protein  29.59 
 
 		 454 aa  195  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.634791 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03665  C-5 cytosine-specific DNA methylase:Multi antimicrobial extrusion (MatE) protein  31.45 
 
 		 455 aa  196  1e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1813  MATE efflux family protein  28.48 
 
 		 461 aa  194  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  unclonable  0.000000145997  normal  0.0820418 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0350  MATE efflux family protein  30.37 
 
 		 455 aa  195  2e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1483  MATE efflux family protein  31.79 
 
 		 456 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0111  MATE efflux family protein  32.02 
 
 		 464 aa  192  7e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2656  MATE efflux family protein  30.44 
 
 		 455 aa  189  7e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000320959  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0400  MATE efflux family protein  29.87 
 
 		 456 aa  188  1e-46  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.163354 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1204  MATE efflux family protein  29.69 
 
 		 461 aa  187  4e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1800  MATE efflux family protein  29.44 
 
 		 455 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0582  MATE efflux family protein  30.07 
 
 		 466 aa  176  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  28.66 
 
 		 455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  28.94 
 
 		 455 aa  173  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2869  MATE efflux family protein  29.33 
 
 		 451 aa  172  7.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000172656  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2060  MATE efflux family protein  29 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000022927  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0814  MATE efflux family protein subfamily  31.32 
 
 		 451 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0013446  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  27.7 
 
 		 468 aa  171  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  28.23 
 
 		 460 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2347  MATE efflux family protein  26.34 
 
 		 466 aa  166  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000304243  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0333  MATE efflux family protein  28.45 
 
 		 451 aa  166  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0189347  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2964  MATE efflux family protein  26.97 
 
 		 453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  31.69 
 
 		 437 aa  166  9e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  31.95 
 
 		 437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0835  Na+-driven multidrug efflux pump  26.87 
 
 		 452 aa  164  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.552719  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02070  putative efflux protein, MATE family  25.74 
 
 		 496 aa  164  4.0000000000000004e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  29.74 
 
 		 461 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1166  MATE efflux family protein  28.01 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  30.44 
 
 		 485 aa  161  3e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2827  MATE efflux family protein  30.38 
 
 		 451 aa  160  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.658448  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1569  MATE efflux family protein  23.78 
 
 		 493 aa  159  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.144103 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2890  MATE efflux family protein  27.61 
 
 		 466 aa  157  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.831923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  27.79 
 
 		 460 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  28.54 
 
 		 454 aa  155  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1448  MATE efflux family protein  27.25 
 
 		 470 aa  155  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  27.23 
 
 		 478 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1171  MATE efflux family protein  28.03 
 
 		 457 aa  154  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  27.62 
 
 		 462 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1959  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.23 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.849908  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0849  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0255  MATE efflux family protein  26.21 
 
 		 448 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.392054  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3704  hypothetical protein  25.95 
 
 		 496 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.546893 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02200  Na+-driven multidrug efflux pump  24.57 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 455 aa  147  3e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1582  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.84 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200155  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2612  MATE efflux family protein  28.08 
 
 		 459 aa  147  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1593  MATE efflux family protein  27.05 
 
 		 460 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000199125  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3321  MATE efflux family protein  27.17 
 
 		 489 aa  144  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0635825 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2888  MATE efflux family protein  28.36 
 
 		 462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238453  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1486  Na+ driven multidrug efflux pump  24.94 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  27.65 
 
 		 453 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1709  putative MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 451 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1524  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 451 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.942742  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1496  Na+ driven multidrug efflux pump  24.72 
 
 		 451 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00660126  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1642  MATE efflux family protein  24.72 
 
 		 451 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1463  MATE efflux family protein  27.33 
 
 		 440 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1754  multi anti extrusion protein MatE  26.5 
 
 		 452 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  0.069865 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1732  MATE efflux family protein, putative  23.82 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0426272  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1678  putative MATE efflux family protein  24.33 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131479  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  25.33 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1783  putative MATE efflux family protein  24.11 
 
 		 451 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3207  putative transmembrane efflux protein  28.53 
 
 		 467 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00227095 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  26.67 
 
 		 463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03390  multidrug efflux pump VmrA  25.4 
 
 		 448 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0548  MATE efflux family protein  28.41 
 
 		 459 aa  137  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.0000824418  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1735  MATE efflux family protein  27.72 
 
 		 442 aa  137  5e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00244827  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3666  putative MATE efflux family protein  24.36 
 
 		 451 aa  137  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.269496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1528  MATE efflux family protein  23.66 
 
 		 452 aa  137  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0181  multidrug efflux pump VmrA  23.71 
 
 		 446 aa  137  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2975  multidrug efflux pump VmrA  25.85 
 
 		 459 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0592966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2111  MATE efflux family protein  25.11 
 
 		 505 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>